MYB (ген)

MYB
Доступные конструкции PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1GUU, 1GV2, 1GV5, 1GVD, 1H88, 1H89, 1IDY, 1IDZ, 1MBE, 1MBF, 1MBG, 1MBH, 1MBJ, 1MBK, 1MSE, 1MSF, 1SB0, 2AGH
Идентификаторы
Псевдонимы	MYB, Cmyb, c-myb, c-myb_CDS, efg, протоонкоген MYB, фактор транскрипции
Внешние идентификаторы	OMIM : 189990 MGI : 97249 HomoloGene : 31311 GeneCards : MYB
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 6 (человек) Группа 6q23.3 Начинать 135 181 308 п.н. Конец 135 219 173 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 10 (мышь) Группа 10 A3 | 10 9,75 см Начинать 21 124 935 п.н. Конец 21 160 984 п.н.
Паттерн экспрессии РНК Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • ГО: 0000980 РНК - полимеразы II цис-регуляторную область последовательности ДНК-специфический связывающий • ДНК связывания • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающий активатор активности транскрипции РНК - полимеразы II - специфический • Связывание с белком GO: 0001948 • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • ядерный матрикс • ядро • нуклеоплазма Биологический процесс • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ремоделирование хроматина • негативная регуляция транскрипции, шаблон ДНК • регуляция транскрипции, шаблон ДНК • негативная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • позитивная регуляция метилирования гистона H3-K4 • транскрипция, ДНК-темплейт • позитивная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • позитивная регуляция метилирования гистона H3-K9 • позитивная регуляция дифференцировки Т-хелперных клеток • транскрипция с помощью РНК-полимеразы II • митотический клеточный цикл GO: 0007067 • ответ на гипоксию • позитивная регуляция процесса биосинтеза коллагена • позитивная регуляция апоптотического процесса нейронов • позитивная регуляция пролиферации гладкомышечных клеток • позитивная регуляция пролиферации глиальных клеток • клеточный ответ на перекись водорода • клеточный ответ на ретиноевую кислоту • позитивная регуляция продукции трансформирующего фактора роста бета • позитивная регуляция гибели нейронов • положительная регуляция гепатита пролиферация звездчатых клеток • позитивная регуляция активации звездчатых клеток печени • позитивная регуляция секреции тестостерона • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4602	17863
Ансамбль	ENSG00000118513	ENSMUSG00000019982
UniProt	P10242 Q708E1	P06876
RefSeq (мРНК)	NM_001130172 NM_001130173 NM_001161656 NM_001161657 NM_001161658 NM_001161659 NM_001161660 NM_005375	NM_001198914 NM_010848 NM_033597
RefSeq (белок)	NP_001123644 NP_001123645 NP_001155128 NP_001155129 NP_001155130 NP_001155131 NP_001155132 NP_005366	NP_001185843 NP_034978
Расположение (UCSC)	Chr 6: 135.18 - 135.22 Мб	Chr 10: 21.12 - 21.16 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Myb гены являются частью большого семейства генов из факторов транскрипции, обнаруженных у животных и растений. У людей он включает протоонкоген Myb, такой как 1, и родственный Myb белок B в дополнение к собственно MYB. Члены расширенного семейства SANT / Myb также включают домен SANT и другие подобные полностью спиральные гомеобоксовые домены.

• 1 Функция
  • 1.1 Вирусный
  • 1.2 Животные
  • 1.3 Растения
• 2 См. Также
• 3 ссылки
• 4 Дальнейшее чтение
• 5 Внешние ссылки

Популярный

Семейство генов Myb названо в честь одноименного гена вируса миелобластоза птиц. Вирус Myb (v-Myb, P01104 ) распознает последовательность 5'- Y AAC K G-3 '. Он вызывает миелобластоз (миелолейкоз) у кур. По сравнению с клетками Myb нормального животного (c-myb), v-myb содержит делеции в С-концевом регуляторном домене, что приводит к аберрантной активации других онкогенов.

Животные

Myb протоонкоген белок является членом MYB ( мой Эло б lastosis) семейства факторов транскрипции. Белок содержит три домена: N-концевой ДНК-связывающий домен, центральный домен активации транскрипции и C-концевой домен, участвующий в репрессии транскрипции. Это может играть роль в регуляции клеточного цикла. Как и вирусная версия, этот ген является онкогеном, и перестройка гена (часто включающая делецию в C-концевом домене) вызывает рак.

Растения

Факторы MYB представляют собой семейство белков, которые включают консервативный ДНК-связывающий домен MYB. Растения содержат подсемейство белков MYB, которое характеризуется доменом MYB типа R2R3.

В кукурузе флобафены синтезируются путем синтеза флавоноидов в результате полимеризации флаван-4-олов, который кодирует R2R3 myb-подобный активатор транскрипции гена A1, кодирующего дигидрофлавонол-4-редуктазу (восстановление дигидрофлавонолов до флаван-4-олов), в то время как другой ген (супрессор пигментации перикарпия 1 или SPP1) действует как супрессор. Ген P кукурузы кодирует гомолог Myb, который распознает последовательность CCWACC, в отличие от YAACGG, связанного с белками Myb позвоночных.

В сорго соответствующий ген желтого семени 1 (y1) также кодирует белок домена Myb типа R2R3, который регулирует экспрессию генов халконсинтазы, халконизомеразы и дигидрофлавонолредуктазы, необходимых для биосинтеза 3-дезоксифлавоноидов.

Рубин является активатором транскрипции MYB генов, вырабатывающих антоцианы в цитрусовых. В большинстве сортов цитрусовых рубин не действует, но в кровяных апельсинах он стимулирует выработку антоцианов, чтобы дать плодам характерный красный цвет.

• EZH1

• О, я, Редди EP (1999). «Семейство генов myb в росте, дифференцировке и апоптозе клеток». Онкоген. 18 (19): 3017–33. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202839. PMID   10378697.
• Николаидес NC, Гуальди Р., Касадеваль С., Манцелла Л., Калабретта Б. (1991). «Положительная ауторегуляция экспрессии c-myb через сайты связывания Myb в 5'-фланкирующей области гена c-myb человека». Мол. Клетка. Биол. 11 (12): 6166–76. DOI : 10.1128 / mcb.11.12.6166. PMC   361795. PMID   1944282.
• Калькбреннер Ф., Геманн С., Мёллинг К. (1990). «Активация транскрипции генами c-myb и v-myb человека». Онкоген. 5 (5): 657–61. PMID   2189102.
• Вестин Э. Х., Горс К. М., Кларк М. Ф. (1990). «Альтернативный сплайсинг человеческого гена c-myb». Онкоген. 5 (8): 1117–24. PMID   2202948.
• Дасгупта П., Редди EP (1990). «Идентификация альтернативно сплайсированных транскриптов человеческого c-myb: молекулярное клонирование и анализ последовательности последовательностей экзона 9A человеческого c-myb». Онкоген. 4 (12): 1419–23. PMID   2687764.
• Янссен Дж. В., Верноле П., де Бур П. А., Остерхейс Дж. В., Коллард Дж. Г. (1986). «Сублокализация c-myb в 6q21 ---- q23 посредством гибридизации in situ и экспрессии c-myb в тератокарциноме человека с перестройками 6q». Cytogenet. Cell Genet. 41 (3): 129–35. DOI : 10.1159 / 000132217. PMID   3007038.
• Slamon DJ, Boone TC, Murdock DC, Keith DE, Press MF, Larson RA, Souza LM (1986). «Исследования человеческого гена c-myb и его продукта при острых лейкозах человека». Наука. 233 (4761): 347–51. Bibcode : 1986Sci... 233..347S. DOI : 10.1126 / science.3014652. PMID   3014652.
• Majello B, Kenyon LC, Dalla-Favera R (1987). «Протоонкоген c-myb человека: нуклеотидная последовательность кДНК и организация геномного локуса». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 83 (24): 9636–40. DOI : 10.1073 / pnas.83.24.9636. PMC   387195. PMID   3540945.
• Щилик С., Скорски Т., Ку Д.Х., Николаидес Н.С., Вен С.К., Рудницка Л., Бонати А., Малагуарнера Л., Калабретта Б. (1993). «Регулирование пролиферации и экспрессии цитокинов фибробластов костного мозга: роль c-myb». J. Exp. Med. 178 (3): 997–1005. DOI : 10,1084 / jem.178.3.997. PMC   2191153. PMID   7688794.
• Krieg J, Oelgeschläger M, Janknecht R, Lüscher B (1995). «Связывание ДНК с высоким сродством нативного полноразмерного c-Myb и дифференциальная протеолитическая чувствительность его N- и C-концевых доменов». Онкоген. 10 (11): 2221–8. PMID   7784067.
• Джейкобс С.М., Горс К.М., Вестин Э.Х. (1994). «Идентификация второго промотора в протоонкогене c-myb человека». Онкоген. 9 (1): 227–35. PMID   8302584.
• Фавье Д., Гонда Т.Дж. (1994). «Обнаружение белков, которые связываются с мотивом лейциновой молнии c-Myb». Онкоген. 9 (1): 305–11. PMID   8302594.
• Глейзер Р., Лафуз В.П., Бонно Р.Х., Аткинсон С., Киколт-Глейзер Дж.К. (1993). «Стресс-ассоциированная модуляция экспрессии протоонкогенов в лейкоцитах периферической крови человека». Behav. Neurosci. 107 (3): 525–9. DOI : 10.1037 / 0735-7044.107.3.525. PMID   8329139.
• Даш А.Б., Оррико ФК, Несс С.А. (1996). «Мотив EVES опосредует как межмолекулярную, так и внутримолекулярную регуляцию c-Myb». Genes Dev. 10 (15): 1858–69. DOI : 10,1101 / gad.10.15.1858. PMID   8756344.
• Форбрюгген Г., Ловрич Дж., Мёллинг К. (1997). «Функциональный анализ фосфорилирования серина 532 человеческого c-Myb с помощью киназы MAP». Биол. Chem. 377 (11): 721–30. DOI : 10.1515 / bchm3.1996.377.11.721. PMID   8960373.
• Тавнер Ф.Дж., Симпсон Р., Таширо С., Фавье Д., Дженкинс Н.А., Гилберт Д.Дж., Коупленд Н.Г., Макмиллан Э.М., Лютвиче Дж., Кио Р.А., Исии С., Гонда Т.Дж. (1998). «Молекулярное клонирование показывает, что белок p160, связывающий Myb, представляет собой новый, преимущественно ядрышковый белок, который может играть роль в трансактивации Myb». Мол. Клетка. Биол. 18 (2): 989–1002. DOI : 10,1128 / MCB.18.2.989. PMC   108811. PMID   9447996.
• Хедж С.П., Кумар А., Куршнер С., Шапиро Л.Х. (1998). «c-Maf взаимодействует с c-Myb, чтобы регулировать транскрипцию раннего миелоидного гена во время дифференцировки». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 2729–37. DOI : 10.1128 / mcb.18.5.2729. PMC   110652. PMID   9566892.
• Леверсон Дж. Д., Коскинен П. Дж., Оррико Ф. К., Райнио Е. М., Ялканен К. Дж., Даш А. Б., Эйзенман Р. Н., Несс С. А. (1998). «Киназа Pim-1 и p100 взаимодействуют для усиления активности c-Myb». Мол. Cell. 2 (4): 417–25. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80141-0. PMID   9809063.
• Томпсон М.А., Розенталь М.А., Эллис С.Л., Френд А.Дж., Зорбас М.И., Уайтхед Р.Х., Рамзи Р.Г. (1998). «Подавление c-Myb связано с дифференцировкой клеток толстой кишки человека, апоптозом и снижением экспрессии Bcl-2». Cancer Res. 58 (22): 5168–75. PMID   9823328.
• Вербеек В., Гомбарт А.Ф., Чумаков А.М., Мюллер С., Фридман А.Д., Кёффлер Х.П. (1999). «C / EBPepsilon напрямую взаимодействует с ДНК-связывающим доменом c-myb и совместно активирует транскрипцию миелоидных промоторов». Кровь. 93 (10): 3327–37. DOI : 10.1182 / blood.V93.10.3327. PMID   10233885.

• MYB + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
• Онкогеноподобный Drosophila Myb - Интерактивная муха
• Семейство MYB Arabidospsis thaliana в базе данных факторов транскрипции Arabidopsis (DATF)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.