TUBA1A

редактировать
TUBA1A
Белок TUBA1A PDB 1ffx.png
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы TUBA1A, B-ALPHA-1, LIS3, TUBA3, тубулин альфа 1a
Внешние идентификаторыOMIM: 602529 MGI: 98869 HomoloGene: 68498 Генные карты: TUBA1A
Местоположение гена (человек)
Хромосома 12 (человека)
Chr. Хромосома 12 (человек)
Хромосома 12 (человека) Геномное расположение TUBA1A Геномное расположение TUBA1A
полоса 12q13.12Начало49,184,795 bp
Конец49,189,080 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TUBA1A 209251 x at fs.png .. PBB GE TUBA1A 209118 s на fs.png .. PBB GE TUBA1A 201090 x на fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

7846

22142

Ensembl

ENSG00000167552

ENSMUSG00000072235

UniProt

Q71U36

P68369

RefSeq (mRNA)

NM_006009 <28703_00_002000_002000_001>NM_011653

RefSeq (белок)

NP_001257328. NP_001257329. NP_006000

NP_035783

Местоположение (UCSC)Chr 12: 49,18 - 49,19 Мб н / д
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цепь альфа-1А тубулина - это белок, который у человека кодируется ген TUBA1A .

Содержание
  • 1 Предпосылки
  • 2 Функция
  • 3 Взаимодействия
  • 4 Заболевание
  • 5 Модель животного
  • 6 Ссылки
  • 7 Дополнительная литература
  • 8 Внешние ссылки
Предпосылки

TUBA1A - это структурный ген, который кодирует тубулин, продукт Alpha 1A. Продукт TUBA1A представляет собой альфа-тубулин, который участвует в образовании микротрубочек - структурных белков, которые участвуют в структуре цитоскелета. В частности, микротрубочки состоят из гетеродимера молекул альфа и бета-тубулина. Cowan et al. продемонстрировали, что bα1 является первичным α-тубулином головного мозга человека и что он экспрессируется исключительно в этой структуре посредством Нозерн-блоттинга. Miller et al. более подробно остановился на роли α-тубулинов и процессе развития и созревания нейронов, сравнивая экспрессию крысинских α-тубулинов Tα1 и T26. Эти два крысиных α-тубулина являются гомологами bα1 и kα1, что свидетельствует о том, что крысиный гомолог человеческого TUBA1A (Tα1) имел повышенную экспрессию во время расширения нейрональных процессов. Культивирование клеток феохромоцитомы с фактором роста нервов (NGF) индуцировало дифференцировку и развитие нейрональных процессов. Нозерн-блоттинг показал заметно повышенные уровни экспрессии мРНК Tα1; Экспрессия мРНК T26 минимально увеличивалась при воздействии NGF. Эти данные предполагают, что TUBA1A моделирует мозг, участвуя в управлении миграцией нейронов за счет способности микротрубочек легко образовывать и разрушать полимеры, расширять и втягивать отростки, вызывая нуклеокинез. Poirier et al. использовали гибридизацию РНК in situ, чтобы показать экспрессию TUBA1A в эмбрионе мышей; срезы эмбрионов на 16,5-й день эмбриона «показали сильную маркировку в конечном мозге, промежуточном и среднем мозге, развивающемся мозжечке, стволе головного мозга, спинном мозге и ганглиях задних корешков».

Функция

Микротрубочки эукариотического цитоскелета выполняют важные и разнообразные функции и состоят из гетеродимера альфа- и бета-тубулинов. Гены, кодирующие эти составляющие микротрубочек, принадлежат к суперсемейству тубулинов, которое состоит из шести различных семейств. Гены из семейств альфа, бета и гамма тубулина обнаруживаются у всех эукариот. Альфа- и бета-тубулины представляют собой основные компоненты микротрубочек, в то время как гамма-тубулин играет решающую роль в зарождении сборки микротрубочек. Существует множество генов альфа и бета тубулина, которые высоко консервативны среди видов. Этот ген кодирует альфа-тубулин и очень похож на ген Tuba1 мыши и крысы. Нозерн-блоттинг исследования показали, что экспрессия гена преимущественно обнаруживается в морфологически дифференцированных неврологических клетках. Этот ген является одним из трех генов альфа-тубулина в кластере на хромосоме 12q.

Взаимодействия

Было показано, что TUBA1A взаимодействует с PAFAH1B1.

Болезнь

Мутации гена TUBA1A клинически проявляются как лиссэнцефалия 3 типа. В целом лиссэнцефалия характеризуется агирией (отсутствие извилин и борозд в головном мозге - гладкий мозг), судорожной активностью, задержкой развития, а также умственной отсталостью и психомоторной отсталостью, часто в значительной степени. Симптомы лизэнцефалии Lis3 не особенно отличаются от генерализованной лизэнцефалии (Lis1, относящейся к PAFAH1B1). Диагноз лиссэнцефалии обычно ставится на основании профиля симптомов, тогда как отнесение к конкретному типу определяется с помощью микрочипа. Лечение симптоматическое; противосудорожные препараты при судорожной активности, гастростомия по кнопке g для кормления ребенка, физиотерапия при мышечных расстройствах. Мутация TUBA1A часто встречается в микролисэнцефалии

животной модели

Keays et al. описывают мышь с мутацией гена TUBA1A, индуцированной N-этил-N-нитрозомочевиной. Соответствующая точечная мутация привела к S140G; сайт мутации участвует в N-сайте образовавшегося α-тубулина и участвует в стабилизации полимера α-β тубулина путем связывания GTP на этом сайте. Мутация S140G привела к образованию «нарушенного кармана связывания GTP». Авторы отмечают дефекты, связанные с корковыми слоями II / III и IV, особенно с миграцией корковых нейронов (по сравнению с аналогами дикого типа), показывая, что мутация S140G имеет ценность в качестве модели для детализации болезни, связанной с гомологом TUBA человека.

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q71U36 (цепь человеческого тубулина альфа-1A) в PDBe-KB.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P68369 (цепь альфа-1А мышиного тубулина) в PDBe-KB.
Последняя правка сделана 2021-06-09 06:29:38
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте