Гаплогруппа G-P303

редактировать
Гаплогруппа G-P303 (G2a2b2a)
Возможное время происхожденияболее 11000 лет назад
Возможное место происхожденияВозможно Кавказ или Иран
ПредокГаплогруппа G2a2b2 (CTS2488)
ПотомкиG2a2b2a1, G2a2b2a2, G2a2b2a3, G2a2b2a4
Определение мутацийP303 или S135 (G2a2b2a)

В генетике человека, гаплогруппа (гаплогруппа 14 G-P303 149>G2a2b2a, ранее G2a3b1) является Y-хромосомой гаплогруппой. Это ветвь гаплогруппы G (Y-ДНК) (M201). В порядке убывания G-P303 дополнительно является ветвью G2 (P287), G2a (P15), G2a2, G2a2b, G2a2b2 и, наконец, G2a2b2a. Эта гаплогруппа представляет большинство мужчин гаплогруппы G в большинстве областей Европы к западу от России и Черного моря. На востоке G-P303 встречается среди G людей на Ближнем Востоке, Иране, в районе Южного Кавказа, Китае и Индии. G-P303 демонстрирует наибольшее разнообразие в Леванте.

Содержание
  • 1 Генетические особенности
  • 2 Датирование происхождения G-P303
  • 3 Географическое распространение в Старом Свете
    • 3.1 Концентрации G-P303 в определенных сайты
  • 4 G-P303 + *
    • 4.1 G-L140
      • 4.1.1 G-U1 и его подгруппы
        • 4.1.1.1 G-L13 / S13
        • 4.1.1.2 G-L1266
      • 4.1.2 Подгруппы G-L497
      • 4.1.3 G-Z725
      • 4.1.4 G-L43 + / S147 +, L42- / S146-
      • 4.1.5 G-L43 + / S147 +, L42 + / S146 +
      • 4.1.6 DYS391 = 7
      • 4.1.7 DYS464a = 9
      • 4.1.8 DYS388 = 15
      • 4.1.9 DYS393 = 12 с генетической близостью
      • 4.1.10 DYS594 = 12 с генетической близостью
    • 4.2 G-Z1903 подгруппа
    • 4.3 G-L660 +, L662 +
  • 5 G-L694 +
  • 6 См. Также
  • 7 Ссылки
  • 8 Внешние ссылки
Генетические особенности

Все мужчины G-P303 несут мутацию P303 или S135 SNP Y-ДНК. Среди мужчин G-P303 есть также некоторые короткие тандемные повторы (STR), которые помогают в их подгруппировке. Многие из мужчин имеют необычное значение 13 для маркера DYS388, а некоторые - 9 для DYS568. Странности маркеров STR часто различаются в каждой подгруппе G-P303, а значения характеристических маркеров могут варьироваться в зависимости от подгруппы. Однако часто значения STR-маркеров DYS391, DYS392 и DYS393 составляют соответственно 10, 11 и 14 или некоторые незначительные отклонения от них для всех мужчин G-P303.

P303 впервые стал доступен для публичного тестирования осенью 2008 года, и обозначение P указывает на то, что он был идентифицирован в Университете Аризоны. Мутация обнаружена на Y-хромосоме в положении 20104736. Прямой праймер - TTCTTATTTGCTTTGAAACTCAG. Обратный праймер - ATTGGCTTATCAGATTGACG. Мутация включает замену T на C. Эта мутация была фактически впервые идентифицирована как S135 в Ethnoancestry в Лондоне, Англия, но потребовалось некоторое время, чтобы понять, что P303, который был идентифицирован независимо, и S135 были одинаковыми.

Датировка происхождения G-P303

Y полностью датирует TMRCA всех P303 в их базе данных 11000 лет назад, а TMRCA с родным братом PF3359 - 14000. Свидания Yfull обычно считаются на четверть слишком молодыми.

Географическое распределение Старого Света

В Европе определяемые подгруппы G-P303 составляют большинство людей гаплогруппы G к западу от России и Черного моря, и небольшое количество также встречается в Северной Африке. В странах Балтии самый низкий процент населения G-P303. Скандинавия похожа, показывая менее половины процентов людей G, замеченных в странах на юге. G-P303, по-видимому, представляет один и тот же процент населения как в центральной, так и в южной Европе, и обычно составляет половину или более от G, наблюдаемого в популяции в этих регионах.

На востоке образцы G-P303 находятся в Северной Африке (Марокко, Тунис, Ливия и Египет ), на Ближнем Востоке ( Израиль (встречается среди евреев, арабов и друзов ), Ливан, Иран (достигая максимума около 15% арабов Хузестана), Турция, Иордания, Саудовская Аравия, Йемен и Дубай ), район Кавказских гор (Армения, Грузия, Азербайджан, кабардинцы, Абазинцы, Узбекистан, и разбросанные среди этнических групп северо-запада Китая и русских Сибири. Существует характерный индийский тип G-P303, но его распространенность неясна. Имеется изолированный образец G-P303 из Малайзии.

Концентрации G- P303 на определенных участках

Наибольший процент лиц G-P303 в описанной дискретной популяции, 86%, находится в Туапсинском районе, Краснодарском крае, Россия среди шапсугов.

В Западной Европе один из самых высоких процентных показателей находится на острове Ибица у восточного побережья Испании. Все доступные образцы G с Ибицы являются типичными образцами G-P303 на основе значений маркера STR. В общей сложности около 16% населения, вероятно, принадлежат к G-P303 на том же основании. Эти образцы включают многих идентифицируемых лиц из подгруппы DYS388 = 13, а также часто встречаются в выборках сефардских евреев. Гаплогруппа G (P303) на Ибице, вероятно, представляет значительную часть населения криптоевреев, которые прибыли туда, спасаясь от испанского изгнания и инквизиции.

Процент гаплогруппы G среди доступных образцов из Уэльс - это преимущественно G-P303. Такой высокий процент не обнаружен в соседних Англии, Шотландии или Ирландии.

G-P303 + *

Звездочка указывает на отрицательное отношение к G-P303. только подгруппа. Эта категория была создана в апреле 2010 года, поскольку было определено, что люди с мутацией SNP L140 составляют отдельную подгруппу G-P303. G-M278, G-Z6885, G-Z30503 и G-L140 являются известными подгруппами

G-L140

Лица, относящиеся к этой категории, имеют мутацию SNP L140. L140 был идентифицирован в ДНК семейного древа в 2009 году, но определение того, что не все люди G-P303 имеют эту мутацию, было сделано только в апреле 2010 года. Эта мутация расположена в позиции хромосомы 7630859 и является делецией.. Основная часть мужчин L140 + принадлежит к подгруппам L140.

G-U1 и его подгруппы

U1 впервые был идентифицирован в Университете Центральной Флориды в 2006 году, но не был описан в публикации до 2009 года. спецификации:.... расположение rs9785956..... прямой праймер - TTTCTGCTCCAAATCTGCTG.... обратный праймер - CACCTGTAATCGGGAGGCTA.... мутация включает изменение с A на G.

Высокий процент все протестированные европейские люди U1 + на данный момент являются положительными для подгруппы, в которой присутствует мутация SNP L13 или S13. Напротив, основная часть неевропейцев (в основном в горах западного Кавказа) принадлежит к подгруппе L1266 группы U1.

G-L13 / S13

Почти все люди с L13 + европейского происхождения имеют значение 12 или 13 для STR-маркера DYS385a и значения 19,20 для STR-маркера YCA. Есть несколько доступных образцов L13 +, в которых отсутствуют эти мутации, и для этих образцов можно предположить общего общего предка, более далекого во времени от других.

SNP L13 / S13 был впервые идентифицирован в Университете Центральной Флориды в 2006 году как SNP U13, но до публикации деталей этого исследования в 2009 году этот SNP был также независимо идентифицирован в 2008 г. в Family Tree DNA в Хьюстоне, Техас, как L13 и в Ethnoancestry в Англии как S13, и предоставлен для публичного тестирования. Технические характеристики представлены как..... Расположение Y-хромосомы rs9786706..... прямой праймер - GTGGTAACAGCTCCTGGTGAG..... обратный праймер - TGCTGCTTTGGTTAACTGTCC... мутация включает изменение с C на T.

Подгруппа L13 наиболее распространена в северной части Центральной Европы и встречается почти во всех местах Европы, где встречаются другие типы G, но эта подгруппа кажется необычной почти во всех странах за пределами Европы. За пределами Европы L13 чаще всего встречается на Ближнем Востоке.

Проект гаплогруппы G указал среди своей большой коллекции G, что вероятные или проверенные образцы STR G-L13 составляют следующие проценты от доступных образцов G в следующих европейских странах [в порядке убывания]:

Германия, 16%..... Италия, 11%..... Нидерланды, 10%..... Франция, 10%..... Польша, 9%..... Испания, 9%..... Ирландия, 6%..... Англия, 5%..... Швейцария, 4%

Существует небольшая, преимущественно английская, подгруппа L13 / S13, обозначенная как L1263. Впервые она была идентифицирована в генеалогическом древе ДНК летом 2012 года и представляет собой мутацию от G до A в позиции хромосомы 8111187.

G-L1266

Мутация L1266 была впервые идентифицирована в ДНК генеалогического древа в июле 2012 г. Ранние признаки указывают на то, что она охватывает высокий процент мужчин U1, которые не принадлежат к подгруппе L13 U1. Мутация L1266 обнаружена в положении 15412419 на хромосоме и представляет собой мутацию от A до G. Некоторые мужчины L1266 также принадлежат к подгруппе L1266, состоящей из мужчин с мутациями L1264, L1265 и L1268. Они были идентифицированы одновременно с L1266 в генеалогическом древе ДНК. L1264 находится в положении 7704368, мутация от A до G; L1265 в положении 12741229, мутация от A до G; и L1268 в положении 20081319, от Т до С.

Подгруппы G-L497

Самая большая подгруппа в Европе, основанная на доступных образцах, - это мужчины, имеющие мутацию L497. Этот SNP был впервые идентифицирован в январе 2011 г. при тестировании в 23andMe и стал доступен для отдельного тестирования в L497 службой Family Tree DNA. Положения хромосом указаны как 15932714 и rs35141399, а мутация - от C до T. Прямой праймер - ATGAGTGGCCTCACCAAGGGAATC, обратный праймер - ATGGGCAACAGGTGTCCTGAAG.

У большого процента мужчин с L497 значение 13 по шкале STR DYS388. Это редкая мутация по сравнению с наследственной ценностью 12. Очень небольшое количество мужчин в этой подгруппе DYS388 = 13, похоже, снова мутировало до 12 или 14. Географическое распространение этой 13 мутации и других особенностей было впервые описано в в 2007 году. Процент DYS388 = 13 мужчин в выборке G особенно высок в северо-западной Европе. Некоторые подгруппы DYS388 = 13, представленные ниже, основаны на мутациях SNP, а другие - на странностях значений маркеров STR.

Большинство мужчин L497 принадлежат к его подгруппе Z725.

Проект гаплогруппы G указал среди своей большой коллекции G, что вероятные или проверенные образцы STR из типа DYS388 = 13 составляют следующий процент доступных образцов G в следующих странах [в порядке убывания]:

Швейцария, 74%..... Испания, 60%..... Франция, 58%.... Германия, 57%..... Англия, 54%.... Ирландия, 48 %..... Нидерланды, 45%..... Италия, 43%.... Польша, 29%.... Индия, 0%

Польский процент DYS388 = 13 мужчин составляет уменьшилось исключительно из-за происхождения значительной группы G2c мужчин в этой стране. Без группы G2c DYS388 = 13 составляет 50%. Немецкие образцы G гораздо более многочисленны в юго-западной части страны.

Основываясь на значениях маркеров, единственная неевропейская выборка DYS388 = 13, обнаруженная из Старого Света и имеющая аналогичные значения маркера STR с европейцами, - это одна выборка из Египта. И единственные подтвержденные SNP мужчины L497 + за пределами Европы в проекте гаплогруппы G имеют турецкое происхождение.

Малочисленность проверенных образцов, полученных за пределами Европы, пока оставляет открытой возможность, что эта мутация DYS388 возникла у европейца.

G-Z725

Z725 был впервые идентифицирован гражданским исследователем среди данных для единственной выборки в рамках проекта 1000 геномов летом 2011 года, но только летом 2012 г., что это было подтверждено тестированием в Family Tree DNA как отдельная подгруппа. Эта подгруппа L497 является наиболее распространенной подгруппой G в Европе, потому что высокий процент мужчин L497 также относятся к Z725 +. Z725 обнаружен в позиции 7957070 хромосомы и представляет собой делецию.

G-L43 + / S147 +, L42- / S146-

Эта подгруппа встречается редко, потому что практически все протестированные на данный момент люди L43 + / S147 + также относятся к L42 + / S146 +.

SNP был впервые идентифицирован в списке результатов тестирования SNP по адресу 23andMe. Он был независимо разработан как отдельный тест как Family Tree DNA как L43, так и Ethnoancestry как S147. Осенью 2009 года тест на 23andMe впервые предоставил информацию о том, что у человека, у которого была мутация L43, одновременно отсутствовала мутация L42, которая обычно встречается с L43. Эта аномалия была подтверждена тестированием того же человека в Family Tree DNA. Так что L43 + / S147 + теперь отдельная категория. Технические характеристики L43 следующие: Расположение Y-хромосомы 16446759.... прямой праймер - GAGGTTTTCGGAGCTTACCTATAC.... обратный праймер - CACTGCTTGTAGATAGTAAAGTTTG..... мутация включает изменение с A на G.

G -L43 + / S147 +, L42 + / S146 +

Примерно четверть из DYS388 = 13 мужчин имеют эту мутацию L42 / S146. Швейцарские мужчины с большей вероятностью принадлежат к этой подгруппе. L42 / S146 может быть почти таким же старым, как мутация DYS388 = 13, исходя из количества различий в значениях, наблюдаемых в образцах STR с 67 маркерами.

SNP был впервые идентифицирован в списке результатов тестирования SNP по адресу 23andMe. Он был независимо разработан как отдельный тест Family Tree DNA как L42 и Ethnoancestry как S146. Технические характеристики этого SNP следующие:.... положение на Y-хромосоме - 15170153..... прямой праймер - CTCACAATAGGCAGCATCCCCTCAG..... обратный праймер - CAGAAAAAGGGAGCATATGACCAAGG..... мутация включает изменение от C на A.

DYS391 = 7

Эта многозначная (многоступенчатая) мутация STR-маркера DYS391 до значения 7 из исходных 10 обнаружена в группе испаноязычных мужчины.

DYS464a = 9

Эта многозначная (многоступенчатая) мутация STR-маркера DYS464a до значения 9 обнаружена пока только у мужчин из Швейцарии и Германии.

DYS388 = 15

Эта небольшая подгруппа состоит из мужчин, чей предок изменил два значения STR-маркера DYS388 на 15. Члены этой подгруппы должны иметь другие значения маркеров, аналогичные людям в общем DYS388. = 13 подгруппа. Пока только люди английского происхождения принадлежат к этой подгруппе DYS388 = 15. Маркер DYS388 редко мутирует, и двухступенчатая (двухзначная) мутация почти так же важна, как и мутация SNP для идентификации лиц в этой отличительной подгруппе.

DYS393 = 12 с генетической близостью

Эта небольшая подгруппа состоит из мужчин, чей предок мутировал по STR-маркеру DYS393 до 12. Это значение маркера необычно низкое для людей G. Лица с этой находкой, судя по имеющимся данным, сообщают о своем происхождении в основном с Кипра.

DYS594 = 12 с генетической близостью

В то время как мутация со значением 12 из 10 или 11 наблюдается в основном в этой группе, существует несколько DYS594 = 12 мужчин, которые не принадлежат к группа. Мужчины в этой группе образуют особый кластер людей с тесно связанными значениями маркеров STR в дополнение к странности DYS594. Эта подгруппа DYS594 = 12 имеет необычно высокий процент валлийских фамилий, а остальные в основном имеют английское происхождение, основываясь на доступных образцах.

Подгруппа G-Z1903

Мужчины Z1903 на данный момент все имеют значение 9 для маркера STR DYS568 и менее надежно 20,21 для маркера YCA вместе с тесной взаимосвязью, основанной на значениях маркера STR. Причина, по которой DYS568 = 9 может использоваться в качестве обычно надежного значения категоризации, заключается в том, что это представляет собой многоступенчатую мутацию в очень медленно мутирующем маркере. Хотя это и не является предметом исследования, возраст мутации DYS568 до 9 лет мог составлять около 3000 лет. назад на основе количества разностей значений маркеров для 67-маркерных выборок STR. И мутация 20,21 в YCA возникла бы в тот же самый общий период времени. Лица в группе DYS568 = 9, которые были протестированы на маркер GATA-A10, имели значения на один или несколько выше, чем в других подгруппах гаплогруппы G. Те из кластера Ашкенази имели самые высокие значения 14. Потребуются дополнительные результаты, чтобы определить, согласуются ли эти выводы в группе DYS568 = 9.

Практически все мужчины Z1903 + имеют дополнительную мутацию Z724. Мужчины Z1903 + и Z724- составляют лишь небольшую группу внутри Z1903 и пока являются только испаноязычными мужчинами. Z1903 и Z724 были идентифицированы в 2011 году в двух образцах в рамках проекта 1000 Genomes Project : один из Юты в США, а другой из Пекин, Китай. Z1903 обнаружен в положении 15106340 хромосомы и представляет собой мутацию от A до G. Z724 обнаружен в положении 6895545 и представляет собой мутацию от C до T. SNP серии Z были идентифицированы исследователями-добровольцами.

Ни один человек из Z1903 до сих пор не находился на Ближнем Востоке или в регионе Анатолии, где гаплогруппа G может быть необычно распространена. Несколько образцов, однако, были обнаружены среди осетин в центральных Кавказских горах и в выборке из Пекина Китая. Хотя мужчины Z1903 обнаружены по всей Европе, они пока отсутствуют в скандинавских образцах к северу от Дании.

Эта подгруппа Z1903 / Z724 содержит еще одну большую подгруппу, состоящую из евреев ашкенази, которые относительно тесно связаны между собой на основании значений маркера STR и обычно имеют значение 16 для маркера DYS385b. Еврейский кластер, похоже, не имеет общего предка с мужчинами-неевреями нынешней эры. А общий предок мужчин ашкенази Z1903, вероятно, жил в средние века, судя по небольшой разнице в значениях маркеров STR, наблюдаемой между ними. См. Также страницу, посвященную евреям с гаплогруппой G (Y-ДНК).

. Есть еще одна, меньшая подгруппа людей Z1903, у которых значение 9 по STR-маркеру DYS439. Исходное значение для этого маркера составляет 12 в группе DYS568 = 9, и это 9 представляет собой редкую многоступенчатую мутацию. Эта подгруппа DYS439 = 9 является преимущественно немецкой, и возраст мутации, вероятно, превышает 2000 лет, исходя из количества различий в значениях маркеров в 67-маркерных выборках STR.

Проект Haplogroup G указал среди своей большой коллекции G, что вероятные или доказанные образцы DYS568 = 9 составляют следующий процент доступных образцов G в следующих странах [в порядке убывания]:

Ирландия, 12%..... Англия, 9%..... Нидерланды, 5%..... Польша, 5%..... Италия, 4%..... Германия, 3%..... Испания, 3%... Франция, 2%

Внутри подгруппы Z724 находится подгруппа G-L640 +. В настоящее время это небольшая группа мужчин с Британских островов. Этот SNP был идентифицирован летом 2011 года в Family Tree DNA. Он представляет собой мутацию от A до G и находится в положении 16903082 на Y-хромосоме. Большинство, если не все, эти мужчины L640 + также имеют значение 8 при маркере DY533, что в остальном редко встречается среди мужчин Z724.

G-L660 +, L662 +

Эта подгруппа небольшая и пока встречается только у европейцев. Оба вовлеченных SNP были впервые идентифицированы в генеалогическом древе ДНК летом 2011 года. L660 обнаружен в позиции 12511525 на Y-хромосоме и представляет собой изменение с C на A. L662 находится в позиции 16446702 и представляет собой изменение с C на T.

G-L694 +

Люди в этой подгруппе имеют мутацию L694, которая была обнаружена в ДНК семейного древа летом 2011 года. До сих пор эта мутация была обнаружена в основном у польских мужчин.. Он расположен в позиции 5734987 на Y-хромосоме и представляет собой инсерционную мутацию.

См. Также
Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-22 13:09:14
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте