Надсемейство факторов некроза опухолей

редактировать
Надсемейство факторов некроза опухолей
Фактор некроза опухоли мыши Alpha.png Тримерная структура TNF-альфа, продуцируемая Mus musculus, основана на структуре PDB 2TNF (разрешение 1,4 Å). Разные цвета представляют разные мономеры. Baeyens, KJ et al. (1999). Рисунок создан с использованием FirstGlance Jmol.
Идентификаторы
Символ TNF
Pfam PF00229
ИнтерПро IPR006052
PROSITE PDOC00224
SCOP2 1тнф / СФЕРА / СУПФАМ
OPM суперсемейство 292
Белок OPM 2hew
Мембранома 80
TNF
PDB 1du3 EBI.jpg кристаллическая структура trail-sdr5
Идентификаторы
Символ TNF
Pfam PF00229
Клан пфам CL0100
ИнтерПро IPR006052
PROSITE PDOC00561
SCOP2 1тн / СФЕРА / СУПФАМ

Фактор некроза опухоли ( ФНО ) надсемейство является белком надсемейства из типа II трансмембранных белков, содержащих домен гомологии ФНО и образующих тримеры. Члены этого суперсемейства могут высвобождаться из клеточной мембраны посредством внеклеточного протеолитического расщепления и функционировать как цитокин. Эти белки экспрессируются преимущественно иммунными клетками и регулируют различные клеточные функции, включая иммунный ответ и воспаление, а также пролиферацию, дифференцировку, апоптоз и эмбриогенез.

Суперсемейство состоит из 19 членов, которые связываются с 29 членами суперсемейства рецепторов TNF. Появление ортологов у беспозвоночных намекает на древнее происхождение этого надсемейства в эволюции.

PROSITE картина этого надсемейства находится в бета - листе в центральной части белка, который является консервативным во всех членах.

Члены

Существует 19 членов семьи, которые численно классифицируются как TNFSF #, где # обозначает номер члена, иногда за которым следует буква.

TNFSF № Имя Синонимы Ген Функция
1 Лимфотоксин альфа TNFβ, TNFSF1B LTA Вызвание воспаления и противовирусный ответ, развитие вторичных лимфоидных органов, роль в онкогенезе
2 Фактор некроза опухоли TNFα, Dif, некрозин, TNFSF1A,... TNF Регулирование иммунных клеток, индукция лихорадки, кахексии, воспаления и апоптоза, ингибирование онкогенеза и репликации вирусов и ответ на сепсис
3 Лимфотоксин бета TNFγ LTB Вызвание воспаления и противовирусный ответ, развитие вторичных лимфоидных органов, роль в онкогенезе
4 Лиганд OX40 CD252, Gp34, CD134L TNFSF4 Активация Т-клеточного иммунного ответа костимуляцией Т-клеток
5 Лиганд CD40 CD154, TRAP, Gp39, T-BAM CD40LG Регулирование адаптивного иммунного ответа путем активации антигенпрезентирующей клетки
6 Fas лиганд CD178, APTL, CD95L FASLG Регулирование гомеостаза Т-клеток путем индукции апоптоза
7 Лиганд CD27 CD70 CD70 Регулирование активации В-клеток и гомеостаза Т-клеток
8 Лиганд CD30 CD153 TNFSF8 Индукция апоптоза в Т - клеток и В - клеток, профилактики аутоиммунных заболеваний
9 CD137 лиганд 4-1 баррелей TNFSF9
10 Связанный с TNF лиганд, индуцирующий апоптоз CD253, APO-2L TNFSF10 Подавление онкогенеза, индукция апоптоза
11 Рецепторный активатор ядерного фактора каппа-лиганд CD254, OPGL, TRANCE, ODF TNFSF11 Рост тканей (особенно регенерация и ремоделирование костей), созревание дендритных клеток
12 TNF-связанный слабый индуктор апоптоза АПО-3Л, ДР3Л TNFSF12 Регуляция ангиогенеза, индукция апоптоза
13 Лиганд, индуцирующий пролиферацию CD256, TALL-2, TRDL1 TNFSF13 Регулирование развития В-клеток и выживания плазматических клеток
13B Фактор активации В-клеток CD257, BLyS, TALL-1, TNFSF20,... TNFSF13B Стимуляция пролиферации и дифференцировки В-клеток
14 СВЕТ CD258, HVEML TNFSF14 Стимуляция пролиферации Т-клеток, регуляция апоптоза
15 Ингибитор роста эндотелия сосудов TL1, TL-1A TNFSF15 Подавление ангиогенеза
18 Член суперсемейства TNF 18 ДЕВУШКА, АИТРЛ, ТЛ-6 TNFSF18 Регулирование выживаемости Т-клеток
19 Эктодисплазин А ЭД1-А1, ЭД1-А2 EDA Развитие эктодермальных тканей
Рекомендации
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR006052
внешняя ссылка
Последняя правка сделана 2023-03-20 05:59:37
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте