PABPC1

PABPC1
Доступные конструкции PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1CVJ, 1G9L, 1JGN, 1JH4, 2K8G, 2RQG, 2RQH, 2X04, 3KTP, 3KTR, 3KUI, 3KUJ, 3KUR, 3KUS, 3KUT, 3PKN, 3PTH, 4F02, 4F25, 4F26, 5DX1, 5DXA, 5DX8, 2D9P
Идентификаторы
Псевдонимы	PABPC1, PAB1, PABP, PABP1, PABPC2, PABPL1, поли (A) связывающий белок цитоплазмы 1
Внешние идентификаторы	OMIM : 604679 MGI : 1349722 HomoloGene : 37638 GeneCards : PABPC1
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 8 (человек) Группа 8q22.3 Начинать 100685816 п.н. Конец 100 722 809 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 15 (мышь) Группа 15 | 15 B3.1 Начинать 36 595 661 п.н. Конец 36609668 п.о.
Онтология генов Молекулярная функция • ГО: связывание белка 0001948 • нуклеиновой кислоты связывания • связывающий белок С-конец • перевод активатор активности • поли (U) РНК связывания • поли (А) связывания • связывание мРНК 3'-UTR • связывание РНК • связывание мРНК Сотовый компонент • фокальной адгезии • Каталитического шаг 2 сплайсосомы • цитоплазматического стресс гранула • цитоплазма • цитоплазматического рибонуклеопротеинового гранулу • spliceosomal комплекс • мембрана • внеклеточный экзос • ядро • цитозоль • дендритов • рибонуклеопротеиновые гранулы • синапс • мессенджер рибонуклеопротеинового комплекса • рибонуклеопротеинового комплекс Биологический процесс • процесса катаболического ядерно-транскрибируются мРНК, нонсенс-опосредованного распад • стабилизации мРНК • сплайсинг мРНК, с помощью сплайсосомы • регулирование стабильности мРНК • РНК сплайсинг • мРНК полиаденилирование • мРНК обработка • мРНК поли ядерной транскрипцией (А) хвост укорочение • положительного регулирования репликация вирусного генома • инициация трансляции • негативная регуляция катаболического процесса ядерной транскрибируемой мРНК, нонсенс-опосредованный распад • позитивная регуляция трансляции • подавление гена с помощью РНК • позитивная регуляция укорочения поли (A) хвоста мРНК, транскрибируемой ядром • позитивная регуляция ядер -транскрибируемый катаболический процесс мРНК, зависимый от деаденилирования распад Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26986	18458
Ансамбль	ENSG00000070756	ENSMUSG00000022283
UniProt	P11940	P29341
RefSeq (мРНК)	NM_002568	NM_008774
RefSeq (белок)	NP_002559	NP_032800
Расположение (UCSC)	Chr 8: 100.69 - 100.72 Мб	Chr 15: 36,6 - 36,61 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Полиаденилированные-связывающий белок 1 представляет собой белок, который у человека кодируется PABPC1 гена. Белок PABP1 связывает мРНК и способствует множеству функций, таких как транспорт в ядро ​​и из ядра, деградация, трансляция и стабильность. Существует два отдельных белка PABP1, один из которых расположен в ядре (PABPN1), а другой - в цитоплазме (PABPC1). Расположение PABP1 влияет на роль этого белка и его функцию с РНК.

• 1 Функция
• 2 взаимодействия
• 3 ссылки
• 4 Дальнейшее чтение

Поли (A) -связывающий белок (PAB или PABP), который обнаружен в комплексе с 3'-поли (A) хвостом эукариотической мРНК, необходим для удлинения поли (A) и прекращения трансляции. У человека PABP содержат небольшую ядерную изоформу и семейство консервативных генов других поли (A)-связывающих белков. [Поставляется OMIM]

PABPC1 обычно диффундирует в цитоплазме и концентрируется в сайтах с высокой концентрацией мРНК, таких как стрессовые гранулы, процессирующие тела и места с высокой трансляционной активностью. PABPC1 также связан с нонсенс-опосредованным распадом мРНК (NMD). PABPC1 связывается с поли (A) хвостом и взаимодействует с eIF4E, что способствует отделению мРНК от рибосом после стадии терминации трансляции. Эта структура необходима для предотвращения деградации мРНК через NMD.

