PAX2

PAX2
Идентификаторы
Псевдонимы	PAX2, PAPRS, FSGS7, парный ящик 2
Внешние идентификаторы	OMIM : 167409 MGI : 97486 HomoloGene : 2968 GeneCard : PAX2
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 10 (человек) Группа 10q24.31 Начинать 100 735 396 п.н. Конец 100 829 944 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 19 (мышь) Группа 19 C3 | 19 38,09 см Начинать 44 756 045 п.н. Конец 44837871 п.о.
Паттерн экспрессии РНК Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • связывание ДНК • супероксид-генерации NAD (P) H - оксидаза активность • транскрипционного фактора связывания • GO: связывание 0001158 циса-регуляторная область ДНК - последовательность конкретного • GO: 0001948 связывание белка • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК -связывающая активность фактора транскрипции, специфическая к РНК-полимеразе II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции Сотовый компонент • Аппарат Гольджи • центриолярный сателлит • центр организации микротрубочек • комплекс белок-ДНК • ядрышко • лизосома • ядро • белоксодержащий комплекс Биологический процесс • клеточный ответ на перекись водорода • клеточный ответ на глюкозу стимул • развития улитка • Развитие Предпочка • клеточный ответ на ретиноевой кислоты • регулирование метанефрической нефрона канальцев дифференцировки эпителиальных клеток • развитие животных органа • развитие мочеточника • дифференцировки клеток • отрицательное регулирование цистеин-типа активность эндопептидазы, вовлеченная в процесс апоптоза • позитивная регуляция ветвления, участвующая в морфогенезе зачатка мочеточника • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • позитивная регуляция дифференцировки метанефрических DCT-клеток • регуляция размера метанефроса • аксоногенез • передача сигналов протеинкиназы B • негативная регуляция мезенхимальных клеток апоптотический процесс, участвующий в морфогенезе метанефрального нефрона • негативная регуляция апоптотического процесса, участвующего в развитии метанефрического собирательного протока • позитивная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • морфогенез зрительного нерва • спецификация пронефрического поля • позитивная регуляция мезенхимальных к эпителиальной перехода, участвующего в вторичной почки морфогенез • метанефрической клеточной дифференцировки мезенхимальных • старение • развитие метанефрической эпителия • мезенхимальных к эпителиальной переход участвует в вторичной почки морфогенез • негативной регуляции апоптоза процесса • глиальной дифференцировки клеток • транскрипции РНК - полимеразой II • развитие эпителия пигмента сетчатки • формирование почечного протока • транскрипция, ДНК-шаблон • дифференцировка стволовых клеток • развитие метанефрических дистальных извитых канальцев • метаболический процесс активных форм кислорода • негативная регуляция процесса апоптоза мезенхимальных клеток, участвующего в развитии метанефроса • развитие мезонефроса • структурная организация зрительного нерва • позитивная регуляция транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста • образование канальцев метанефрального нефрона • положительная регуляция развития метанефрических клубочков • развитие многоклеточных организмов • участие ветвления в морфогенезе зачатка мочеточника • закрытие нервной трубки • реакция на уровни питательных веществ • негативная регуляция процесса апоптоза, участвующего в развитии метанефрических канальцев нефрона • созревание мочеточника • морфогенез внутреннего уха • морфогенез улитки • позитивная регуляция образования зрительного нерва • позитивная регуляция пролиферации клеточной популяции • морфогенез глазного яблока, участвующий в развитии глаза камерного типа • развитие мочеполовой системы • определение судьбы клеток • негативная регуляция запрограммированной гибели клеток • формирование вестибулокохлеарного нерва • развитие глазного типа камеры • развитие метанефрического собирательного протока • негативная регуляция метаболического процесса активных форм кислорода • мезодермального спецификация клеток судьбы • отрицательную регуляция транскрипции ДНК-шаблонный • развитие метанефрической мезенхимы • развитие зрительных нервов • развитие зрительного нерва • положительной регуляцию транскрипции с помощью РНК - полимераза II • визуального восприятия • отрицательного регулирования цитолиза • Brai n морфогенез • переход от мезенхимы к эпителию Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5076	18504
Ансамбль	ENSG00000075891	ENSMUSG00000004231
UniProt	Q02962 Q5SZP1	P32114
RefSeq (мРНК)	NM_003990 NM_000278 NM_001304569 NM_003987 NM_003988 NM_003989 NM_001374303	NM_011037
RefSeq (белок)	NP_000269 NP_001291498 NP_003978 NP_003979 NP_003980 NP_003981 NP_001361232	NP_035167 NP_001355672 NP_001355673 NP_001355674 NP_001355675 NP_001355676 NP_001355677 NP_001355678 NP_001355679 NP_001355680
Расположение (UCSC)	Chr 10: 100,74 - 100,83 Мб	Chr 19: 44,76 - 44,84 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Соединенный гена коробки 2, также известный как Pax2 является белком, который в организме человека кодируется Pax2 геном.

• 1 Функция
• 2 Клиническое значение
• 3 взаимодействия
• 4 См. Также
• 5 ссылки
• 6 Дальнейшее чтение
• 7 Внешние ссылки

Гены Pax, или гены, содержащие парные коробки, играют важную роль в развитии и пролиферации множества клеточных линий, развитии органов, а также развитии и организации центральной нервной системы. Ген фактора транскрипции Pax2 важен для регионализированного эмбриологического развития центральной нервной системы. У млекопитающих мозг развит в трех областях: передний мозг, средний мозг и задний мозг. Градиенты концентрации фактора роста фибробластов 8 (FGF8) и семейства сайтов интеграции MMTV бескрылого типа, члена 1 (Wnt1) контролируют экспрессию Pax2 во время развития среднего мозга или среднего мозга. Сходное формирование паттерна во время эмбриологического развития можно наблюдать у «базальных хордовых или асцидий», у которых организация центральной нервной системы у асцидиевых личинок также контролируется генами факторов роста фибробластов. Ген Pax2 кодирует фактор транскрипции, который, по-видимому, играет важную роль в организации областей среднего и заднего мозга и, самое раннее, может быть обнаружен по обе стороны от предельной борозды, которая разделяет двигательные и сенсорные нервные ядра.

PAX2 кодирует парный бокс- ген 2, один из многих человеческих гомологов гена prd Drosophila melanogaster. Центральным признаком этого семейства генов фактора транскрипции является консервативный ДНК-связывающий парный бокс-домен. Считается, что PAX2 является мишенью подавления транскрипции геном-супрессором опухоли WT1. Pax 2 представляет собой фактор транскрипции, контролируемый сигнальными молекулами Wnt1 и Fgf8. Pax2 вместе с другими факторами транскрипции Pax5, Pax8, En1 и En 2 экспрессируются через границу Otx2-Gbx2 в средней части заднего мозга. Эти факторы транскрипции работают с сигнальными молекулами Wnt1 и Fgf8 для поддержания организатора MHB. MHB контролирует развитие среднего мозга и мозжечка. Pax2 - это самый ранний из известных генов, который экспрессируется через границу Otx2-Gbx2. Он сначала экспрессируется на стадии поздней примитивной полоски и экспрессируется в узком кольце с центром в MHB во время сомитогенеза. Экспрессия трансгена в среднем заднем мозге и развивающейся почке направляется Pax2. Есть три различных MHB-специфических энхансера в восходящей области Pax2. Экспрессия MHB, начиная со стадии четырех сомитов и далее, направляется двумя поздними энхансерами в проксимальных и дистальных областях Pax2. Ранний энхансер, расположенный в промежуточной области, активирует область среднего заднего мозга эмбрионов поздней гаструлы. Активация Pax2, Pax5 и Pax8 является консервативной особенностью всех позвоночных.

Патологически было продемонстрировано, что Pax2 активирует промотор гена фактора роста гепатоцитов (HGF), и было показано, что оба они играют роль в раке простаты человека.

Было показано, что мутации в PAX2 приводят к колобомам зрительного нерва и почечной гипоплазии. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к множеству вариантов транскриптов. Pax2 и Pax8 также необходимы для образования пронефроса и последующих структур почек. Pax2 и Pax8 регулируют экспрессию Gata3. Без этих генов возникают мутации в мочеполовой системе.

Неверная экспрессия Pax2 часто наблюдается при пролиферативных нарушениях почек. Например, Pax2 высоко экспрессируется при поликистозной болезни почек (PKD), опухоли Вильмса (WT) и почечно-клеточной карциноме (RCC). Экспрессия Pax2 при этих заболеваниях проявляется в цикличности топливных элементов, ингибирует гибель клеток и придает устойчивость к химиотерапии. Благодаря своей роли в этих заболеваниях, Pax2 является привлекательной терапевтической мишенью, и был исследован ряд методов ингибирования его активности. Фактически, недавно была идентифицирована малая молекула, способная нарушать опосредованную Pax2 транскрипцию, блокируя связывание Pax2 с ДНК.

Было показано, что PAX2 взаимодействует с PAXIP1.

• Гены pax

• Noll M (август 1993 г.). «Эволюция и роль генов Pax». Текущее мнение в области генетики и развития. 3 (4): 595–605. DOI : 10.1016 / 0959-437X (93) 90095-7. PMID   8241771.
• Даль Э, Косеки Х, Баллинг Р. (сентябрь 1997 г.). «Гены Pax и органогенез». BioEssays. 19 (9): 755–65. DOI : 10.1002 / bies.950190905. PMID   9297966. S2CID   23755557.
• Eccles MR, He S, Legge M, Kumar R, Fox J, Zhou C., French M, Tsai RW (2003). «Гены PAX в развитии и болезни: роль PAX2 в развитии урогенитального тракта». Международный журнал биологии развития. 46 (4): 535–44. PMID   12141441.
• Экклс М.Р., Уоллис Л.Дж., Фидлер А.Э., Спурр Н.К., Гудфеллоу П.Дж., Рив А.Э. (май 1992 г.). «Экспрессия гена PAX2 в почках плода человека и опухоли Вильмса». Рост и дифференциация клеток. 3 (5): 279–89. PMID   1378753.
• Sanyanusin P, Schimmenti LA, McNoe LA, Ward TA, Pierpont ME, Sullivan MJ, Dobyns WB, Eccles MR (апрель 1995 г.). «Мутация гена PAX2 в семье с колобомами зрительного нерва, почечными аномалиями и пузырно-мочеточниковым рефлюксом». Генетика природы. 9 (4): 358–64. DOI : 10.1038 / ng0495-358. PMID   7795640. S2CID   29180124.
• Уорд Т.А., Небель А., Рив А.Е., Экклс М.Р. (сентябрь 1994 г.). «Альтернативные формы матричной РНК и открытые рамки считывания в дополнительной консервативной области гена PAX-2 человека». Рост и дифференциация клеток. 5 (9): 1015–21. PMID   7819127.
• Стэплтон П., Вейт А., Урбанек П., Козмик З., Басслингер М. (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семьи, PAX-9». Генетика природы. 3 (4): 292–8. DOI : 10.1038 / ng0493-292. PMID   7981748. S2CID   21338655.
• Pilz AJ, Povey S, Gruss P, Abbott CM (1993). «Картирование человеческих гомологов мышей, содержащих парные коробки». Геном млекопитающих. 4 (2): 78–82. DOI : 10.1007 / BF00290430. PMID   8431641. S2CID   30845070.
• Саньянусин П., Макнои Л.А., Салливан М.Дж., Уивер Р.Г., Экклс М.Р. (ноябрь 1995 г.). «Мутация PAX2 у двух братьев и сестер с почечно-колобомным синдромом». Молекулярная генетика человека. 4 (11): 2183–4. DOI : 10.1093 / HMG / 4.11.2183. PMID   8589702.
• Саньянусин П., Норриш Дж. Х., Уорд Т. А., Небель А., Макно Л. А., Экклс М. Р. (июль 1996 г.). «Геномная структура гена PAX2 человека». Геномика. 35 (1): 258–61. DOI : 10.1006 / geno.1996.0350. PMID   8661132.
• Дехби М., Гахремани М., Лехнер М., Дресслер Дж., Пеллетье Дж. (Август 1996 г.). «Фактор транскрипции парного бокса, PAX2, положительно модулирует экспрессию гена-супрессора опухоли Вильмса (WT1)». Онкоген. 13 (3): 447–53. PMID   8760285.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791. PMID   8889548.
• Schimmenti LA, Cunliffe HE, McNoe LA, Ward TA, French MC, Shim HH, Zhang YH, Proesmans W., Leys A, Byerly KA, Braddock SR, Masuno M, Imaizumi K, Devriendt K, Eccles MR (апрель 1997 г.). «Дальнейшее определение синдрома почечной колобомы у пациентов с крайней вариабельностью фенотипа и идентичными мутациями PAX2». Американский журнал генетики человека. 60 (4): 869–78. PMC   1712484. PMID   9106533.
• Нарахара К., Бейкер Э., Ито С., Йокояма Ю., Ю С., Хьюитт Д., Сазерленд Г. Р., Экклс М. Р., Ричардс Р. И. (март 1997 г.). «Локализация точки останова 10q в гене PAX2 у пациента с транслокацией de novo t (10; 13) и заболеванием колобомы зрительного нерва почек». Журнал медицинской генетики. 34 (3): 213–6. DOI : 10.1136 / jmg.34.3.213. PMC   1050895. PMID   9132492.
• Тавассоли К., Рюгер В., Хорст Дж. (Декабрь 1997 г.). «Альтернативный сплайсинг в PAX2 генерирует новую рамку считывания и расширенную консервативную кодирующую область на карбокси-конце». Генетика человека. 101 (3): 371–5. DOI : 10.1007 / s004390050644. PMID   9439670. S2CID   43590139.
• Стейнер CK, Канлифф HE, Ward TA, Eccles MR (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика человеческого промотора PAX2». Журнал биологической химии. 273 (39): 25472–9. DOI : 10.1074 / jbc.273.39.25472. PMID   9738017.
• Devriendt K, Matthijs G, Van Damme B, Van Caesbroeck D, Eccles M, Vanrenterghem Y, Fryns JP, Leys A (август 1998 г.). «Миссенс-мутация и гексануклеотидная дупликация в гене PAX2 в двух неродственных семьях с почечно-колобомным синдромом (MIM 120330)». Генетика человека. 103 (2): 149–53. DOI : 10.1007 / s004390050798. PMID   9760197. S2CID   8930257.
• Schimmenti LA, Shim HH, Wirtschafter JD, Panzarino VA, Kashtan CE, Kirkpatrick SJ, Wargowski DS, France TD, Michel E, Dobyns WB (2000). «Гомонуклеотидные экспансия и мутации сокращения PAX2 и включение мальформации Киари 1 как часть почечно-колобомного синдрома». Человеческая мутация. 14 (5): 369–76. DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (199911) 14: 5 lt;369:: AID-HUMU2gt; 3.0.CO; 2-E. PMID   10533062.

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о синдроме почечной колобомы
• PAX2 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.