Саповирус

редактировать
Монотипический род одноцепочечных положительно-смысловых РНК, вирусов без оболочки в семействе Caliciviridae

Вирус Саппоро
Электронная микрофотография вирусов Саппоро
Передача электронная микрофотография вирусов Саппоро
Классификация вирусов e
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Класс:Pisoniviricetes
Порядок:Picornavirales
Семейство:Caliciviridae
Род:Sapovirus
Вид:вирус Саппоро

Саповирус представляет собой генетически разнообразный род одноцепочечных позитивно-смысловых РНК, вирусов без оболочки в семействе Caliciviridae. Вместе с норовирусом саповирусы являются наиболее частой причиной острого гастроэнтерита (обычно называемого «желудочным гриппом», хотя он не связан с гриппом ) у людей и другие животные. Это монотипный таксон, содержащий только один вид, вирус Саппоро .

. Естественными хозяевами вируса являются люди и свиньи. Вирус передается при оральном / фекальном контакте. Саповирус чаще всего встречается у детей и младенцев и поэтому часто распространяется в яслях и детских садах; однако он был обнаружен в учреждениях длительного ухода. Это могло быть связано с отсутствием мер личной гигиены и санитарии. Симптомы чаще всего включают диарею и рвоту. Саповирус был первоначально обнаружен во время вспышки гастроэнтерита в детском доме в Саппоро, Япония, 1977 г.

Содержание
  • 1 Путь передачи и восприимчивость хозяина
  • 2 Симптомы
  • 3 Профилактика
    • 3.1 В условиях больницы
  • 4 Лечение
  • 5 Классификация вирусов
    • 5.1 Структура и геном
  • 6 Лабораторная диагностика
    • 6.1 Методы обнаружения нуклеиновых кислот
      • 6.1.1 Обнаружение вирусных частиц
        • 6.1.1.1 Методы обнаружения антигенов
  • 7 Цикл репликации
  • 8 История
  • 9 Вспышки
    • 9.1 Декабрь 2013
      • 9.1.1 Июнь 2007
        • 9.1.1.1 Учреждения длительного ухода 2002–2009
  • 10 Сопутствующие заболевания
  • 11 Вирусы животных
  • 12 Источники
  • 13 Внешние ссылки
Путь передачи и восприимчивость к хозяину

Саповирус распространяется фекальным / оральным путем. Зараженные люди выделяют более 10 9 {\ displaystyle 10 ^ {9}}10 ^ {9} частиц / грамм фекалий или рвоты. Частицы инфицированного человека остаются жизнеспособными в течение многих лет, а инфекционная доза может составлять всего 10 частиц.

Загрязнение рабочих поверхностей, рук и т. Д. Может вызвать огромное количество новых инфекций. Заражение может произойти при вдыхании частиц, например, при аэрозольной форме частиц при рвоте инфицированного человека или при смыве туалета после рвоты инфицированного человека. Другие формы передачи включают чрезмерное обращение с продуктами питания инфицированным человеком (чаще всего это происходит в ресторане), употребление моллюсков, обитающих в водах, загрязненных инфицированными фекалиями, и употребление загрязненной воды. 64>

Симптомы

После инкубационного периода продолжительностью 1–4 дня начинают появляться признаки болезни. Симптомы саповируса очень похожи на симптомы норовируса. Наиболее частые симптомы - рвота и диарея; однако могут возникнуть дополнительные симптомы. К ним относятся: озноб, тошнота, головная боль, спазмы в животе и миалгия - лихорадка возникает очень редко. Хотя у пациентов чаще всего появляются симптомы после 1–4-дневного инкубационного периода, были случаи, когда у человека не было симптомов. Хотя у человека нет симптомов, он все же способен распространять вирус обычным путем, орально-фекальным путем.

Профилактика

Общая санитарная гигиена является наиболее важным методом предотвращения саповирусов. Это можно сделать, тщательно вымыв руки после посещения туалета и перед едой / приготовлением пищи. Загрязненные поверхности следует очищать дезинфицирующим средством или растворами, содержащими отбеливатель. Другие профилактические меры включают избегание контактов и совместное использование напитков / еды с инфицированными людьми.

