Коллаген, тип XVII, альфа 1

редактировать
COL17A1
Идентификаторы
Псевдонимы COL17A1, BA16H23.2, BP180, BPA-2, BPAG2, LAD-1, ERED, тип коллагена XVII альфа 1, цепь коллагена XVII альфа 1
Внешние идентификаторыOMIM: 113811 HomoloGene: 133558 Генные карты: COL17A1
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человека)
Chr. Хромосома 10 (человек)
Хромосома 10 (человека) Местоположение генома для COL17A1 Местоположение генома для COL17A1
Полоса 10q25.1Начало104,031,286 bp
конец104,085,880 bp
экспрессия РНК образец
PBB GE COL17A1 204636 в fs.png
Дополнительные справочные данные по экспрессии
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

1308

н / д

Ensembl

ENSG00000065618

н / д

UniProt

Q9UMD9

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_130778. NM_000494

н / д

RefSeq (белок)

NP_000485

н / д

Расположение (UCSC)Chr 10: 104,03 - 104,09 Мб н / д
PubMed поискн / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Коллаген XVII, ранее назывался BP180, представляет собой трансмембранный белок, который играет решающую роль в поддержании связи между внутриклеточными и внеклеточными структурными элементами, участвующими в эпидермальной адгезии, т.е. идентифицирован Диазом и его коллегами в 1990 году.

COL17A1 - официальное название гена. Он кодирует альфа-цепь коллагена XVII типа. Коллаген XVII представляет собой трансмембранный белок, подобный коллагену XIII, XXIII и XXV. Коллаген XVII является структурным компонентом гемидесмосом, мультибелковых комплексов в зоне дермально-эпидермальной базальной мембраны, которые опосредуют адгезию кератиноцитов к подлежащей мембране. Он также, по-видимому, является ключевым белком в поддержании целостности роговицы эпителия. Мутации в этом гене связаны как с генерализованным атрофическим доброкачественным, так и с узловым буллезным эпидермолизом, а также с рецидивирующими эрозиями роговицы, и экспрессия этого гена аномальна при различных видах рака. Существуют две гомотримерные формы коллагена типа XVII. Полноразмерная форма - это трансмембранный белок. Растворимая форма, называемая эктодоменом или LAD-1, генерируется протеолитическим процессингом полноразмерной формы.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Патология
  • 3 Рак
  • 4 Шеддинг
  • 5 SPARC и несовершенный остеогенез
  • 6 Взаимодействия
  • 7 См. Также
  • 8 Ссылки
  • 9 Дополнительная литература
Структура

Коллаген XVII - гомотример трех альфа1 (XVII) -цепи и трансмембранный белок в ориентации типа II. Каждая α-цепь 180 кДа содержит глобулярный внутриклеточный домен размером примерно 70 кДа, который взаимодействует с бета4- интегрином, плектином и BP230 и необходим для стабильного прикрепления от гемидесмосом до кератиновых промежуточных филаментов. Большой С-концевой эктодомен с молекулярной массой приблизительно 120 кДа состоит из 15 коллагеновых субдоменов, характеризующихся типичными коллагеновыми последовательностями повторов G-X-Y, фланкированных 16 короткими неколлагеновыми участками. Общая структура эктодомена представляет собой гибкую стержнеобразную тройную спираль со значительной термической стабильностью. Мембранная проксимальная часть эктодомена, в пределах аминокислот 506-519, отвечает за связывание с интегрином альфа-6, это связывание, по-видимому, важно для интеграции коллагена XVII в гемидесмосомы (необходима цитата). Самый большой коллагеновый домен, Col15, который содержит 232 аминокислоты (аминокислоты 567-808), вносит значительный вклад в стабильность гомотримера коллагена XVII. С-конец коллагена XVII связывается с ламинином 5, и для правильной интеграции ламинина 5 в матрикс необходим коллаген XVII.

Патология

Мутации в гене человеческого коллагена XVII, COL17A1, приводят к отсутствию или структурным изменениям и мутациям коллагена XVII. Функциональные последствия включают уменьшение адгезии эпидермиса и образование пузырей на коже в ответ на минимальные усилия сдвига. Заболевание, вызванное двуаллельными мутациями COL17A1, называется узловым буллезным эпидермолизом, аутосомно-рецессивным заболеванием кожи с различными клиническими фенотипами. Морфологические характеристики буллезного узлового эпидермолиза - рудиментарные гемидесмосомы и разделение субэпидермальных тканей. Клинические признаки, помимо волдырей и эрозий на коже и слизистых оболочках, включают дистрофию ногтей, выпадение волос и аномалии зубов.

Коллаген XVII также играет роль аутоантигена в буллезном пемфигоиде (BP) и гестационном герпесе (HG), обоих приобретенных субэпителиальных нарушениях образования пузырей. Большинство иммунодоминантных эпитопов находятся в домене NC16A, и связывание аутоантител нарушает адгезивные функции коллагена XVII, и это (вместе с процессами, связанными с воспалением) приводит к эпидермально-дермальному разделению и образованию пузырей на коже.

Другое мутации делают эпителий роговицы глаза ломким, что приводит к доминантно наследуемому (ERED). Секвенирование всего экзома впервые выявило гетерозиготную мутацию (c.2816C>T, p.T939I), которая отделилась от ERED в большой шведской родословной, насчитывающей 200 лет. Другая синонимичная мутация (c.3156C>T) была предложена для введения скрытого донорского сайта, что привело к аберрантному сплайсингу, теория, которая впоследствии была подтверждена в нескольких семьях с ERED из разных стран..

Рак

Экспрессия гена COL17A1 аномальна при различных раковых заболеваниях. Например, он был обнаружен ненормальным при пяти типах эпителиального рака, включая рак груди, рак шейки матки, рак головы и шеи и два типа рака легких. Сниженная экспрессия наблюдалась для рака шейки матки, в то время как повышенная экспрессия наблюдалась для других видов рака.

Выделение

Коллаген XVII конститутивно выделяется с поверхности кератиноцитов в домене NC16A посредством TACE (TNF-Alpha Converting Enzyme), металлопротеиназа семейства ADAM. Выделение зависит от липидного рафта. Коллаген XVII внеклеточно фосфорилируется экто-казеинкиназой 2 в домене NC16A, фосфорилирование негативно регулирует шеддинг эктодомена.

SPARC и несовершенный остеогенез

Ген SPARC полностью связан с гомозиготным мутации в коллагене XVII, что, в свою очередь, вызывает тип несовершенного остеогенеза.

Взаимодействие

Коллаген, тип XVII, альфа 1, как было показано, взаимодействует с Кератин 18, Актинин альфа 4, Дистонин, Актинин альфа 1, CTNND1 и ITGB4.

См. Также
Ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-05-15 14:45:04
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте