KDM5D

KDM5D
Доступные структуры PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB Список кодов идентификаторов PDB 2E6R, 2YQE
Идентификаторы
Псевдонимы	KDM5D, HY, HYA, JARID1D, SMCY, лизиндеметилаза 5D
Внешние идентификаторы	OMIM: 426000 MGI: 99780 HomoloGene: 55838 GeneCards: KDM5D
Расположение гена ( Человек) Chr. Y-хромосома (человек) Полоса Yq11.223 Начало 19,703,865 bp Конец 19,744,939 bp
Расположение гена (мышь) Chr. Y-хромосома (мышь) Полоса Y | Y A1 Начало 897,788 bp Конец 956,786 bp
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонной экспрессии
Генная онтология Молекулярная функция •активность гистон-деметилазы (специфическая для H3-K4). •связывание с ДНК. •активность оксидоредуктазы. •активность диоксигеназы. •связывание иона металла. •активность гистон-деметилазы. •связывание с рецептором андрогена. •GO: 0001948 связывание с белком. •GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая. •GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, РНК-полимераза II -специфическое. •связывание с хроматином. •гистондеметилазная активность (специфическая для H3-триметил-K4). •связывание метилированного гистона. клеточный компонент •ядро ​​клетки. •нуклеоплазма. •фибриллярный центр. •клеточный компонент. •комплекс гистонметилтрансферазы. Биологический процесс •деметилирование гистона H3-K4. •окислительно-восстановительный процесс. •Процессинг и презентация Т-клеточного антигена. •транскрипция, ДНК-шаблон. •регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •регуляция сигнального пути рецептора андрогена. •организация хроматина. •Дункан Кийдж. •отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •деметилирование гистона H3-K4, специфичное для триметил-H3-K4. •ремоделирование хроматина. Источники: Amigo / QuickGO
Orthologs
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8284	20592
Ensembl	ENSG00000012817	ENSMUSG00000056673
UniProt	Q9BY66	NM62240
RefSeq (mRNA_001170)	261>NM_001146706. NM_004653	NM_011419
RefSeq (белок)	NP_001140177. NP_001140178. NP_004644	NP_035549
Местоположение (UCSCr) <1926.7>Mb	Chr Y: 0,9 - 0,96 Mb
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование Человека Просмотр / редактирование мыши

Лизин-специфическая деметилаза 5D является фермент, который у человека кодируется геном KDM5D . KDM5D принадлежит к суперсемейству альфа-кетоглутарат-зависимых гидроксилаз.

Этот ген кодирует белок, содержащий домены цинковых пальцев. Короткий пептид, полученный из этого белка, представляет собой минорный антиген гистосовместимости, который может приводить к отторжению трансплантата мужских донорских клеток у женщины-реципиента.

• белок JARID1D +, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Медицинские предметные заголовки (MeSH)
• Обзор всей доступной структурной информации в PDB для UniProt : Q9BY66 (лизин-специфическая деметилаза 5D) в PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, которая находится в общественном достоянии.

.