Войти
Типичная архитектура домена RRM с четырехцепочечным антипараллельным бета-листом, расположенным на двух альфа-спиралях | РНК мотив признания. (также известный как домен RRM, RBD или RNP) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | RRM_1 | ||||||||||
| Pfam | PF00076 | ||||||||||
| Pfam клан | RRM CL0221 RRM | ||||||||||
| InterPro | IPR000504 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC00030 | ||||||||||
| SCOPe | 1sxl / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
Мотив распознавания РНК, RNP-1 является предполагаемым РНК -связывающим доменом примерно из 90 аминокислот, который как известно, связывают одноцепочечные РНК. Он был обнаружен во многих эукариотических белках.
Самая большая группа одноцепочечных РНК-связывающих белков - это семейство мотивов узнавания эукариотической РНК (RRM), которое содержит восемь аминокислотная консенсусная последовательность RNP-1.
Белки RRM обладают разнообразными предпочтениями и функциями связывания РНК и включают гетерогенные ядерные рибонуклеопротеины (hnRNP ), белки, участвующие в регуляции альтернативы сплайсинг (SR, U2AF2,), белковые компоненты малых ядерных рибонуклеопротеидов (U1 и U2 snRNPs ) и белки, регулирующие стабильность и трансляцию РНК (PABP, Ла, Ху). RRM в гетеродимерном факторе сплайсинга U2 snRNP, вспомогательный фактор, по-видимому, имеет два RRM-подобных домена со специализированными функциями для распознавания белков. Мотив также появляется в нескольких белках, связывающих одноцепочечную ДНК.
Типичный RRM состоит из четырех антипараллельных бета-цепей и двух альфа-спиралей, расположенных в складке бета-альфа-бета-бета-альфа-бета. с боковыми цепями, которые складываются с основаниями РНК. В некоторых случаях при связывании РНК присутствует третья спираль. RRM рассматривается в ряде публикаций.
A2BP1 ; ACF ; БОЛЛ ; БРУНОЛ4 ; ; ; ; ; CIRBP ; CNOT4 ; ; ; ; CPSF7 ; CSTF2 ; CSTF2T ; CUGBP1 ; CUGBP2 ; ; DAZ1 ; DAZ2 ; DAZ3 ; ; DAZAP1 ; DAZL ; ; ; ; ; EIF4B ; EIF4H ; ELAVL1 ; ELAVL2 ; ELAVL3 ; ELAVL4 ; ; ENOX2 ; EWSR1 ; FUS ; FUSIP1 ; ; G3BP1 ; G3BP2 ; ; HNRNPL ; ; HNRPA1 ; HNRPA2B1 ; HNRPA3 ; HNRPAB ; HNRPC ; ; HNRPD ; HNRPDL ; HNRPF ; HNRPH1 ; HNRPH2 ; HNRPH3 ; ; ; ; ; ; ; HTATSF1 ; IGF2BP1 ; IGF2BP2 ; IGF2BP3 ; ; MKI67IP ; MSI1 ; MSI2 ; ; ; MYEF2 ; ; NCL ; №8 ; НЕТ ; ; PABPC1 ; ; PABPC3 ; PABPC4 ; PABPC5 ; PABPN1 ; POLDIP3 ; ; PPARGC1A ; PPARGC1B ; PPIE ; PPIL4 ; PPRC1 ; ; PTBP1 ; PTBP2 ; PUF60 ; RALY ; РАЛИЛ ; RAVER1 ; ; RBM10 ; RBM11 ; RBM12 ; ; РБМ14 ; RBM15 ; ; ; РБМ17 ; ; РБМ19 ; RBM22 ; RBM23 ; ; RBM25 ; RBM26 ; ; RBM28 ; RBM3 ; ; RBM33 ; RBM34 ; ; ; ; RBM39 ; RBM4 ; ; ; ; ; ; RBM47 ; ; RBM5 ; RBM7 ; RBM8A ; RBM9 ; RBMS1 ; ; RBMS3 ; RBMX ; ; ; RBMY1A1 ; ; ; ; ; RBPMS ; ; RDBP ; ; ; RNPS1 ; ; SAFB ; SAFB2 ; SART3 ; ; SF3B14 ; SF3B4 ; SFPQ ; SFRS1 ; SFRS10 ; SFRS11 ; SFRS12 ; ; SFRS2 ; ; SFRS3 ; SFRS4 ; SFRS5 ; SFRS6 ; SFRS7 ; SFRS9 ; ; ; SNRP70 ; SNRPA ; SNRPB2 ; SPEN ; SR140 ; ; SSB ; SYNCRIP ; TAF15 ; TARDBP ; THOC4 ; TIA1 ; TIAL1 ; ; ; TRA2A ; ; ; ; U2AF1 ; U2AF2 ; УХМК1 ; ; ZNF638 ; ZRSR1 ; ZRSR2 ;
