Метил-CpG-связывающий домен, белок 2

MBD2
Доступные конструкции PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2L2L
Идентификаторы
Псевдонимы	MBD2, DMTase, NY-CO-41, белок 2 связывающего домена метил-CpG
Внешние идентификаторы	OMIM : 603547 MGI : 1333813 HomoloGene : 2918 GeneCards : MBD2
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 18 (человек) Группа 18q21.2 Начинать 54 151 606 п.н. Конец 54 224 669 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 18 (мышь) Группа 18 E2 | 18 44,54 см Начинать 70 568 189 п.н. Конец 70626131 п.о.
Паттерн экспрессии РНК Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • ГО: 0000980 РНК - полимеразы связывания II цис-регуляторную последовательность ДНК конкретного региона • ДНК связывания • домен белка Специфическое связывание • метил-CpG - связывающий • домен пальца С2Н2 цинка связывания • хроматина связывания • GO: связывание 0001948 белок • миРНК связывания • нуклеосомной ДНК связывание • связывание сателлитной ДНК • связывание мРНК Сотовый компонент • цитоплазма • комплекс гистондеацетилазы • гетерохроматин • хроматин • ядро • нуклеоплазма • цитозоль • протеинсодержащий комплекс Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • негативная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • АТФ-зависимое ремоделирование хроматина • позитивная регуляция сигнального пути Wnt • регуляция пролиферации клеточной популяции • материнское поведение • негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • старение • ответ на механический стимул • ответ на эстрадиол • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • ответ на уровни питательных веществ • ответ на органическое циклическое соединение • положительная регуляция связывания хроматина • развитие сердца • развитие эмбрионального органа • сборка гетерохроматина рДНК • регуляция метилирования ДНК • сборка гетерохроматина, зависящая от метилирования ДНК • сборка комплекса, содержащего клеточный белок Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8932	17191
Ансамбль	ENSG00000134046	ENSMUSG00000024513
UniProt	Q9UBB5	Q9Z2E1
RefSeq (мРНК)	NM_015832 NM_003927	NM_010773 NM_001311071
RefSeq (белок)	NP_003918 NP_056647 NP_056647.1	NP_001298000 NP_034903
Расположение (UCSC)	Chr 18: 54.15 - 54.22 Мб	Chr 18: 70,57 - 70,63 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Метил-CpG-связывающий домен белка 2 представляет собой белок, который у человека кодируется MBD2 гена.

• 1 Функция
• 2 взаимодействия
• 3 ссылки
• 4 Дальнейшее чтение

Метилирование ДНК является основной модификацией геномов эукариот и играет важную роль в развитии млекопитающих. Белки человека MECP2, MBD1, MBD2, MBD3 и MBD4 составляют семейство ядерных белков, связанных присутствием в каждом из метил-CpG-связывающего домена (MBD). Каждый из этих белков, за исключением MBD3, способен специфически связываться с метилированной ДНК. MECP2, MBD1 и MBD2 также могут репрессировать транскрипцию с метилированных промоторов генов. Белок, кодируемый этими генами, может действовать как медиатор биологических последствий сигнала метилирования. Сообщается также, что MBD2 и MBD3 рекрутируют комплекс NuRD в области ДНК в зависимости от их избирательного связывания с метилированными сайтами CpG. Следовательно, MBD2 / NuRD и MBD3 / NuRD определяют два различных белковых комплекса с разными биохимическими и функциональными свойствами.

Было показано, что белок 2 метил-CpG-связывающего домена взаимодействует с:

• GATAD2B,
• HDAC1,
• Гистоновая деацетилаза 2,
• MBD3
• МИЗФ и
• SIN3A.

