KCTD7

KCTD7
Идентификаторы
Псевдонимы	KCTD7, CLN14, EPM3, домен тетрамеризации калиевого канала, содержащий 7
внешних идентификаторов	OMIM: 611725 MGI: 2442265 HomoloGene: 17687 Генные карты: KCTD7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек) Полоса 7q11.21 Начало 66,628,767 bp Конец 66,649,067 bp
Расположение гена (мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь) Band 5 | 5 G1.3 Start 130,144,861 bp End 130,155,806 bp
Онтология генов Молекулярная функция •GO : 0001948 связывание с белками. клеточный компонент •мембрана. •цитозоль. •цитоплазма. •клеточная мембрана. биологический процесс •гомоолигомеризация белков. •посттрансляционная модификация. •гомеостаз клеточного иона калия. •положительная регуляция активности транспортера. •гиперполяризация мембраны. •гомеостаз глутамата. Источники: Amigo / QuickGO
Orthologs
Виды	Человек	Мышь
Entrez	154881	212919
Ensembl	ENSG00000243335	ENSMUSG00000034110
UniProt	Q96MP8	Q8BJK1
RefSeq (mRNA_1530113>NMEA_1530113>

Домен тетрамеризации калиевого канала, содержащий 7, представляет собой белок у человека, который кодируется геном KCTD7 . Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскрипции.

• 1 Описание
• 2 Функция
• 3 Клиническая значимость
• 4 Ссылки
• 5 Дополнительная литература

Ген KCTD7 кодирует член семейство белков, содержащих домен тетрамеризации калиевых каналов. Члены семейства идентифицируются на структурной основе и содержат аминоконцевой домен, аналогичный домену T1, присутствующему в потенциалзависимом калиевом канале. KCTD7 отображает первичную последовательность и профиль гидропатии, указывающие на внутрицитоплазматическую локализацию. Анализ базы данных EST показал, что KCTD7 экспрессируется в мозге человека и мыши.

Экспрессия KCTD7 гиперполяризует клеточную мембрану и снижает возбудимость трансфицированных нейронов в экспериментах patch clamp. МРНК и белок KCTD7 экспрессируются в нейронах гиппокампа, глубоких слоях коры головного мозга и клетках Пуркинье мозга мыши, как показано гибридизацией in situ и иммуногистохимические эксперименты. Тесты иммунопреципитации демонстрируют, что KCTD7 способен проявлять особую активность и напрямую взаимодействует с кулином-3 (CUL3 ), компонентом комплекса убиквитинлигазы. Считается, что эти взаимодействия опосредуются через домен BTB / POZ KCTD7. Однако KCTD7 не обнаруживает никакого взаимодействия cullin-1 (CUL1 ). Анализы иммунопреципитации также показывают, что KCTD7 не взаимодействует с Ubiquitin-flag, что позволяет предположить потенциальную роль KCTD7 в комплексе убиквитин-лигазы, не будучи сам по себе подверженным uiquitination. Иммунофлуоресцентная микроскопия показывает цитозольную экспрессию рекомбинантного белка GFP -KCTD7 в трансфицированных клетках COS-7.

Одна из возможных гипотез состоит в том, что KCTD7 косвенно регулирует уровень мембранной экспрессии калиевый канал. Путем конъюгирования с комплексом кулин-3 убиквитин-лигаза KCTD7 может модулировать уровень экспрессии негативного регулятора калиевого канала. Следовательно, сверхэкспрессия KCTD7 в нейронах будет увеличивать деградацию этой регуляторной молекулы, приводя к увеличению тока калия через клеточную мембрану, как это наблюдается в экспериментах с зажимом заплатки.

В культивируемых клетках гиппокампа мыши экспрессия обнаруживается в клеточной соме, в варикозном расширении нейритов вдоль развивающихся отростков нейронов и в конусах роста нейритов, но не в ядре. Kctd7 широко экспрессируется в нейронах интактного мозга мыши, в том числе в нейронах коры, в слоях гранулярных и пирамидных клеток гиппокампа и в клетках Пуркинье мозжечка. Однако не все нейрональные клетки иммунопозитивны по отношению к Kctd7, и экспрессия не наблюдается в астроцитах или микроглиальных клетках. Экспрессия в лизатах мозжечка постоянна от Р5 до 2 месяцев. Сверхэкспрессия KCTD7 в клетках HeLa и COS-1, которые не экспрессируют эндогенный KCTD7, демонстрирует диффузную цитозольную локализацию без совместной локализации с маркерами эндосом, ER, Гольджи, лизосом или цитоскелета.

Помимо домена BTB / POZ KCTD7, другие остатки имеют решающее значение для его правильного взаимодействия с кулином-3. Кроме того, в мозге мышей экспрессируется изоформа Kctd7 полной длины 31 кДа. Другие основные иммунореактивные полосы включали виды массой 28 кДа в селезенке, печени и почках, виды массой 37 кДа в почках и формы массой 62 кДа, наиболее вероятно соответствующие стабильному димеру. Наличие нескольких полос соответствовало альтернативному сплайсингу и тканеспецифической регуляции.

У 3 больных членов большой кровной марокканской семьи с прогрессирующей миоклонической эпилепсией -3 была обнаружена гомозиготная нонсенс-мутация в гене KCTD7 (R99X).

У 2 мексиканских братьев и сестер с младенческим началом прогрессирующей миоклонической эпилепсии и патологическими признаками нейронального цероидного липофусциноза в нескольких типах клеток была выявлена ​​гомозиготная мутация в гене KCTD7 (R184C). Мутация была идентифицирована путем секвенирования всего экзома и подтверждена секвенированием по Сэнгеру. Этот фенотип был идентифицирован как CLN14. Мутации KCTD7 не были обнаружены в 32 дополнительных образцах CLN.

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.