Войти
| Манолис Келлис | |
|---|---|
 Манолис Келлис на встрече Американского общества генетиков человека (ASHG) в Орландо, Флорида, 19 октября 2017 г. | |
| Родился | Манолис Камвиселлис Греческий : Μανώλης Καμβυσέλλης ( 1977-03-13)13 марта 1977 г. (44 года) Афины, Греция |
| Альма-матер | Массачусетский технологический институт (доктор философии) |
| Известен | КОДИРОВАТЬ |
| Награды | |
| Научная карьера | |
| Поля | |
| Тезис | Вычислительная сравнительная геномика: гены, регуляция, эволюция. (2003) |
| Докторант | |
| Веб-сайт | compbio.mit.edu |
Манолис Kellis ( греческий : Μανώλης Καμβυσέλλης, 1977 г.р.) является профессором компьютерных наук в Массачусетском технологическом институте (MIT) в области вычислительной биологии и членом Broad Institute Массачусетского технологического института и Гарвардского университета. Он возглавляет группу вычислительной биологии в Массачусетском технологическом институте и является главным исследователем в лаборатории компьютерных наук и искусственного интеллекта (CSAIL) в Массачусетском технологическом институте.
Келлис известен своим вкладом в геномику, генетику человека, эпигеномику, регуляцию генов и эволюцию генома. Он был одним из руководителей проекта NIH Roadmap Epigenomics Project по созданию всеобъемлющей карты эпигенома человека, сравнительного анализа 29 млекопитающих для создания всеобъемлющей карты консервативных элементов в геноме человека, проектов ENCODE, GENCODE и modENCODE для характеристики гены, некодирующие элементы и схемы генома человека и модельных организмов. Основное внимание в его работе уделяется пониманию влияния генетических вариаций на болезни человека, включая ожирение, диабет, болезнь Альцгеймера, шизофрению и рак.
Келлис родился в Греции, переехал с семьей во Францию, когда ему было 12, и приехал в США в 1993 году. Он получил докторскую степень в Массачусетском технологическом институте, где он работал с Эриком Ландером, директором-основателем Института Броуда, и Бонни Бергер, профессор Массачусетского технологического института и получил премию Спроулза за лучшую докторскую диссертацию в области компьютерных наук и первую стипендию для аспирантов Пэрис Канеллакис. До вычислительной биологии он работал над искусственным интеллектом, распознаванием эскизов и изображений, робототехникой и вычислительной геометрией в Массачусетском технологическом институте и исследовательском центре Xerox в Пало-Альто.
По состоянию на июль 2018 года Манолис Келлис является автором 187 журнальных публикаций, которые были процитированы 68380 раз. Он помог руководить несколькими крупномасштабными проектами в области геномики, в том числе проектом Roadmap Epigenomics, проектом Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE), проектом Genotype Tissue-Expression (GTEx).
Келлис начал сравнивать геномы видов дрожжей, будучи аспирантом Массачусетского технологического института. В рамках этой работы, опубликованной в журнале Nature в 2003 году, он разработал вычислительные методы, позволяющие выявить закономерности сходства и различия между близкородственными геномами. Цель заключалась в разработке методов понимания геномов с целью их применения в геноме человека.
Он перешел от дрожжей к мухам и, в конечном итоге, к млекопитающим, сравнивая несколько видов, чтобы изучить гены, их элементы управления и их дерегуляцию при заболеваниях человека. Келлис руководил несколькими проектами в области сравнительной геномики человека, млекопитающих, мух и дрожжей.
Келлис был одним из руководителей финансируемого правительством проекта NIH по каталогизации эпигенома человека. Он сказал в интервью MIT Technology Review: «Если геном - это книга жизни, то эпигеном - это полный набор аннотаций и закладок». Его лаборатория теперь использует эту карту для более глубокого понимания фундаментальных процессов и болезней у людей.
Келлис и его коллеги использовали эпигеномные данные, чтобы исследовать механистическую основу сильнейшей генетической связи с ожирением. Они показали, что этот механизм действует в жировых клетках как людей, так и мышей, и подробно описали, как изменения в соответствующих областях генома вызывают переход от рассеивания энергии в виде тепла ( термогенез ) к хранению энергии в виде жира. Полное понимание этого явления может привести к лечению людей, у которых «медленный метаболизм» приводит к избыточному весу.
Келлис, Ли-Хуэй Цай и другие из Массачусетского технологического института использовали эпигеномную маркировку в мозге человека и мыши для изучения механизмов, ведущих к болезни Альцгеймера. Они показали, что активация иммунных клеток и воспаление, которые долгое время были связаны с этим заболеванием, не являются просто результатом нейродегенерации, как утверждали некоторые исследователи. Скорее, у мышей, у которых развились симптомы, подобные болезни Альцгеймера, они обнаружили, что иммунные клетки начинают меняться еще до того, как наблюдаются нейронные изменения.
Келлис является участником проекта Genotype-Tissue Expression (GTEx), который стремится выяснить основы предрасположенности к заболеваниям. Это проект, спонсируемый Национальным институтом здравоохранения (NIH), цель которого - охарактеризовать генетические вариации в тканях человека с их ролью в диабете, сердечных заболеваниях и раке.
На сегодняшний день его лаборатория накопила специальные знания в области ожирения, диабета, болезни Альцгеймера, шизофрении и рака.
В дополнение к своим исследованиям, Келлис в течение нескольких лет совместно преподавал необходимые для студентов вводные курсы алгоритмов MIT 6.006: Введение в алгоритмы и 6.046: Дизайн и анализ алгоритмов с профессорами. Рон Ривест, Эрик Демейн, Петр Индик, Шринивас Девадас и другие.
Он также преподает курс вычислительной биологии в Массачусетском технологическом институте под названием «Вычислительная биология: геномы, сети, эволюция». Курс (6.047 / 6.878) предназначен для продвинутых студентов и аспирантов, стремящихся изучить основы алгоритмического и машинного обучения вычислительной биологии, а также познакомиться с текущими рубежами исследований, чтобы стать активными практиками в этой области. Он начал 6.881: Вычислительная персональная геномика: понимание полных геномов. Этот курс направлен на изучение вычислительных задач, связанных с интерпретацией того, как различия в последовательностях между людьми приводят к фенотипическим различиям, таким как экспрессия генов, предрасположенность к заболеванию или реакция на лечение.
Келлис получил Президентскую премию США за раннюю карьеру для ученых и инженеров (PECASE), награду Национального научного фонда CAREER, стипендию Sloan Research Fellowship, медаль Грегора Менделя за выдающиеся достижения в науке от комитета по лекциям Менделя, Афинские информационные технологии (AIT). Премия Ники в области науки и техники, награда Рут и Джоэла Спира за преподавание и премия Джорджа М. Спроулза за лучшую докторскую степень. Диссертация по информатике в Массачусетском технологическом институте. Он был назван одним из 35 лучших новаторов в возрасте до 35 лет по версии журнала Technology Review за свои исследования в области сравнительной геномики.