В ядре PABP1 связывается с поли (A) хвостами пре-мРНК для облегчения стабильности, экспорта, транспорта и деградации. Связывание PABP1 также необходимо для ядерной деградации. PABPC1 содержит четыре мотива распознавания РНК (RRM). Первые два, RRM1 и RRM2, связывают как α-импортин, так и поли (A) хвост процессированной мРНК. Эта функция предотвращает возврат мРНК в ядро.

Было показано, что PABPC1 взаимодействует с:

• ANAPC5,
• CNOT7,
• EIF4G3,
• EIF4G1,
• GSPT2,
• PAIP1 и
• PAIP2.

• Гёрлах М., Бурд К.Г., Дрейфус Г. (апрель 1994 г.). «Поли (А)-связывающий мРНК белок: локализация, количество и специфичность связывания РНК». Экспериментальные исследования клеток. 211 (2): 400–7. DOI : 10.1006 / excr.1994.1104. PMID   7908267.
• Кэмпбелл Л. Х., Борг К. Т., Хейнс Дж. К., Мун RT, Шенберг Д. Р., Арриго С. Дж. (Сентябрь 1994 г.). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 Rev необходим in vivo для связывания поли (А) -связывающего белка с Rev-зависимыми РНК». Журнал вирусологии. 68 (9): 5433–8. DOI : 10.1128 / jvi.68.9.5433-5438.1994. PMC   236943. PMID   8057425.
• Хуанг Й., Кармайкл Г.Г. (апрель 1996 г.). «Роль полиаденилирования в ядерно-цитоплазматическом транспорте мРНК». Молекулярная и клеточная биология. 16 (4): 1534–42. DOI : 10.1128 / mcb.16.4.1534. PMC   231138. PMID   8657127.
• Крейг А. В., Хагигат А., Ю. А. Т., Соненберг Н. (апрель 1998 г.). «Взаимодействие полиаденилат-связывающего белка с гомологом eIF4G PAIP усиливает трансляцию». Природа. 392 (6675): 520–3. DOI : 10.1038 / 33198. PMID   9548260. S2CID   10891925.
• Афонина Э., Штаубер Р., Павлакис Г.Н. (май 1998 г.). «Человеческий поли (А) -связывающий белок 1 перемещается между ядром и цитоплазмой». Журнал биологической химии. 273 (21): 13015–21. DOI : 10.1074 / jbc.273.21.13015. PMID   9582337.
• Иматака Х, Гради А, Соненберг Н (декабрь 1998 г.). «Недавно идентифицированная N-концевая аминокислотная последовательность eIF4G человека связывает поли (А) -связывающий белок и функционирует в поли (А) -зависимой трансляции». Журнал EMBO. 17 (24): 7480–9. DOI : 10.1093 / emboj / 17.24.7480. PMC   1171091. PMID   9857202.
• Хорнштейн Э, Гит А, Браунштейн I, Авни Д., Мейухас О. (январь 1999 г.). «Экспрессия гена поли (A) -связывающего белка трансляционно регулируется зависимым от роста способом через 5'-концевой мотив олигопиримидинового тракта». Журнал биологической химии. 274 (3): 1708–14. DOI : 10.1074 / jbc.274.3.1708. PMID   9880551.
• Лароя Дж., Куэста Р., Брюер Дж., Шнайдер Р. Дж. (Апрель 1999 г.). «Контроль распада мРНК путем теплового шока-убиквитин-протеасома». Наука. 284 (5413): 499–502. DOI : 10.1126 / science.284.5413.499. PMID   10205060.
• Хосино С., Имаи М., Кобаяси Т., Учида Н., Катада Т. (июнь 1999 г.). «Релизинг-фактор эукариотической полипептидной цепи (eRF3 / GSPT), несущий сигнал терминации трансляции к 3'-Poly (A) хвосту мРНК. Прямая ассоциация erf3 / GSPT с полиаденилат-связывающим белком». Журнал биологической химии. 274 (24): 16677–80. DOI : 10.1074 / jbc.274.24.16677. PMID   10358005.
• Deo RC, Bonanno JB, Sonenberg N, Burley SK (сентябрь 1999 г.). «Распознавание полиаденилатной РНК поли (А) -связывающим белком». Cell. 98 (6): 835–45. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81517-2. PMID   10499800. S2CID   16247357.
• Фераль С., Маттеи М.Г., Павляк А., Гуэллан Дж. (Октябрь 1999 г.). «Хромосомная локализация трех генов поли (A) -связывающего белка человека и четырех родственных псевдогенов». Генетика человека. 105 (4): 347–53. DOI : 10.1007 / s004390051113. PMC   1865476. PMID   10543404.
• Гроссет С., Чен С.Ю., Сюй Н., Соненберг Н., Жакмен-Саблон Х., Шю А.Б. (сентябрь 2000 г.). «Механизм трансляционно связанного оборота мРНК: взаимодействие между поли (А) хвостом и детерминантой кодирования РНК c-fos через белковый комплекс». Cell. 103 (1): 29–40. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 00102-1. PMID   11051545. S2CID   18135412.
• Khaleghpour K, Свиткин YV, Крейг AW, DeMaria CT, Deo RC, Burley SK, Sonenberg N (январь 2001 г.). «Репрессия трансляции новым партнером человеческого поли (А) связывающего белка, Paip2». Молекулярная клетка. 7 (1): 205–16. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00168-X. PMID   11172725.
• Бушелл М., Вуд В., Карпентер Г., Пейн В.М., Морли С.Дж., Клеменс М.Дж. (июнь 2001 г.). «Нарушение взаимодействия эукариотического фактора инициации синтеза белка 4В млекопитающих с поли (А) -связывающим белком путем расщепления, опосредованного каспазой и вирусной протеазой». Журнал биологической химии. 276 (26): 23922–8. DOI : 10.1074 / jbc.M100384200. PMID   11274152.
• Féral C, Guellaën G, Pawlak A (май 2001 г.). «Семенники человека экспрессируют специфический поли (А) -связывающий белок». Исследования нуклеиновых кислот. 29 (9): 1872–83. DOI : 10.1093 / nar / 29.9.1872. PMC   37253. PMID   11328870.
• Khaleghpour K, Kahvejian A, De Crescenzo G, Roy G, Svitkin YV, Imataka H, ​​O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (август 2001 г.). «Двойные взаимодействия репрессора трансляции Paip2 с поли (A) связывающим белком». Молекулярная и клеточная биология. 21 (15): 5200–13. DOI : 10.1128 / MCB.21.15.5200-5213.2001. PMC   87244. PMID   11438674.
• Вудс А.Дж., Робертс М.С., Чоудхари Дж., Барри С.Т., Мазаки Ю., Сабе Х., Морли С.Дж., Кричли Д.Р., Норман Дж.С. (февраль 2002 г.). «Паксиллин связывается с поли (A) -связывающим белком 1 в плотной эндоплазматической сети и на переднем крае мигрирующих клеток». Журнал биологической химии. 277 (8): 6428–37. DOI : 10.1074 / jbc.M109446200. PMID   11704675.
• Ли Дж., Бедфорд MT (март 2002 г.). «PABP1 идентифицирован как субстрат аргининметилтрансферазы с использованием массивов белков высокой плотности». EMBO Reports. 3 (3): 268–73. DOI : 10.1093 / embo-reports / kvf052. PMC   1084016. PMID   11850402.
• Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. DOI : 10.1017 / S1355838202021088. PMC   1370266. PMID   11991638.