• Scanlan MJ, Chen YT, Williamson B, Gure AO, Stockert E, Gordan JD, Türeci O, Sahin U, Pfreundschuh M, Old LJ (1998). «Характеристика антигенов рака толстой кишки человека, распознаваемых аутологичными антителами». Int. J. Рак. 76 (5): 652–8. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19980529) 76: 5 lt;652:: AID-IJC7gt; 3.0.CO; 2-П. PMID   9610721.
• Чжан Ю., Лерой Г., Силиг Х.П., Лейн В.С., Рейнберг Д. (1998). «Специфический для дерматомиозита аутоантиген Mi2 является компонентом комплекса, содержащего гистондеацетилазу и активность ремоделирования нуклеосом». Cell. 95 (2): 279–89. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81758-4. PMID   9790534. S2CID   18786866.
• Тонг Дж. К., Хассиг Калифорния, Шницлер Г. Р., Кингстон Р. Э., Шрайбер С. Л. (1998). «Деацетилирование хроматина АТФ-зависимым комплексом ремоделирования нуклеосом». Природа. 395 (6705): 917–21. Bibcode : 1998Natur.395..917T. DOI : 10,1038 / 27699. PMID   9804427. S2CID   4355885.
• Бхаттачарья С.К., Рамчандани С., Червони Н., Шиф М. (1999). «Белок млекопитающих со специфической деметилазной активностью в отношении ДНК mCpG». Природа. 397 (6720): 579–83. Bibcode : 1999Natur.397..579B. DOI : 10,1038 / 17533. PMID   10050851. S2CID   4408031.
• Чжан Ю., Нг Х. Х., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Берд А, Рейнберг Д. (1999). «Анализ субъединиц NuRD выявляет основной комплекс гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Genes Dev. 13 (15): 1924–35. DOI : 10.1101 / gad.13.15.1924. PMC   316920. PMID   10444591.
• Нг Х. Х., Чжан Й., Хендрих Б., Джонсон К. А., Тернер Б. М., Эрдджумент-Бромаж Х., Темпст П., Рейнберг Д., Берд А. (1999). «MBD2 представляет собой репрессор транскрипции, принадлежащий гистондеацетилазному комплексу MeCP1». Nat. Genet. 23 (1): 58–61. DOI : 10,1038 / 12659. ЛВП : 1842/684. PMID   10471499. S2CID   6147725.
• Татэмацу К.И., Ямадзаки Т., Исикава Ф. (2000). «Комплекс MBD2-MBD3 связывается с полуметилированной ДНК и образует комплекс, содержащий DNMT1 в фокусах репликации в поздней S-фазе». Гены Клетки. 5 (8): 677–88. DOI : 10.1046 / j.1365-2443.2000.00359.x. PMID   10947852. S2CID   25185979.
• Боке Дж., Аммерпол О, Кегель С., Мерен Ю., Ренкавиц Р. (2001). «Домен минимальной репрессии MBD2b перекрывается с доменом связывания метил-CpG и напрямую связывается с Sin3A». J. Biol. Chem. 275 (45): 34963–7. DOI : 10.1074 / jbc.M005929200. PMID   10950960.
• Хамфри Г.В., Ван Й., Руссанова В.Р., Хираи Т., Цинь Дж., Накатани И., Ховард Б.Х. (2001). «Стабильные гистоновые деацетилазные комплексы, отличающиеся наличием белков домена SANT CoREST / kiaa0071 и Mta-L1». J. Biol. Chem. 276 (9): 6817–24. DOI : 10.1074 / jbc.M007372200. PMID   11102443.
• Фэн Кью, Чжан И (2001). «Комплекс MeCP1 подавляет транскрипцию посредством преимущественного связывания, ремоделирования и деацетилирования метилированных нуклеосом». Genes Dev. 15 (7): 827–32. DOI : 10,1101 / gad.876201. PMC   312663. PMID   11297506.
• Секимата М., Такахаши А., Мураками-Секимата А., Хомма Y (2001). «Участие нового белка цинкового пальца, MIZF, в репрессии транскрипции путем взаимодействия с метил-CpG-связывающим белком, MBD2». J. Biol. Chem. 276 (46): 42632–8. DOI : 10.1074 / jbc.M107048200. PMID   11553631.
• Müller-Tidow C, Kügler K, Diederichs S, Klümpen S, Möller M, Vogt U, Metzger R, Schneider PM, Berdel WE, Serve H (2001). «Потеря экспрессии HDAC-рекрутинговых белков метил-CpG-связывающего домена при раке человека». Br. J. Рак. 85 (8): 1168–74. DOI : 10.1054 / bjoc.2001.2041. PMC   2375156. PMID   11710831.
• Фэн Кью, Цао Р., Ся Л., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Чжан И (2002). «Идентификация и функциональная характеристика компонентов p66 / p68 комплекса MeCP1». Мол. Клетка. Биол. 22 (2): 536–46. DOI : 10.1128 / MCB.22.2.536-546.2002. PMC   139742. PMID   11756549.
• Баккер Дж, Лин Х, Нельсон В.Г. (2002). «Белок 2 связывающего домена метил-CpG репрессирует транскрипцию с промоторов гена гиперметилированной глутатион-S-трансферазы pi-класса в клетках гепатоцеллюлярной карциномы». J. Biol. Chem. 277 (25): 22573–80. DOI : 10.1074 / jbc.M203009200. PMID   11960994.
• Сайто М., Исикава Ф (2002). «MCpG-связывающий домен человеческого MBD3 не связывается с mCpG, но взаимодействует с компонентами NuRD / Mi2 HDAC1 и MTA2». J. Biol. Chem. 277 (38): 35434–9. DOI : 10.1074 / jbc.M203455200. PMID   12124384.
• Детич Н, Зебердж Дж, Шиф М (2002). «Промотор-специфическая активация и деметилирование с помощью MBD2 / деметилазы». J. Biol. Chem. 277 (39): 35791–4. DOI : 10.1074 / jbc.C200408200. PMID   12177048.
• Brackertz M, Boeke J, Zhang R, Renkawitz R (2002). «Два тесно связанных белка p66 составляют новое семейство мощных репрессоров транскрипции, взаимодействующих с MBD2 и MBD3». J. Biol. Chem. 277 (43): 40958–66. DOI : 10.1074 / jbc.M207467200. PMID   12183469.
• Критивас А., Фудзимуро М., Вайднер М., Янг Д. Б., Хейворд С. Д. (2002). «Взаимодействия белков, нацеленные на связанный с латентностью ядерный антиген герпесвируса Капоши, связанный с саркомой, к клеточным хромосомам». J. Virol. 76 (22): 11596–604. DOI : 10.1128 / JVI.76.22.11596-11604.2002. PMC   136775. PMID   12388720.