ПТПРЗ1

ПТПРЗ1
Доступные конструкции PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3JXF, 3S97, 5AWX
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPRZ1, HPTPZ, HPTPzeta, PTP-ZETA, PTP18, PTPRZ, PTPZ, R-PTP-zeta-2, RPTPB, RPTPbeta, фосфакан, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа Z1, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа Z1
Внешние идентификаторы	OMIM : 176891 MGI : 97816 HomoloGene : 2136 GeneCards : PTPRZ1
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 7 (человек) Группа 7q31.32 Начинать 121 873 089 п.н. Конец 122 062 036 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 6 (мышь) Группа 6 | 6 A3.1 Начинать 22 875 502 б.п. Конец 23 052 916 п.н.
Паттерн экспрессии РНК Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • фосфопротеином фосфатазы • фосфатазы • ГО: связывание белка 0001948 • протеин - тирозин - фосфатазы • трансмембранного рецептора протеин - тирозин - фосфатазы • гидролазы активность • интегрин связывания Сотовый компонент • составной компонент мембраны • мембрана • интегральный компонент плазматической мембраны • внеклеточная область • перинейрональная сеть • внутренний компонент плазматической мембраны • плазматическая мембрана • внеклеточный матрикс GO: 0005578 • синапс Биологический процесс • axonogenesis • белки дефосфорилирование • олигодендроциты дифференциация • регулирование пролиферации олигодендроцитов клеток - предшественников • Развитие центрального нервной системы • гемопоэтических дифференциация клеток - предшественников • обучение или память • пептидил-тирозин дефосфорилирование • дефосфорилирование • цитокин-опосредованный сигнальный путь • регулирование миелинизации • отрицательное регулирование нейрона апоптотический процесс • положительная регуляция дифференцировки олигодендроцитов Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5803	19283
Ансамбль	ENSG00000106278	ENSMUSG00000068748
UniProt	P23471	B9EKR1
RefSeq (мРНК)	NM_001206838 NM_001206839 NM_002851 NM_001369395 NM_001369396	NM_001081306 NM_011219 NM_178180 NM_001311064 NM_001361349
RefSeq (белок)	NP_001193767 NP_001193768 NP_002842	NP_001074775 NP_001297993 NP_001348278 NP_035349
Расположение (UCSC)	Chr 7: 121,87 - 122,06 Мб	Chr 6: 22.88 - 23.05 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рецептор типа тирозин-фосфатазы белка дзета также известный как phosphacan является ферментом, который в организме человека кодируется PTPRZ1 гена.

• 1 Функция
• 2 Клиническое значение
• 3 ссылки
• 4 Дальнейшее чтение

Этот ген является членом семейства рецепторных тирозинфосфатаз и кодирует однопроходный мембранный белок типа I с двумя цитоплазматическими доменами тирозин-протеинфосфатазы, доменом альфа-карбоангидразы и доменом фибронектина типа III. Были описаны альтернативные варианты сплайсинга, которые кодируют различные изоформы белков, но их полноразмерная природа не определена.

Экспрессия этого гена индуцируется в клетках рака желудка, в ремиелинизирующихся олигодендроцитах поражений рассеянного склероза и в эмбриональных клетках почек человека в условиях гипоксии. И белок, и транскрипт сверхэкспрессируются в клетках глиобластомы, что способствует их гаптотактической миграции.

• Крюгер NX, Сайто H (1992). «Человеческая трансмембранная протеин-тирозин-фосфатаза, PTP zeta, экспрессируется в головном мозге и имеет N-концевой рецепторный домен, гомологичный угольным ангидразам». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 89 (16): 7417–21. Bibcode : 1992PNAS... 89.7417K. DOI : 10.1073 / pnas.89.16.7417. PMC   49721. PMID   1323835.
• Каплан Р., Морс Б., Хюбнер К., Кроче С., Хоук Р., Равера М., Рикка Г., Джей М., Шлессингер Дж. (1990). «Клонирование трех тирозинфосфатаз человека раскрывает мультигенное семейство рецептор-связанных протеин-тирозинфосфатаз, экспрессируемых в головном мозге». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 87 (18): 7000–4. Bibcode : 1990PNAS... 87.7000K. DOI : 10.1073 / pnas.87.18.7000. PMC   54670. PMID   2169617.
• Крюгер NX, Streuli M, Saito H (1990). «Структурное разнообразие и эволюция человеческих рецептор-подобных протеинтирозинфосфатаз». EMBO J. 9 (10): 3241–52. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07523.x. PMC   552056. PMID   2170109.
• Мортон С.М., Вейл Р.А., Хелмс С., Ли М., Куо В.Л., Грей Дж., Донис-Келлер Х. (1998). «Субрегиональная локализация 21 хромосомы 7-специфичных тегов экспрессируемой последовательности (EST) с помощью FISH с использованием недавно идентифицированных YAC и P1». Геномика. 46 (3): 491–4. DOI : 10.1006 / geno.1997.5051. PMID   9441757.
• Оньянго П., Лубьева Б., Гарделлин П., Курцбауэр Р., Вейт А. (1998). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии пяти новых генов в хромосоме 1p36». Геномика. 50 (2): 187–98. DOI : 10.1006 / geno.1997.5186. PMID   9653645.
• Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (1999). «К полной последовательности человеческого генома». Genome Res. 8 (11): 1097–108. DOI : 10.1101 / gr.8.11.1097. PMID   9847074.
• Маэда Н., Итихара-Танака К., Кимура Т., Кадомацу К., Мурамацу Т., Нода М. (1999). «Рецептор-подобная протеин-тирозинфосфатаза PTPzeta / RPTPbeta связывает мидкин связывающего гепарин фактора роста. Участие аргинина 78 мидкина в связывании с высоким сродством к PTPzeta». J. Biol. Chem. 274 (18): 12474–9. DOI : 10.1074 / jbc.274.18.12474. PMID   10212223.
• Кавачи Х., Тамура Х., Ватакабэ И., Шинтани Т., Маэда Н., Нода М. (1999). «Белковая тирозинфосфатаза дзета / RPTPbeta взаимодействует с семейством PSD-95 / SAP90». Brain Res. Мол. Brain Res. 72 (1): 47–54. DOI : 10.1016 / S0169-328X (99) 00204-1. PMID   10521598.
• Менг К., Родригес-Пенья А., Димитров Т., Чен В., Ямин М., Нода М., Деуэль Т.Ф. (2000). «Плейотрофин сигнализирует об увеличении фосфорилирования тирозина бета-бета-катенина посредством инактивации внутренней каталитической активности тирозинфосфатазы бета / дзета рецепторного типа». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 97 (6): 2603–8. DOI : 10.1073 / pnas.020487997. PMC   15975. PMID   10706604.
• Кавачи Х., Фудзикава А, Маэда Н, Нода М (2001). «Идентификация GIT1 / Cat-1 как молекулы субстрата протеинтирозинфосфатазы zeta / beta с помощью дрожжевой системы улавливания субстрата». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 98 (12): 6593–8. Bibcode : 2001PNAS... 98.6593K. DOI : 10.1073 / pnas.041608698. PMC   34398. PMID   11381105.
• Thomaidou D, Coquillat D, Meintanis S, Noda M, Rougon G, Matsas R (2001). «Растворимые формы молекул адгезии нейрональных клеток NCAM и F3 способствуют миграции шванновских клеток: идентификация протеинтирозинфосфатаз zeta / beta как предполагаемых рецепторов F3 на шванновских клетках». J. Neurochem. 78 (4): 767–78. DOI : 10.1046 / j.1471-4159.2001.00454.x. PMID   11520897. S2CID   24682985.
• Харрок С., Фуртадо Дж. К., Брюк В., Розенблют Дж., Лафай Дж., Чао М., Буксбаум Дж. Д., Шлессингер Дж. (2002). «Важнейшая роль рецептора протеинтирозинфосфатазы типа Z в функциональном восстановлении после демиелинизирующих поражений». Nat. Genet. 32 (3): 411–4. DOI : 10.1038 / ng1004. PMID   12355066. S2CID   19800079.
• Müller S, Kunkel P, Lamszus K, Ulbricht U, Lorente GA, Nelson AM, von Schack D, Chin DJ, Lohr SC, Westphal M, Melcher T (2003). «Роль рецептора тирозинфосфатазы zeta в миграции клеток глиомы». Онкоген. 22 (43): 6661–8. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206763. PMID   14555979.
• Bonora E, Lamb JA, Barnby G, Sykes N, Moberly T, Beyer KS, Klauck SM, Poustka F, Bacchelli E, Blasi F, Maestrini E, Battaglia A, Haracopos D, Pedersen L, Isager T, Eriksen G, Viskum B, Соренсен ЕС, Брондум-Нильсен К., Коттерилл Р., ван Энгеланд Х., де Йонге М., Кемнер С., Стеггеуис К., Шерпенисс М., Руттер М., Болтон П. Ф., Парр Дж. Р., Поустка А., Бейли А. Дж., Монако А. П. (2005). «Скрининг мутаций и анализ ассоциации шести генов-кандидатов аутизма на хромосоме 7q». Евро. J. Hum. Genet. 13 (2): 198–207. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5201315. PMID   15523497.
• Поликратис А, Катсорис П., Courty J, Papadimitriou E (2005). «Характеристика передачи сигналов пептида, регулирующего аффин гепарина, в эндотелиальных клетках человека». J. Biol. Chem. 280 (23): 22454–61. DOI : 10.1074 / jbc.M414407200. PMID   15797857.
• Ван В., Дэвис Д.А., Хак М., Хуанг Л.Э., Ярчоан Р. (2005). «Дифференциальная регуляция гена индуцируемым гипоксией фактором-1альфа и индуцируемым гипоксией фактором-2альфа в клетках HEK293T». Cancer Res. 65 (8): 3299–306. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-04-4130. PMID   15833863.
• Лу К.В., Джонг К.А., Ким Г.Й., Сингх Дж., Диа эквалайзер, Йошимото К., Ван М.И., Клоугеси Т.Ф., Нельсон С.Ф., Мишель П.С. (2005). «Дифференциальная индукция миграции и роста глиобластомы двумя формами плейотропина». J. Biol. Chem. 280 (29): 26953–64. DOI : 10.1074 / jbc.M502614200. PMID   15908427.

• Биологический портал