SATB2

редактировать
SATB2
PDB 1wi3 EBI.jpg
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы SATB2, GLSS, SATB homeobox 2
Внешние идентификаторыOMIM: 608148 MGI: 2679336 HomoloGene: 32249 GeneCards: SATB2
Местоположение гена (человек)
Хромосома 2 (человека)
Chr. Хромосома 2 (человек)
Хромосома 2 (человека) Местоположение генома для SATB2 Местоположение генома для SATB2
Band 2q33.1Start199 269 500 bp
Конец199 471 266 bp
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

23314

212712

Ensembl

ENSG00000119042

ENSMUSG00000038331

UniProt

Q9UPW6

Q8VI24

RefSeq222 (mRNA). NM_001172517. NM_015265

NM_139146. NM_001358580. NM_001358581

RefSeq (белок)

NP_001165980. NP_001165988. NP_31600_03609>NP21500_05609 NP_001345510

Местоположение (UCSC)Chr 2: 199,27 - 199,47 Мб Chr 1: 56,79 - 56,98 Мб PubMed поискВикиданные
Просмотр / редактирование человека View / Edit Mouse

Специальный AT-богатый связывающий последовательность белок 2 (SATB2), также известный как ДНК-связывающий белок SATB2 - это белок, который кодируется у человека геном SATB2 . SATB2 представляет собой ДНК-связывающий белок, который специфически связывает области прикрепления ядерного матрикса и участвует в регуляции транскрипции и ремоделировании хроматина. SATB2 демонстрирует ограниченный способ экспрессии [1] и экспрессируется в определенных клеточных ядрах [2]. Белок SATB2 в основном экспрессируется в эпителиальных клетках толстой и прямой кишки, а затем в ядрах нейронов головного мозга.

Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Структура
  • 3 Клиническая значимость
  • 4 Ссылки
  • 5 Дополнительная литература
  • 6 Внешние ссылки
Функция

При средней распространенности в мире 1/800 живорожденных расщелины ротовой полости являются одним из наиболее распространенных врожденных дефектов. Хотя более 300 синдромов пороков развития могут включать расщелину ротовой полости, несиндромальные формы составляют около 70% случаев с расщелиной губы с волчьей пастью (CL / P) или без нее и примерно в 50%. только в случаях с волчьей пастью (CP). Несиндромальные расщелины ротовой полости считаются «сложными» или «многофакторными» в том смысле, что в этиологию влияют как гены, так и факторы окружающей среды. Текущие исследования показывают, что несколько генов, вероятно, контролируют риск, а также факторы окружающей среды, такие как материнское курение.

Исследования повторного секвенирования для выявления конкретных мутаций показывают, что несколько разных генов могут контролировать риск развития щелей в полости рта, и множество различных вариантов или были обнаружены мутации в очевидно причинных генах, отражающие высокую степень аллельной гетерогенности. Хотя большинство из этих мутаций чрезвычайно редки и часто демонстрируют неполную пенетрантность (т. Е. Здоровый родитель или другой родственник также может нести мутацию), в совокупности они могут составлять до 5% несиндромальной оральной щели.

Установлено, что мутации в гене SATB2 вызывают изолированную волчью нёбо. SATB2 также, вероятно, влияет на развитие мозга. Это согласуется с исследованиями на мышах, которые показывают, что SATB2 необходим для правильного установления связей кортикальных нейронов через мозолистое тело, несмотря на очевидно нормальное мозолистое тело у гетерозиготных мышей с нокаутом.

Структура

SATB2 представляет собой 733-аминокислотный гомеодомен -содержащий человеческий белок с молекулярной массой 82,5 кДа, кодируемый геном SATB2 на 2q33. Белок содержит две области вырожденного гомеодомена, известные как домены CUT (аминокислоты 352–437 и 482–560) и классический гомеодомен (аминокислота 614–677). Существует чрезвычайно высокая степень консервативности последовательности: только три предсказанные аминокислотные замены в белке из 733 остатков, при этом I481V, A590T и I730T представляют собой аминокислотные различия между человеческим и мышиным белками.

Клиническая значимость

Было установлено, что SATB2 является причиной расщелины или верхнего неба у людей с синдромом микроделеции 2q32q33.

Было обнаружено, что SATB2 нарушен в двух несвязанных случаях с de novo очевидно сбалансированные хромосомные транслокации, связанные с волчьей пастью и последовательностью Пьера Робена.

Роль SATB2 в развитии зубов и челюстей подтверждается идентификацией de novo Мутация SATB2 у мужчины с глубокой интеллектуальной недостаточностью и аномалиями челюсти и зубов, а также транслокация, прерывающая SATB2 у человека с последовательностью Робина. Кроме того, мышиные модели продемонстрировали, что гаплонедостаточность SATB2 приводит к черепно-лицевым дефектам, которые фенокопируют дефекты, вызванные делецией 2q32q33 у людей; кроме того, полная функциональная потеря SATB2 усиливает эти дефекты.

Экспрессия SATB2 высокоспецифична для рака нижних желудочно-кишечного тракта и считается биомаркером рака для колоректального рака.

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки

Реестр случаев SATB2 http://satb2gene.com

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.

Последняя правка сделана 2021-06-06 02:47:00
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте