DNA pol IV | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||
Организм | Escherichia coli. (стр. K-12, подстр. MG1655) | ||||||
Символ | dinB | ||||||
Альт. символы | dinP | ||||||
Entrez | 944922 | ||||||
RefSeq (Prot) | NP_414766.1 | ||||||
UniProt | Q47155 | ||||||
Прочие данные | |||||||
Номер EC | 2.7.7.7 | ||||||
Хромосома | геном: 0,25 - 0,25 Мб | ||||||
|
ДНК-полимераза IV является прокариотическая полимераза, которая участвует в мутагенезе. Он не проявляет активности 3 '→ 5' экзонуклеазы (корректура) и, следовательно, подвержен ошибкам. В E. coli ДНК-полимераза IV (Pol 4) участвует в нецелевом мутагенезе. Pol IV представляет собой полимеразу семейства Y, экспрессируемую геном dinB, который включается посредством индукции SOS, вызванной остановкой полимеразы на вилке репликации. Во время индукции SOS продукция Pol IV увеличивается в десять раз, и одна из функций в это время - вмешиваться в процессивность холоэнзима Pol III. Это создает контрольную точку, останавливает репликацию и дает время для восстановления повреждений ДНК с помощью соответствующего пути восстановления. Другой функцией Pol IV является выполнение транслезионного синтеза в остановленной репликационной вилке, например, обход аддуктов N2-дезоксигуанина с большей скоростью, чем трансверсия неповрежденной ДНК. Клетки, лишенные гена dinB, имеют более высокую скорость мутагенеза, вызванного повреждающими ДНК агентами.
Реактивные формы кислорода производятся непрерывно во время нормального метаболизма, и эти повредить ДНК. ДНК-полимераза IV может катализировать транслезионный синтез при различных повреждениях ДНК, включая 8-оксогуанин, серьезное окислительное повреждение с высоким мутагенным потенциалом. При дупликации хромосомы с помощью репликативных полимераз нерепарированный 8-оксогуанин имеет тенденцию ошибочно спариваться с A, так что во время следующего раунда репликации трансверсия G: C в T: A возникает мутация (G: C → 8-oxoG: C → 8-oxoG: A → T: A). Однако, когда ДНК-полимераза IV вмешивается, чтобы обойти повреждение, она предпочтительно включает правильный нуклеотид CTP напротив 8-оксогуанина с высокой эффективностью, что позволяет избежать потенциальных мутаций (G: C → 8-oxoG: C → 8- oxoG: C → GC).