LIG4

редактировать
LIG4
Белок LIG4 PDB 1ik9.png
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы LIG4, LIG4S, ДНК-лигаза 4
Внешняя ИдентификаторыOMIM: 601837 MGI: 1335098 HomoloGene: 1736 GeneCard : LIG4
Расположение гена (человек)
Хромосома 13 (человек)
Chr. Хромосома 13 (человек)
Хромосома 13 (человек) Геномное расположение LIG4 Геномное расположение LIG4
Полоса 13q33.3Начало108,207,439 bp
конец108,218,368 bp
экспрессия РНК шаблон
PBB GE LIG4 206235 в fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
SpeciesHumanМышь
Entrez

3981

319583

Ensembl

ENSG00000174405

ENSMUSG00000049717

UniProt

P49917

Q8BTF7

Re fSeq (мРНК)

NM_176953. NM_001377042

RefSeq (белок)

NP_795927. NP_001363971

Местоположение (UCSC)Chr 13: 108,21 - 108,22 Мб <358.97 - 9.98 Мб Chr 8:
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-лигаза 4 - это фермент, который у человека кодируется ген LIG4.

Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Синдром LIG4
  • 3 Старение гемопоэтических стволовых клеток
  • 4 Взаимодействия
  • 5 Механизм
  • 6 Ссылки
  • 7 Дополнительная литература
Функция

Белок, кодируемый этим геном, является АТФ -зависимой ДНК-лигазой, который соединяет двухцепочечные разрывы во время негомологичного концевого соединения в пути репарации двухцепочечных разрывов. Это также важно для рекомбинации V (D) J. Lig4 образует комплекс с XRCC4 и далее взаимодействует с ДНК-зависимой протеинкиназой (ДНК-PK) и XLF / Cernunnos, которые также необходимы для NHEJ. Кристаллическая структура комплекса Lig4 / XRCC4 была решена. Дефекты этого гена являются причиной синдрома LIG4. Гомолог Lig4 у дрожжей - Dnl4.

Синдром LIG4

У людей дефицит ДНК-лигазы 4 приводит к клиническому состоянию, известному как синдром LIG4. Этот синдром характеризуется клеточной радиационной чувствительностью, задержкой роста, задержкой развития, микроцефалией, дисморфизмом лица, повышенным предрасположением к лейкемии, различной степенью иммунодефицита и сниженным количеством клеток крови.

Старение гемопоэтических стволовых клеток

Накопление повреждений ДНК, приводящих к истощению стволовых клеток, считается важным аспектом старения. Дефицит lig4 в плюрипотентных стволовых клетках нарушает негомологичное соединение концов (NHEJ) и приводит к накоплению двухцепочечных разрывов ДНК и усилению апоптоза. Дефицит Lig4 у мышей вызывает прогрессирующую потерю гемопоэтических стволовых клеток и клеточности костного мозга во время старения. Чувствительность гемопоэтических стволовых клеток к дефициту lig4 предполагает, что lig4-опосредованный NHEJ является ключевым фактором, определяющим способность стволовых клеток противостоять физиологическому стрессу с течением времени.

Взаимодействия

LIG4 был показано, что взаимодействует с XRCC4 через свой домен BRCT. Это взаимодействие стабилизирует белок LIG4 в клетках; клетки, дефицитные по XRCC4, такие как клетки XR-1, имеют пониженные уровни LIG4.

Механизм

LIG4 является АТФ-зависимой ДНК-лигазой. LIG4 использует АТФ для аденилирования, а затем переносит группу АМФ на 5'-фосфат одного конца ДНК. Нуклеофильная атака 3'-гидроксильной группой второго конца ДНК и высвобождение АМФ дают продукт лигирования. Аденилирование LIG4 стимулируется XRCC4 и XLF.

Ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-05-26 08:44:52
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте