MRE11A

MRE11
Доступные конструкции PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3T1I
Идентификаторы
Псевдонимы	MRE11, ATLD, HNGS1, MRE11B, MRE11A, гомолог A MRE11, нуклеаза репарации двухцепочечного разрыва, гомолог MRE11, нуклеаза репарации двухцепочечного разрыва
Внешние идентификаторы	OMIM : 600814 MGI : 1100512 HomoloGene : 4083 GeneCards : MRE11
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 11 (человек) Группа 11q21 Начинать 94 415 570 п.н. Конец 94 493 885 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 9 (мышь) Группа 9 | 9 A2 Начинать 14 784 654 п.н. Конец 14 837 123 п.н.
Паттерн экспрессии РНК Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • связывание ДНК • марганца иона связывания • GO: 0004003 ДНК хеликазной активности • одноцепочечной ДНК endodeoxyribonuclease активности • белок С-конец связывание • GO: 0001948 связывание белка • 3'-5' экзонуклеазной активности • нуклеазная активность • эндонуклеазы активности • двух- многожильного ДНК связывания • endodeoxyribonuclease активность • экзонуклеазной активность • гидролаза активность • кадгерином связывание • идентичное связывание с белками • 3'-5'-exodeoxyribonuclease активности • 5'-3' экзонуклеазной активности Сотовый компонент • место двухцепочечного разрыва • цитозоль • тело PML • ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • хромосома, теломерная область • хромосома • комплекс Mre11 • репликационная вилка Биологический процесс • реципрокная мейотическая рекомбинация • рекомбинация ДНК • поддержание теломер с помощью теломеразы • положительная регуляция киназной активности • сигнализация контрольной точки митотического внутри-S-повреждения ДНК • формирование теломерного 3 'выступа • негативная регуляция апоптотического процесса • организация хромосом • когезия сестринских хроматид • клеточный ответ на Стимул повреждения ДНК • позитивная регуляция поддержания теломер • раскручивание дуплекса ДНК • гомологичное спаривание хромосом в мейозе • негативная регуляция эндоредупликации ДНК • репарация двухцепочечных разрывов • цикл GO: 0007126 мейотических клеток • восстановление двухцепочечных разрывов посредством гомологичной рекомбинации • позитивная регуляция аутофосфорилирования белка • пролиферация клеточной популяции • сигнализация контрольной точки митотического повреждения ДНК G2 • вирусный процесс GO: 0022415 • репарация двухцепочечных разрывов посредством негомологичного соединения концов • положительная регуляция продукции интерферона типа I • регуляция митотической рекомбинации • репарация ДНК • фосфодиэфир нуклеиновой кислоты связующие гидролизы это • процессинг двухцепочечного разрыва ДНК • смещение цепи • репликация ДНК • синтез ДНК, участвующий в репарации ДНК • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 • поддержание теломер • образование двухцепочечного разрыва мейотической ДНК • восстановление митохондриального двухцепочечного разрыва посредством гомологичного рекомбинация • Резекция нити ДНК, участвующая в обработке репликационной вилки Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4361	17535
Ансамбль	ENSG00000020922	ENSMUSG00000031928
UniProt	P49959	Q61216
RefSeq (мРНК)	NM_005590 NM_005591 NM_001330347	NM_018736 NM_001310728
RefSeq (белок)	NP_001317276 NP_005581 NP_005582	NP_001297657 NP_061206
Расположение (UCSC)	Chr 11: 94,42 - 94,49 Мб	Chr 9: 14,78 - 14,84 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок репарации двухцепочечных разрывов MRE11 - это фермент, который у человека кодируется геном MRE11. Ген был обозначен MRE11A, чтобы отличить его от псевдогена MRE11B, который в настоящее время называется MRE11P1.

• 1 Функция
• 2 Ортолога
• 3 Сверхэкспрессия при раке
• 4 взаимодействия
• 5 См. Также
• 6 Ссылки
• 7 Дальнейшее чтение

Этот ген кодирует ядерный белок, участвующий в гомологичной рекомбинации, поддержании длины теломер и репарации двухцепочечных разрывов ДНК. Сам по себе белок обладает экзонуклеазной активностью от 3 'до 5' и эндонуклеазной активностью. Белок образует комплекс с гомологом RAD50 ; этот комплекс необходим для негомологичного соединения концов ДНК и обладает повышенной однонитевой эндонуклеазной активностью ДНК и экзонуклеазной активностью от 3 'до 5'. В сочетании с ДНК- лигазой этот белок способствует соединению некомплементарных концов in vitro, используя короткие гомологии около концов фрагментов ДНК. Этот ген имеет псевдоген на хромосоме 3. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные изоформы.

Mre11, ортолог MRE11 человека, встречается у прокариотной археи Sulfolobus acidocaldarius. В этом организме белок Mre11 взаимодействует с белком Rad50 и, по-видимому, играет активную роль в восстановлении повреждений ДНК, экспериментально вызванных гамма-излучением. Сходным образом, во время мейоза у эукариотического простейшего Tetrahymena Mre11 необходим для восстановления повреждений ДНК, в данном случае двухцепочечных разрывов, посредством процесса, который, вероятно, включает гомологичную рекомбинацию. Эти наблюдения предполагают, что человеческий MRE11 произошел от прокариотических и предковых белков Mre11, которые играли роль в ранних процессах восстановления повреждений ДНК.

MRE11 играет роль в репарации двухцепочечных разрывов с помощью микрогомологически обусловленного соединения концов (MMEJ). Это один из 6 ферментов, необходимых для этого пути репарации ДНК, подверженного ошибкам. MRE11 чрезмерно экспрессируется при раке груди.

Ракам очень часто не хватает экспрессии одного или нескольких генов репарации ДНК, но сверхэкспрессия гена репарации ДНК менее обычна при раке. Например, по крайней мере 36 ферментов репарации ДНК, когда мутационно дефектны в клетках зародышевой линии, вызывают повышенный риск рака (наследственные синдромы рака ). (См. Также расстройство дефицита репарации ДНК. ) Аналогичным образом, по крайней мере, 12 генов репарации ДНК часто оказывались эпигенетически репрессированными при одном или нескольких раках. (См. Также Эпигенетически уменьшенная репарация ДНК и рак. ) Обычно недостаточная экспрессия фермента репарации ДНК приводит к увеличению нереставрированных повреждений ДНК, которые из-за ошибок репликации ( трансформационный синтез ) приводят к мутациям и раку. Однако репарация MMEJ, опосредованная MRE11, очень неточна, поэтому в этом случае чрезмерная экспрессия, а не недостаточная экспрессия, по-видимому, приводит к раку.

Было показано, что MRE11 взаимодействует с:

• Банкомат,
• BRCA1,
• Ку70,
• MDC1,
• NBN,
• Rad50 и
• TERF2.

• Гомологичная рекомбинация

• Долганов Г.М., Мазер Р.С., Новиков А., Тосто Л., Чонг С., Брессан Д.А., Петрини Дж. Х. (сентябрь 1996 г.). «Человеческий Rad50 физически связан с человеческим Mre11: идентификация консервативного мультибелкового комплекса, участвующего в рекомбинационной репарации ДНК». Молекулярная и клеточная биология. 16 (9): 4832–41. DOI : 10,1128 / MCB.16.9.4832. PMC   231485. PMID   8756642.
• Карни Дж. П., Мазер Р. С., Оливарес Х., Дэвис Е. М., Ле Бо М., Йетс Дж. Р. и др. (Май 1998 г.). «Белковый комплекс hMre11 / hRad50 и синдром разрыва Неймегена: связь репарации двухцепочечных разрывов с ответом на повреждение клеточной ДНК». Cell. 93 (3): 477–86. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81175-7. PMID   9590181. S2CID   14548642.
• Паулл Т.Т., Геллерт М (июнь 1998 г.). «Экзонуклеазная активность Mre 11 с 3 'на 5' облегчает восстановление двунитевых разрывов ДНК». Молекулярная клетка. 1 (7): 969–79. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80097-0. PMID   9651580.
• Трухильо К.М., Юань С.С., Ли Э.Й., Сун П. (август 1998 г.). «Нуклеазная активность в комплексе факторов рекомбинации и репарации ДНК человека Rad50, Mre11 и p95». Журнал биологической химии. 273 (34): 21447–50. DOI : 10.1074 / jbc.273.34.21447. PMID   9705271.
• Чаманкха М., Вэй Ю.Ф., Сяо В. (декабрь 1998 г.). «Выделение hMRE11B: неспособность компенсировать дефекты дрожжевого mre11 из-за видоспецифических белковых взаимодействий». Джин. 225 (1–2): 107–16. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (98) 00530-7. PMID   9931460.
• Чжун Кью, Чен С.Ф., Ли С., Чен Й., Ван СС, Сяо Дж. И др. (Июль 1999 г.). «Ассоциация BRCA1 с комплексом hRad50-hMre11-p95 и ответ на повреждение ДНК». Наука. 285 (5428): 747–50. DOI : 10.1126 / science.285.5428.747. PMID   10426999.
• Годеке В., Эйпе М., Оффенберг Х. Х., ван Алдерен М., Гейтинг К. (октябрь 1999 г.). «Mre11 и Ku70 взаимодействуют в соматических клетках, но по-разному экспрессируются в раннем мейозе». Генетика природы. 23 (2): 194–8. DOI : 10.1038 / 13821. PMID   10508516. S2CID   13443404.
• Ким С.Т., Лим Д.С., Канман С.Е., Кастан МБ (декабрь 1999 г.). «Субстратные особенности и идентификация предполагаемых субстратов членов семейства киназ ATM». Журнал биологической химии. 274 (53): 37538–43. DOI : 10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID   10608806.
• Стюарт Г.С., Мазер Р.С., Станкович Т., Брессан Д.А., Каплан М.И., Ясперс Н.Г. и др. (Декабрь 1999 г.). «Ген репарации двухцепочечных разрывов ДНК hMRE11 мутирован у людей с расстройством, подобным атаксии-телеангиэктазии». Cell. 99 (6): 577–87. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81547-0. PMID   10612394. S2CID   14434655.
• Ван И, Кортез Д., Язди П., Нефф Н., Элледж С. Дж., Цинь Дж. (Апрель 2000 г.). «BASC, суперкомплекс белков, связанных с BRCA1, участвующих в распознавании и восстановлении аберрантных структур ДНК». Гены и развитие. 14 (8): 927–39. doi : 10.1101 / gad.14.8.927 (неактивен 31 мая 2021 г.). PMC   316544. PMID   10783165. CS1 maint: DOI неактивен с мая 2021 г. ( ссылка )
• Гатеи М., Янг Д., Серосалетти К.М., Десаи-Мета А., Весна К., Козлов С. и др. (Май 2000 г.). «АТМ-зависимое фосфорилирование нибрина в ответ на радиационное воздействие». Генетика природы. 25 (1): 115–9. DOI : 10,1038 / 75508. PMID   10802669. S2CID   23521589.
• Чжу XD, Кюстер Б., Манн М., Петрини Дж. Х., де Ланге Т. (июль 2000 г.). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация RAD50 / MRE11 / NBS1 с TRF2 и теломерами человека». Генетика природы. 25 (3): 347–52. DOI : 10,1038 / 77139. PMID   10888888. S2CID   6689794.
• de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W., Friedlein A, Langen H, Keller W. (ноябрь 2000 г.). «Фактор расщепления пре-мРНК человека II (m) содержит гомологи дрожжевых белков и связывает два других фактора расщепления». Журнал EMBO. 19 (21): 5895–904. DOI : 10.1093 / emboj / 19.21.5895. PMC   305781. PMID   11060040.
• Фукуда Т., Сумиёси Т., Такахаши М., Катаока Т., Асахара Т., Инуи Х. и др. (Январь 2001 г.). «Изменения гена репарации двухцепочечных разрывов MRE11 при раке». Исследования рака. 61 (1): 23–6. PMID   11196167.
• Desai-Mehta A, Cerosaletti KM, Concannon P (март 2001 г.). «Определенные функциональные домены нибрина опосредуют связывание Mre11, формирование фокуса и ядерную локализацию». Молекулярная и клеточная биология. 21 (6): 2184–91. DOI : 10.1128 / MCB.21.6.2184-2191.2001. PMC   86852. PMID   11238951.
• Паулл Т.Т., Кортез Д., Бауэрс Б., Элледж С.Дж., Геллерт М. (май 2001 г.). «Прямое связывание ДНК с помощью Brca1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (11): 6086–91. DOI : 10.1073 / pnas.111125998. PMC   33426. PMID   11353843.
• Хопфнер К.П., Керхер А., Крейг Л., Ву Т.Т., Карни Дж. П., Тайнер Дж. А. (май 2001 г.). «Структурная биохимия и архитектура взаимодействия ДНК-нуклеазы репарации двухцепочечных разрывов Mre11 и Rad50-АТФазы». Cell. 105 (4): 473–85. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (01) 00335-X. PMID   11371344. S2CID   15913630.
• Питтс С.А., Куллар Х.С., Станкович Т., Стюарт Г.С., Ласт Джи, Беденхэм Т. и др. (Май 2001 г.). «hMRE11: геномная структура и нулевая мутация, идентифицированная в транскрипте, защищенном от нонсенс-опосредованного распада мРНК». Молекулярная генетика человека. 10 (11): 1155–62. DOI : 10.1093 / HMG / 10.11.1155. PMID   11371508.
• Чиба Н., Парвин Дж. Д. (октябрь 2001 г.). «Перераспределение BRCA1 среди четырех различных белковых комплексов после блокировки репликации». Журнал биологической химии. 276 (42): 38549–54. DOI : 10.1074 / jbc.M105227200. PMID   11504724.
• Beikzadeh M, Latham MP (октябрь 2020 г.). «Динамическая природа комплекса репарации разрывов ДНК Mre11-Rad50». Прогресс в биофизике и молекулярной биологии. 163: 14–22. DOI : 10.1016 / j.pbiomolbio.2020.10.007. PMC  8065065. PMID   33121960.