Войти
 | |
| Имена | |
|---|---|
| Другое названия Циклический дигуанилат; 3 ', 5'-циклическая дигуаниловая кислота; ц-ди-GMP; 5GP-5GP | |
| Идентификаторы | |
| Номер CAS | |
| 3D-модель (JSmol ) | |
| ChemSpider | |
| PubChem CID | |
| Панель управления CompTox (EPA ) | |
InChI
| |
УЛЫБКИ
| |
| Свойства | |
| Химическая формула | C20H24N10O14P2 |
| Молярная масса | 690,09 г / моль |
| Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа). | |
 N (что такое ?) | |
| Ссылки на инфобокс | |
Циклический ди-GMP (также называемый циклический дигуанилат и c-di-GMP ) является вторым мессенджером используется для трансдукции сигнала у широкого круга бактерий. Циклический ди-GMP, как известно, не используется архей и наблюдался только у эукариот в Dictyostelium. Биологическая роль циклического ди-GMP была впервые раскрыта, когда он был идентифицирован как аллостерический активатор целлюлозосинтазы, обнаруженной в Gluconacetobacter xylinus, для производства микробной целлюлозы.
По своей структуре это цикл, содержащий только два основания гуанина, связанных рибозой и фосфатом.
. В бактериях определенные сигналы передаются посредством синтеза или разложения циклического ди-GMP. Циклический ди-GMP синтезируется белками с активностью дигуанилатциклазы. Эти белки обычно имеют характерный мотив GGDEF, который относится к консервативной последовательности из пяти аминокислот. На деградацию циклического ди-GMP влияют белки с активностью фосфодиэстеразы. Эти белки имеют аминокислотный мотив EAL или HD-GYP. Процессы, которые, как известно, регулируются циклическим ди-GMP, по крайней мере, у некоторых организмов, включают образование биопленки, подвижность и выработку фактора вирулентности.
Уровни циклического ди-GMP регулируются с помощью множества механизмов. Многие белки с доменами GGDEF, EAL или HD-GYP обнаруживаются с другими доменами, которые могут принимать сигналы, такими как домены PAS. Считается, что ферменты, которые разлагают или синтезируют циклический ди-GMP, локализованы в определенных областях клетки, где они влияют на приемники в ограниченном пространстве. У Gluconacetobacter xylinus c-di-GMP стимулирует полимеризацию глюкозы в целлюлозу в качестве аллостерического активатора с высоким сродством фермента целлюлозосинтазы. Некоторые ферменты дигуанилатциклазы аллостерически ингибируются циклическим ди-GMP.
Циклические уровни ди-GMP регулируют другие процессы с помощью ряда механизмов. Синтаза целлюлозы Gluconacetobacter xylinus аллостерически стимулируется циклическим ди-GMP, представляя механизм, с помощью которого циклический ди-GMP может регулировать активность целлюлозосинтазы. Было показано, что домен PilZ связывает циклический ди-GMP и, как полагают, участвует в циклической ди-GMP-зависимой регуляции, но механизм, с помощью которого он это делает, неизвестен. Недавние структурные исследования доменов PilZ от двух видов бактерий показали, что домены PilZ резко изменяют конформацию при связывании с циклическим ди-GMP. Это приводит к сильному выводу, что конформационные изменения в доменах PilZ позволяют регулировать активность целевых эффекторных белков (таких как целлюлозосинтаза) с помощью циклического ди-GMP. Рибопереключатели, называемые циклический ди-GMP-I рибопереключатель и циклический ди-GMP-II рибопереключатель, регулируют экспрессию генов в ответ на концентрации циклического ди-GMP в различных бактерий, но не всех бактерий, которые, как известно, используют циклический ди-GMP.
