POU2F1

POU2F1
Доступные конструкции PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1CQT, 1E3O, 1GT0, 1HF0, 1O4X, 1OCT, 1POG
Идентификаторы
Псевдонимы	POU2F1, OCT1, OTF1, oct-1B, POU класса 2 homeobox 1, Oct1Z
Внешние идентификаторы	OMIM : 164175 MGI : 101898 HomoloGene : 37658 GeneCards : POU2F1
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 1 (человек) Группа 1q24.2 Начинать 167 220 876 п.н. Конец 167 427 345 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 1 (мышь) Группа 1 H2.3 | 1 73,21 см Начинать 165 865 154 п.н. Конец 166 002 678 б.п.
Паттерн экспрессии РНК Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • Связывание с ДНК, специфичное для последовательности • Связывание с белком GO: 0001948 • Связывание с ДНК, специфичное для последовательности основного промотора РНК-полимеразы II • GO: 0000983 Активность общего фактора инициации транскрипции РНК-полимеразы II • Связывание с ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II • GO: 0000980 Связывание с последовательностью цис-регуляторной области РНК-полимеразы II Сотовый компонент • эндоплазматический ретикулум • ядро • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • нуклеоплазма • комплекс регуляторов транскрипции РНК-полимеразы II Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регулирование транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция мяРНК с помощью РНК-полимеразы II • позитивная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • цитокин-опосредованный сигнальный путь Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5451	18986
Ансамбль	ENSG00000143190	ENSMUSG00000026565
UniProt	P14859	P25425
RefSeq (мРНК)	NM_001198783 NM_001198786 NM_002697 NM_001365848 NM_001365849	NM_011137 NM_198932 NM_198933 NM_198934 NM_001368808
RefSeq (белок)	NP_001185712 NP_001185715 NP_002688 NP_001352777 NP_001352778	NP_035267 NP_945150 NP_945151 NP_945152 NP_001355737
Расположение (UCSC)	Chr 1: 167.22 - 167.43 Мб	Chr 1: 165.87 - 166 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Домен ПУ, класс 2, фактор транскрипции 1 представляет собой белок, который у человека кодируется POU2F1 гена.

• 1 Взаимодействие
• 2 См. Также
• 3 ссылки
• 4 Дальнейшее чтение
• 5 Внешние ссылки

POU2F1 взаимодействует с:

• EPRS,
• Рецептор глюкокортикоидов,
• Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа,
• Фактор клетки-хозяина C1,
• Ku80,
• MNAT1
• NPAT,
• Корепрессор ядерного рецептора 2,
• ПОУ2АФ1,
• РЕЛА,
• Ретиноидный рецептор X альфа,
• SNAPC4,
• Фактор транскрипции Sp1 и
• Связывающий ТАТА белок.

• Фактор транскрипции октамера

• Шей К.Л., Штурм Р., Герр В., Франк У. (1990). «Ген повсеместного октамер-связывающего белка Oct-1 находится на хромосоме 1 человека, в области cen-q32, и рядом с Ly-22 и Ltw-4 на хромосоме 1 мыши». Геномика. 6 (4): 666–72. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (90) 90502-L. PMID   2341156.
• Штурм Р.А., Дас Г., Герр В. (1989). «Повсеместно распространенный октамер-связывающий белок Oct-1 содержит домен POU с субдоменом гомео-бокса». Genes Dev. 2 (12A): 1582–99. DOI : 10,1101 / gad.2.12a.1582. PMID   2905684.
• Накшатри Х., Накшатри П., Карри Р.А. (1995). «Взаимодействие Oct-1 с TFIIB. Последствия для нового ответа, вызванного проксимальным октамерным сайтом промотора липопротеин липазы». J. Biol. Chem. 270 (33): 19613–23. DOI : 10.1074 / jbc.270.33.19613. PMID   7642649.
• Кокс М., ван Тилборг П.Дж., де Лаат В., Боеленс Р., ван Леувен Х.С., ван дер Влит П.С., Каптейн Р. (1995). «Структура раствора гомеодомена ПОУ Oct – 1, определенная с помощью ЯМР и ограниченной молекулярной динамики». J. Biomol. ЯМР. 6 (1): 23–32. DOI : 10.1007 / BF00417488. PMID   7663141. S2CID   26063646.
• Jeang KT, Chun R, Lin NH, Gatignol A, Glabe CG, Fan H (1993). «Связывание in vitro и in vivo белка Tat вируса иммунодефицита человека 1 типа и фактора транскрипции Sp1». J. Virol. 67 (10): 6224–33. DOI : 10,1128 / JVI.67.10.6224-6233.1993. PMC   238044. PMID   7690421.
• Цвиллинг С., Кениг Х., Вирт Т. (1995). «Белок 2 группы высокой подвижности функционально взаимодействует с доменами POU транскрипционных факторов октамера». EMBO J. 14 (6): 1198–208. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07103.x. PMC   398197. PMID   7720710.
• Штурм Р.А., Эйр Х.Дж., Бейкер Э., Сазерленд Г.Р. (1995). «Локус OTF1 человека, который перекрывает ген CD3Z, расположен в 1q22 → q23». Cytogenet. Cell Genet. 68 (3–4): 231–2. DOI : 10.1159 / 000133919. PMID   7842742.
• Клемм Дж. Д., Рулд М. А., Аврора Р., Герр В., Пабо, CO (1994). «Кристаллическая структура домена Oct-1 POU, связанного с октамерным сайтом: распознавание ДНК с помощью связанных ДНК-связывающих модулей». Cell. 77 (1): 21–32. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90231-3. PMID   8156594. S2CID   36371069.
• Цвиллинг С., Аннвейлер А., Вирт Т. (1994). «Домены POU транскрипционных факторов Oct1 и Oct2 опосредуют специфическое взаимодействие с TBP». Nucleic Acids Res. 22 (9): 1655–62. DOI : 10.1093 / nar / 22.9.1655. PMC   308045. PMID   8202368.
• Кристи TM, Sharp PA (1993). «Очистка клеточного фактора C1, необходимого для стабильного распознавания гомеодомена Oct-1 фактором альфа-трансиндукции вируса простого герпеса (VP16)». J. Biol. Chem. 268 (9): 6525–34. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 53282-8. PMID   8454622.
• Асса-Мунт Н., Мортишир-Смит Р.Дж., Аврора Р., Герр В., Райт П.Е. (1993). «Структура раствора Oct-1 POU-специфического домена обнаруживает поразительное сходство с ДНК-связывающим доменом репрессора лямбда бактериофага». Cell. 73 (1): 193–205. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (93) 90171-L. PMID   8462099. S2CID   24276357.
• Деккер Н., Кокс М., Боеленс Р., Верриджзер С.П., ван дер Влит П.С., Каптейн Р. (1993). «Структура раствора POU-специфичного ДНК-связывающего домена Oct-1». Природа. 362 (6423): 852–5. Bibcode : 1993Natur.362..852D. DOI : 10.1038 / 362852a0. PMID   8479524. S2CID   21540451.
• Стрем А.С., Форсберг М., Лиллхагер П., Вестин Г. (1996). «Факторы транскрипции Sp1 и Oct-1 физически взаимодействуют, регулируя экспрессию гена мяРНК U2 человека». Nucleic Acids Res. 24 (11): 1981–6. DOI : 10.1093 / nar / 24.11.1981. PMC   145891. PMID   8668525.
• Инамото С., Сегил Н., Пан З. К., Кимура М., Рёдер Р. Г. (1997). «Фактор сборки циклин-зависимой киназы-активирующей киназы (САК), MAT1, нацелен на и усиливает активность САК на доменах POU факторов транскрипции октамера». J. Biol. Chem. 272 (47): 29852–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.47.29852. PMID   9368058.
• Вонг М.В., Генри Р.В., Ма Б., Кобаяши Р., Клагес Н., Маттиас П., Струбин М., Эрнандес Н. (1998). «Большая субъединица базального фактора транскрипции SNAPc представляет собой белок домена Myb, который взаимодействует с Oct-1». Мол. Клетка. Биол. 18 (1): 368–77. DOI : 10.1128 / mcb.18.1.368. PMC   121507. PMID   9418884.
• Не Дж., Сакамото С., Сонг Д., Цюй З., Ота К., Танигучи Т. (1998). «Взаимодействие Oct-1 и домена автомодификации поли (АДФ-рибоза) синтетазы». FEBS Lett. 424 (1–2): 27–32. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (98) 00131-8. PMID   9537509. S2CID   872132.
• Префонтен Г.Г., Лемье М.Э., Гиффин В., Шильд-Поултер С., Папа Л., Лакасс Е., Уокер П., Хаше Р.Дж. (1998). «Рекрутирование факторов транскрипции октамера в ДНК глюкокортикоидным рецептором». Мол. Клетка. Биол. 18 (6): 3416–30. DOI : 10,1128 / MCB.18.6.3416. PMC   108923. PMID   9584182.
• La Boissière S, Hughes T, O'Hare P (1999). «Зависящий от HCF ядерный импорт VP16». EMBO J. 18 (2): 480–9. DOI : 10.1093 / emboj / 18.2.480. PMC   1171141. PMID   9889203.

• POU2F1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)