Путь Imd

редактировать
Упрощенная диаграмма передачи сигналов Imd, найденная в плодовой мушке.

Путь Imd широко консервативный NF-κB иммунный сигнальный путь насекомых и некоторых членистоногих, который регулирует мощный антибактериальный защитный ответ. Путь назван в честь открытия мутации, вызывающей тяжелый иммунный дефицит (ген был назван «Imd» от «иммунодефицита»). Путь Imd был впервые обнаружен в 1995 году с использованием дрозофилы Drosophila Bruno Lemaitre и его коллегами, которые позже также обнаружили, что ген Drosophila Toll регулирует защиту против Gram- положительные бактерии и грибки. Вместе пути Toll и Imd сформировали парадигму иммунной сигнализации насекомых; По состоянию на 2 сентября 2019 года эти две важные статьи об открытии были процитированы вместе более 5000 раз с момента публикации в Google Scholar.

Путь Imd реагирует на сигналы, производимые грамотрицательными бактериями. Пептидогликан узнающие белки (PGRP) воспринимают пептидогликан типа DAP, который активирует каскад передачи сигналов Imd. Это завершается транслокацией фактора транскрипции NF-κB Relish, что приводит к продукции антимикробных пептидов и других эффекторов. Насекомые, у которых отсутствует передача сигналов Imd естественным путем или путем генетических манипуляций, чрезвычайно восприимчивы к заражению широким спектром патогенов и особенно бактериями.

Содержание
  • 1 Сходство с сигнальными путями человека
    • 1.1 Сходство с передачей сигналов TNFR
  • 2 Передача сигналов Imd у дрозофил
    • 2.1 Белки распознавания пептидогликанов (PGRP)
    • 2.2 Внутриклеточные сигнальные компоненты
    • 2.3 Антимикробный ответ, опосредованный Imd
  • 3 Сохранение пути Imd у насекомых
    • 3.1 Перекрестные помехи между сигнальными путями Imd и Toll
    • 3.2 Насекомые и членистоногие, лишенные передачи сигналов Imd
  • 4 Ссылки
Сходство с сигнальными путями человека

Путь Imd имеет ряд сходств с передачей сигналов TNFR млекопитающих, хотя многие из внутриклеточных регуляторных белков передачи сигналов Imd также имеют гомологию с различными сигнальными каскадами человеческих Toll-подобных рецепторы.

Сходство с передачей сигналов TNFR

Следующие гены аналогичны или гомологичны между Drosophila melanogaster (выделено жирным шрифтом) и передачей сигналов человеческого TNFR1 :

  • Imd : ортолог человека = RIP1
  • Tak1 : ортолог человека = Tak 1
  • TAB2 : человеческий ортолог = TAB2
  • Dredd : человеческий ортолог = каспаза-8
  • FADD : человеческий ортолог = FADD
  • Ключ / Ikkγ : человек ортолог = NEMO
  • Ird5 : ортолог человека = IKK2
  • Смак : ортологи человека = p65 / p50 и IκB
  • Iap2 : ортолог человека = cIAP2
  • UEV1a : человеческий ортолог = UEV1a
  • bend : человеческий ортолог = UBC13
передача сигналов Imd у дрозофил

В то время как точный эпистаз компонентов передачи сигналов пути Imd постоянно исследуется, механистический порядок многих ключевых компонентов пути хорошо установлен. В следующих разделах обсуждается передача сигналов Imd, обнаруженная у Drosophila melanogaster, где она исключительно хорошо охарактеризована. Передача сигналов Imd активируется серией этапов от распознавания бактериального вещества (например, пептидогликана) до передачи этого сигнала, ведущего к активации фактора транскрипции NF-κB Relish. Затем активированный Relish образует димеры, которые перемещаются в ядро ​​и связываются с ДНК, что приводит к транскрипции антимикробных пептидов и других эффекторов.

Белки распознавания пептидогликанов (PGRP)

Восприятие бактериальных сигналов осуществляется с помощью белка распознавания пептидогликана LC (PGRP-LC), трансмембранного белка с внутриклеточным доменом. Связывание бактериального пептидогликана приводит к димеризации PGRP-LC, которая создает конформацию, необходимую для связывания и активации белка Imd. Однако альтернативные изоформы PGRP-LC также могут экспрессироваться с различными функциями: PGRP-LCx распознает полимерный пептидогликан, в то время как PGRP-LCa не связывает пептидогликан напрямую, а действует вместе с PGRP-LCx, связывая мономерные фрагменты пептидогликана (называемые трахеальный цитотоксин или «ТСТ»). Другой PGRP (PGRP-LE) также действует внутриклеточно, связывая TCT, который пересек клеточную мембрану или возник в результате внутриклеточной инфекции. PGRP-LA способствует активации передачи сигналов Imd в эпителиальных клетках, но механизм до сих пор неизвестен.

Другие PGRP могут ингибировать активацию передачи сигналов Imd путем связывания бактериальных сигналов или ингибирования сигнальных белков хозяина: PGRP-LF является трансмембранный PGRP, у которого отсутствует внутриклеточный домен и который не связывает пептидогликан. Вместо этого PGRP-LF образует димеры с PGRP-LC, предотвращая димеризацию PGRP-LC и, следовательно, активацию передачи сигналов Imd. Ряд секретируемых PGRP обладают амидазной активностью, которая подавляет путь Imd путем расщепления пептидогликана на короткие неиммуногенные фрагменты. К ним относятся PGRP-LB, PGRP-SC1A, PGRP-SC1B и PGRP-SC2. Кроме того, PGRP-LB является основным регулятором в кишечнике.

Компоненты внутриклеточной передачи сигналов

Плодовые мушки инфицированы бактериями, продуцирующими GFP. Красные глаза мухи, лишенные генов антимикробных пептидов, восприимчивы к инфекции, в то время как у белоглазых мух наблюдается иммунный ответ дикого типа.

Основным внутриклеточным сигнальным белком является Imd, белок, содержащий домен смерти, который связывается с FADD и Dredd образуют комплекс. Dredd активируется после убиквитинирования комплексом Iap2 (включающим Iap2, UEV1a, bend и eff), что позволяет Dredd расщеплять 30 остатков N-конца Imd, что позволяет ему также убиквитинировать с помощью Iap2. После этого комплекс Tak1 / TAB2 связывается с активированной формой Imd и впоследствии активирует комплекс IKKγ / Ird5 посредством фосфорилирования. Этот комплекс IKKγ активирует Relish путем фосфорилирования, что приводит к расщеплению Relish и тем самым продуцирует как N-концевые, так и C-концевые фрагменты Relish. N-концевые фрагменты Relish димеризуются, что приводит к их транслокации в ядро, где эти димеры связываются с сайтами связывания NF-κB семейства Relish. Связывание Relish способствует транскрипции эффекторов, таких как антимикробные пептиды.

Хотя Relish является неотъемлемой частью транскрипции эффекторов пути Imd, существует дополнительное взаимодействие с другими путями, такими как Toll и JNK. Комплекс TAK1 / TAB2 является ключом к распространению внутриклеточной передачи сигналов не только пути Imd, но также пути JNK. В результате у мутантов по передаче сигналов JNK резко снижена экспрессия антимикробных пептидов пути Imd.

Антимикробный ответ, опосредованный Imd

Передача сигналов Imd регулирует ряд эффекторных пептидов и белков, которые продуцируются в массирование после иммунного вызова. Сюда входят многие из основных антимикробных пептидных генов дрозофилы, в частности: диптерицин, аттацин, дрозоцин, цекропин и Дефенсин. Антимикробный ответ после активации Imd в значительной степени зависит от продукции антимикробных пептидов, поскольку у мух, лишенных этих пептидов, наблюдается серьезный иммунодефицит.

Сохранение пути Imd у насекомых
Гороховая тля потеряла передачу сигналов Imd

Путь Imd, по-видимому, развился у последнего общего предка многоножек и насекомых. Однако некоторые линии насекомых с тех пор утратили основные компоненты передачи сигналов Imd. Первый обнаруженный и самый известный пример - гороховая тля Acyrthosiphon pisum. Считается, что тли, питающиеся растениями, утратили передачу сигналов Imd, поскольку они несут ряд бактериальных эндосимбионтов, включая как питательные симбионты, которые будут нарушены аберрантной экспрессией антимикробных пептидов, так и защитные симбионты, которые покрывают некоторые из иммунный дефицит, вызванный потерей передачи сигналов Imd. Также было высказано предположение, что антимикробные пептиды, нижестоящие компоненты передачи сигналов Imd, могут быть вредными для приспособленности и потеряны насекомыми, питающимися исключительно растениями.

Перекрестные помехи между сигнальными путями Imd и Toll

В то время как пути передачи сигналов Toll и Imd у Drosophila обычно изображаются как независимые для пояснительных целей, основная сложность передачи сигналов Imd включает ряд вероятных механизмов, в которых передача сигналов Imd взаимодействует с другими путями передачи сигналов, включая Toll и JNK. В то время как парадигма Toll и Imd как в значительной степени независимая, обеспечивает полезный контекст для изучения иммунной передачи сигналов, универсальность этой парадигмы применительно к другим насекомым была поставлена ​​под сомнение. У Plautia stali stinkbugs подавление генов Toll или Imd одновременно приводит к снижению активности классических эффекторов Toll и Imd обоих путей.

Насекомые и членистоногие, лишенные передачи сигналов Imd

Ссылки
  1. ^ Palmer, William J.; Джиггинс, Фрэнсис М. (август 2015 г.). «Сравнительная геномика раскрывает происхождение и разнообразие иммунных систем членистоногих». Молекулярная биология и эволюция. 32 (8): 2111–2129. doi : 10.1093 / molbev / msv093. PMC 4833078. PMID 25908671.
  2. ^Hoffmann, J. A.; Reichhart, J.M.; Georgel, P.; Meister, M.; Nicolas, E.; Michaut, L.; Kromer-Metzger, E.; Леметр, Б. (1995-10-10). «Рецессивная мутация, иммунодефицит (imd), определяет два различных пути контроля в защите хозяина дрозофилы». Труды Национальной академии наук. 92 (21): 9465–9469. Bibcode : 1995PNAS... 92.9465L. doi : 10.1073 / pnas.92.21.9465. PMC 40822. PMID 7568155.
  3. ^Lemaitre, B.; Nicolas, E.; Michaut, L.; Reichhart, J.M.; Хоффманн, Дж. А. (1996-09-20). «Кассета дорсовентрального регуляторного гена spätzle / Toll / cactus контролирует мощный противогрибковый ответ у взрослых особей дрозофилы» (PDF). Cell. 86 (6): 973–983. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 80172-5. PMID 8808632. S2CID 10736743.
  4. ^«Рецессивная мутация, иммунодефицит (imd), определяет два различных пути контроля в защите хозяина дрозофилы». Google Scholar. Проверено 2 сентября 2019 г.
  5. ^«Кассета дорсовентрального регуляторного гена spätzle / Toll / cactus контролирует мощный противогрибковый ответ у взрослых дрозофил». Google Scholar. Проверено 2 сентября 2019 года.
  6. ^ Lemaitre, Bruno; Хоффманн, Жюль (2007). "Защита хозяина Drosophila melanogaster". Ежегодный обзор иммунологии. 25 : 697–743. doi : 10.1146 / annurev.immunol.25.022106.141615. PMID 17201680.
  7. ^ Myllymäki, H.; Valanne, S.; Рэмет, М. (2014). "Сигнальный путь Imd Drosophila". Журнал иммунологии. 192 (8): 3455–62. doi : 10.4049 / jimmunol.1303309. PMID 24706930.
  8. ^ «UniProtKB - Q9GYV5 (NEMO_DROME)». Uniprot.org. Семейство Interpro: IPR034735 NEMO_ZF
  9. ^Zaidman-Rémy, A.; Эрве, М.; Poidevin, M.; Pili-Floury, S.; Kim, M. S.; Blanot, D.; О, Б. Х.; Ueda, R.; Mengin-Lecreulx, D.; Леметр, Б. (2006). «Амидаза дрозофилы PGRP-LB модулирует иммунный ответ на бактериальную инфекцию» (PDF). Иммунитет. 24 (4): 463–73. doi : 10.1016 / j.immuni.2006.02.012. PMID 16618604.
  10. ^Delaney, Joseph R.; Стёвен, Свенья; Увелл, Ханна; Андерсон, Кэтрин В.; Энгстрём, Илва; Млодзик, Марек (2006). «Совместное управление иммунными ответами дрозофилы с помощью сигнальных путей JNK и NF-κB». Журнал EMBO. 25 (13): 3068–3077. doi : 10.1038 / sj.emboj.7601182. PMC 1500970. PMID 16763552.
  11. ^De Gregorio, E.; Spellman, P.T.; Tzou, P.; Рубин, Г. М.; Леметр, Б. (2002). «Пути Toll и Imd являются основными регуляторами иммунного ответа у дрозофилы». Журнал EMBO. 21 (11): 2568–79. doi : 10.1093 / emboj / 21.11.2568. PMC 126042. PMID 12032070.
  12. ^Imler, JL; Булет, П (2005). «Антимикробные пептиды у дрозофилы: структуры, активности и регуляция генов». Chem Immunol Allergy. Химическая иммунология и аллергия. 86 : 1–21. DOI : 10.1159 / 000086648. ISBN 3-8055-7862-8. PMID 15976485.
  13. ^Хансон, Массачусетс; Досталова, А; Ceroni, C; Пойдевин, М; Кондо, S; Леметр, B (2019). «Синергизм и замечательная специфичность антимикробных пептидов in vivo с использованием подхода систематического нокаута». eLife. 8 : e44341. doi : 10.7554 / eLife.44341. PMC 6398976. PMID 30803481.
  14. ^ Херардо, Николь М.; Алтынчичек, Боран; Ансельм, Кэролайн; Атамян, Акоп; Barribeau, Seth M.; де Вос, Мартин; Дункан, Элизабет Дж.; Эванс, Джей Д.; Габальдон, Тони (2010). "Иммунитет и другие защитные механизмы гороховой тли, Acyrthosiphon pisum". Геномная биология. 11 (2): R21. DOI : 10.1186 / gb-2010-11-2-r21. PMC 2872881. PMID 20178569.
  15. ^Хэнсон, Марк Остин; Леметр, Бруно; Unckless, Роберт Л. (2019). «Динамическая эволюция антимикробных пептидов подчеркивает компромисс между иммунитетом и экологической пригодностью». Границы иммунологии. 10 : 2620. doi : 10.3389 / fimmu.2019.02620. ISSN 1664-3224. PMC 6857651. PMID 31781114.
  16. ^Nishide, Y.; Kageyama, D.; Yokoi, K.; Jouraku, A.; Tanaka, H.; Futahashi, R.; Фукацу, Т. (2019). «Функциональные перекрестные помехи между IMD и Toll-путями: понимание эволюции неполных иммунных каскадов». Труды Королевского общества B: биологические науки. 286 (1897): 20182207. doi : 10.1098 / rspb.2018.2207. PMC 6408883. PMID 30963836.
  17. ^Benoit, J.B.; Adelman, Z. N.; Reinhardt, K.; Долан, А.; Poelchau, M.; Jennings, E.C.; Szuter, E.M.; Hagan, R.W.; Gujar, H.; Shukla, J. N.; Zhu, F.; Mohan, M.; Nelson, D. R.; Rosendale, A.J.; Derst, C.; Резник, В.; Wernig, S.; Menegazzi, P.; Wegener, C.; Peschel, N.; Хендершот, Дж. М.; Blenau, W.; Predel, R.; Johnston, P.R.; Ioannidis, P.; Waterhouse, R.M.; Nauen, R.; Schorn, C.; Ott, M.C.; и другие. (2016). «Уникальные особенности глобального эктопаразита человека, выявленные путем секвенирования генома постельного клопа». Nature Communications. 7 : 10165. Bibcode : 2016NatCo... 710165B. doi : 10.1038 / ncomms10165. PMC 4740739. PMID 26836814.
  18. ^Сантос-Матос, Гонсало; Wybouw, Ники; Мартинс, Нельсон Э.; Зеле, Флора; Рига, Мария; Leitão, Alexandre B.; Вонтас, Джон; Грбич, Миодраг; Ван Леувен, Томас; Магальяйнс, Сара; Сусена, Элио (2017). «Клещи Tetranychus urticae не вызывают индуцированного иммунного ответа против бактерий». Труды Королевского общества B: биологические науки. 284 (1856): 20170401. doi : 10.1098 / rspb.2017.0401. PMC 5474072. PMID 28592670.
Последняя правка сделана 2021-05-23 12:04:14
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте