Лизин-специфическая гистоновая деметилаза 1A ( LSD1), также известная как лизин (K) -специфическая деметилаза 1A (KD M1A) представляет собой белок у человека, который кодируется геном KDM1A . LSD1 представляет собой флавин -зависимую моноаминоксидазу, которая может деметилировать моно- и диметилированные лизины, в частности гистон 3, лизины 4 и 9 (H3K4 и H3K9). Этот фермент может играть решающую роль в эмбриогенезе и тканеспецифической дифференцировке, а также в росте ооцитов. KDM1A была первой гистоновой деметилазой, которая была обнаружена, хотя было описано более 30.
Этот ген кодирует ядерный белок, содержащий домен SWIRM, FAD -связывающий мотив и аминоксидазный домен. Этот белок является компонентом нескольких комплексов гистондеацетилазы, хотя он подавляет гены, действуя как гистон-деметилаза.
LSD1 (лизин-специфическая деметилаза 1), также известная как KDM1, является первой из нескольких обнаруженных протеин лизин деметилаз. Посредством FAD-зависимой окислительной реакции LSD1 специфически удаляет гистон H3K4me2 в H3K4me1 или H3K4me0. При образовании комплекса с рецептором андрогена (и, возможно, с другими рецепторами ядерных гормонов ) LSD1 меняет свои субстраты на H3K9me2. Теперь известно, что комплекс LSD1 опосредует скоординированное переключение модификации гистона посредством ферментативной активности, а также считывателей модификаций гистона в комплексе.
Функцию гена KDM1A можно эффективно изучить с помощью нокдауна siRNA на основе независимой проверки.
KDM1A имеет много разных партнеров по связыванию, которые могут быть необходимы для его деметилирования деятельность. При остром миелоидном лейкозе (AML) было окончательно продемонстрировано, что GFI1B поддерживает взаимодействие с KDM1A, необходимое для распространения заболевания.
KDM1A, по-видимому, играет важную роль в эпигенетическое «перепрограммирование», которое происходит, когда сперматозоид и яйцеклетка соединяются, образуя зиготу. Делеция гена KDM1A может оказывать влияние на рост и дифференцировку эмбриональных стволовых клеток. Делеция в эмбрионах мыши летальна; эмбрионы не развиваются после 7,5 дня. Считается, что KDM1A также играет роль в развитии рака, поскольку более неблагоприятные исходы могут быть коррелированы с более высокой экспрессией этого гена. Следовательно, ингибирование KDM1A может быть возможным лечением рака.
Мутации de novo в KDM1A были зарегистрированы у трех пациентов, у каждого из которых была задержка развития, которая, как полагают, частично объясняется мутации. Все задокументированные мутации представляют собой миссенс-замены. Одна из пострадавших семей создала общедоступный веб-сайт для выявления других случаев.
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.
.