2 -C-метил-D-эритритол-2,4-циклодифосфатсинтаза - 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase

редактировать
2-C-метил-D-эритритол-2,4-циклодифосфат-синтаза
Идентификаторы
номер EC 4.6.1.12
Базы данных
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA entry
ExPASy NiceZyme view
KEGG Запись KEGG
MetaCyc метаболический путь
PRIAM профиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Ген Онтология AmiGO / QuickGO

2-C-метил- D-эритритол-2,4-циклодифосфат-синтаза (MEcPP-синтаза, IspF, EC 4.6.1.12 ) является цинк -зависимой фермент, который участвует в пути MEP (немевалонатный путь) биосинтеза предшественника изопреноида. катализирует химическую реакцию :

4-дифосфоцитидил-2-C-метил-D-эритритол 2-фосфат ⇌ {\ displaystyle \ rightleftharpoons}\ rightleftharpoons 2 -C-метил-D-эритритол-2,4-циклодифосфат + CMP

Следовательно, этот фермент имеет один субстрат, 4-дифосфоцитидил-2-C-метил-D-эритритол 2- фосфат (CDP-MEP) и два продукта , 2-C-метил-D-эритритол, 2,4-циклодифосфат (MEcPP) и CMP.

Фермент считается фосфорно-кислородной лиазой. систематическое название этого класса ферментов - 2-фосфо-4- (цитидин 5'-дифосфо) -2-C-метил-D-эритритол CMP-лиаза (циклизующая; 2-C- (образующий метил-D-эритрит, 2,4-циклодифосфат) . Другие широко используемые названия включают IspF, YgbB и MEcPP-синтаза .

Структурные исследования

По состоянию на конец 2007 года 20 структур были решены для этого класса ферментов с кодами доступа PDB 1GX1, 1H47, 1H48, 1IV1, 1IV2, 1IV3, 1IV4, 1T0A, 1U3L, 1U3P, 1U40, 1U43, 1VH8, 1VHA, 1W55, 1W57, 1YQN, 2AMT, 2GZL и 2PMP.

Ссылки
  1. ^Herz S, Wungsintaweekul J, Schuhr CA, Hecht S, Lüttgen H, Sagner S, Fellermeier M, Eisenreich W, Zenk MH, Bacher A, Rohdich F (2000). «Биосинтез терпеноидов: белок YgbB превращает 4-дифосфоцитидил-2С-метил-d-эритритол-2-фосфат в 2С-метил-d-эритритол 2,4-циклодифосфат». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 97 (6): 2486–90. DOI : 10.1073 / pnas.040554697. ПМЦ 15955. PMID 10694574.

.

Последняя правка сделана 2021-07-16 07:11:18
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте