Флагеллин | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Гомологичный флагеллин Salmonella, имеющий спиральное ядро D0 / D1, а также удлинение D3 (PDB 1io1). | |||||||
Идентификаторы | |||||||
Организм | E. coli | ||||||
Symbol | FliC | ||||||
UniProt | P04949 | ||||||
|
Flagellin | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | Флагеллин | ||||||||
Pfam | PF00700 | ||||||||
InterPro | IPR001492 | ||||||||
SCOPe | 1ucu / SUPFAM | ||||||||
|
Флагеллин представляет собой глобулярный белок, который располагается в полом цилиндре, образуя нить в бактерии жгутик. Он имеет массу от 30 000 до 60 000 дальтон. Флагеллин является основным компонентом жгутика бактерий и присутствует в больших количествах почти на всех жгутиковых бактериях.
Структура флагеллина отвечает за спиральную форму филамента жгутика, которая важна для его правильного функционирования. Он транспортируется через центр нити к кончику, где самопроизвольно полимеризуется в часть нити. Он разворачивается шапероном жгутиковой секреции FliS (P26608 ) во время транспортировки. Нить состоит из одиннадцати более мелких «протофиламентов», девять из которых содержат флагеллин в форме L-типа, а два других - в форме R-типа.
Спиральная N- и С-концы флагеллина образуют внутреннее ядро белка флагеллина и отвечают за способность флагеллина полимеризоваться в филамент. Средние остатки составляют внешнюю поверхность филамента жгутика. В то время как концы белка у всех бактериальных флагеллинов довольно похожи, средняя часть сильно варьирует и может отсутствовать у некоторых видов. Домены флагеллина пронумерованы от спирального ядра (D0 / D1) до внешнего (D2,...); если смотреть со стороны аминокислотной последовательности, D0 / D1 появляется на двух концах. Флагеллин-подобные структурные белки обнаружены в других частях жгутика, таких как крючок (flgE; P75937 ), стержень у основания и колпачок вверху.
средняя часть флагеллина E. coli (и родственного ему), D3, имеет складку и, по-видимому, поддерживает стабильность жгутиков.
У млекопитающих часто бывает приобретенные иммунные ответы (ответы Т-клеток и антител ) на флагеллированные бактерии, которые часто возникают на жгутиковые антигены. Также было показано, что флагеллин напрямую взаимодействует с TLR5 на Т-клетках. Некоторые бактерии способны переключаться между несколькими генами флагеллина , чтобы избежать этого ответа.
Склонность иммунного ответа к флагеллину можно объяснить двумя фактами:
Кроме того, 22-аминокислотная последовательность (flg22) консервативного N -концевая часть флагеллина, как известно, активирует защитные механизмы растений. Восприятие флагеллина в Arabidopsis thaliana функционирует через рецептор-подобную киназу FLS2 (FLAGELLIN SENSING 2). При обнаружении flg22 FLS2 быстро связывается с BAK1 (BRI1 -ассоциированная киназа 1) для инициирования передачи сигналов путем реципрокного трансфосфорилирования их киназных доменов. Митоген-активируемые протеинкиназы (MAPK) действуют как нижестоящие сигнальные соединения, что в конечном итоге приводит к запускаемому PAMP иммунитету, в котором более 900 гены активируются / подавляются при обработке flg22.
Предварительная стимуляция синтетическим flg22-пептидом приводила к en сопротивление бактериальным захватчикам.