В условиях больницы

  • Пострадавшие пациенты должны быть изолированы, а инфицированные сотрудники должны быть отстранены от работы.
  • Мойщики кроватей должны быть осведомлены и обучены, чтобы они могли работать с осторожностью
  • Если должна произойти экстремальная вспышка, «может потребоваться закрыть отделения для новых госпитализаций».
  • «Передвижение персонала из пораженных в здоровые палаты должно быть запрещено - групповая деятельность прекращена, а посещения дети обескуражены ».
Лечение

Не существует специальных лекарств для людей, инфицированных саповирусом. Саповирус нельзя лечить антибиотиками, потому что это не бактериальная инфекция. Лечение включает поддержку симптомов, например регидратацию человека.

Классификация вирусов

Структура и геном

Саповирус - это вирус с одноцепочечной РНК без оболочки, имеющий положительный смысл, около Размер 7,7 КБ. Вирус имеет поли (A) хвост с 3'-конца, но не 5'-концевую часть. Саповирус имеет структуру икосаэдра, которая содержит 180 субъединиц (Т = 3). Диаметр капсида составляет 27-40 нм. Как и у других калицивирусов, капсид саповируса имеет круглые заострения на своей поверхности. Однако морфология его поверхности «Звезда Давида» отличает его от других калицивирусов.

Геном саповируса организован в две (возможно, три) хорошо известные открытые рамки считывания (ORF). ORF1 кодирует неструктурные белки и VP1, основной белок капсида. VP1 имеет два стандартных домена: оболочку (S) и выступающую (P). Функция белка S состоит в том, чтобы «формировать каркас вокруг нуклеиновой кислоты», в то время как белок P играет важную роль в образовании «гомодимера с рецепторами». ORF2 кодирует минорные структурные полипротеины, VP2. Хотя были предсказания относительно третьей ORF (ORF3), нет никаких доказательств того, какова ее функция.

Уже был проанализирован и идентифицирован как минимум 21 полный геном саповируса, все из которых можно классифицировать на пять категорий (GI-GV), которые в дальнейшем можно разделить на разные генетические кластеры. Четыре из пяти групп (GI, GII, GIV, GV) могут инфицировать людей, и эти четыре группы соответствуют четырем антигенно различающимся штаммам саповирусов: Саппоро, Хьюстон, Лондон и Стокгольм. Хотя существует как минимум 21 генотип этого вируса, новые продолжают регистрироваться в Америке, Азии и Европе.

РодСтруктураСимметрияКапсидРасположение геномаСегментация генома
СаповирусИкосаэдрическийT=3Без оболочкиЛинейныйОдночастичный
Лабораторная диагностика

Методы обнаружения нуклеиновых кислот

ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР ) является наиболее распространенным использовали средство обнаружения саповирусов из-за его широкой реактивности, чувствительности, скорости и специфичности. Из-за разнообразия саповирусов были разработаны сотни праймеров для специфической нацеливания и амплификации РНК-зависимой РНК-полимеразы. Это может быть использовано для «частичной характеристики саповируса и исследования сходства обнаруженного саповируса».

Обнаружение вирусных частиц

«Саповирусы морфологически отличаются от других возбудителей гастроэнтерита (например, норовируса, ротавируса., астровирус или аденовирус) по их типичной морфологии поверхности "Звезды Давида" под электронным микроскопом. Однако он имеет низкую чувствительность по сравнению с методами обнаружения нуклеиновых кислот. "

Методы обнаружения антигена

Иммуноферментные анализы (ELISA ) использовали для обнаружения саповируса человека из клинических образцов. Хотя ELISA можно использовать для обнаружения антигенов саповируса человека, он обычно не используется. Разнообразие множества штаммов саповирусов затрудняет обнаружение широкого спектра антигенов, которые могут присутствовать - поскольку существует так много возможных антигенов, ELISA не так точен или чувствителен, как методы обнаружения нуклеиновых кислот.

Цикл репликации

Точный цикл репликации саповируса не определен; однако считается, что он имеет такой же или аналогичный цикл цитоплазматической репликации, что и другие калицивирусы. Цикл цитоплазматической репликации выглядит следующим образом:

  1. проникновение в клетку-хозяин достигается путем прикрепления к рецепторам-хозяевам, которые опосредуют эндоцитоз вируса в клетке-хозяине.
  2. Удаление оболочки и высвобождение вирусной геномной РНК в цитоплазму.
  3. VPg удаляется из вирусной РНК, которая затем транслируется в процессированный полипротеин ORF1 с образованием белков репликации.
  4. Репликация происходит на вирусных фабриках. Геном дцРНК синтезируется из геномной оцРНК (+).
  5. Геном дцРНК транскрибируется / реплицируется, обеспечивая вирусные мРНК / новые геномы оцРНК (+).
  6. Субгеномная трансляция РНК дает начало белок капсида и VP2.
  7. Сборка новых вирусных частиц и высвобождение путем лизиса клеток. "
История

С помощью электронной микроскопии саповирус впервые был замечен как диарея образцы стула из Соединенного Королевства в 1977 году и вскоре были известны как возбудители гастроэнтерита. В то время как вирус был впервые обнаружен в Великобритании, «прототип штамма рода Sapovirus был получен из другой вспышки в Саппоро, Япония, в 1982 году». геном саповируса был интерпретирован из штамма Manchester в Соединенном Королевстве в 1993 году. Ранее саповирусы назывались «саппороподобными вирусами», однако в 2002 году они были изменены на вирус вида Sapporo, род Sapovirus, в семействе Caliciviridae ». В настоящее время семейство Caliciviridae состоит из пяти установленных родов: Sapovirus, Норовирус, лаговирус, везивирус и небовирус ».

Вспышки

декабрь 2013 г.

Один положительный результат на саповирусную инфекцию был подтвержден в больнице Гисборн в Новой Зеландии. Два дополнительных случая были обнаружены у сотрудников, а еще пять пациентов были изолированы. Персонал больницы использовал меры предосторожности, используя средства индивидуальной защиты при входе в палаты.

июнь 2007

У 55 преподавателей колледжа в округе Тайбэй была диагностирована саповирусная инфекция.

Учреждения длительного ухода за 2002–2009 гг.

«Используя данные департаментов здравоохранения Орегона и Миннесоты, исследователи исследовали 2161 вспышку гастроэнтерита в период с 2002 по 2009 год. Из них 142 вспышки (7 процентов) были признаны отрицательными по норовирусу, и 93 из них были дополнительно протестированы на другие желудочно-кишечные вирусы, включая саповирус, астровирус, аденовирус и ротавирус. Саповирус был выявлен в 21 вспышке (23 процента), причем 66 процентов из них возникли при длительном лечении Примерно половина этих случаев произошла только в 2007 году ". Исследователи также поясняют, что, хотя доля саповирусов, встречающихся в учреждениях долгосрочного ухода, высока, это, вероятно, артефакт обязательной отчетности о вспышках.

Сопутствующие заболевания

Норовирус чаще всего ассоциируется с с саповирусом. Геномы норовируса и саповируса очень тесно связаны, различие между ними может быть сделано только из различий в их стратегии кодирования и рамках считывания. Норовирусы (наряду с саповирусами) являются наиболее частой причиной гастроэнтерита и поэтому проявляют те же симптомы, что и друг друга.

Астровирус, как и саповирус, вызывает гастроэнтерит у детей и пожилых людей, особенно у лиц с ослабленным иммунитетом.. В то время как саповирус имеет две ОРС, астровирус имеет три, а также 6 рекомбинантных штаммов. Астровирусы реплицируются в цитоплазме и легко размножаются в желудочно-кишечном тракте.

Ротавирус, как норовирус, астровирус и саповирус, вызывает гастроэнтерит. Ротавирус, однако, гораздо более смертоносен, вызывая 37% случаев смерти детей с диареей и 215 000 смертей во всем мире.

Вирусы животных

Саповирусы были обнаружены у летучих мышей, Калифорния морские львы, собаки, свиньи и норки.

Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-07 02:22:56
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте