Формиатдегидрогеназа N, трансмембранная | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||
Символ | Form-deh_trans | ||||||||||
Pfam | PF09163 | ||||||||||
InterPro | IPR015246 | ||||||||||
SCOPe | 1kqf / SUPFAM | ||||||||||
суперсемейство OPM | 3 | ||||||||||
белок OPM | 1kqf | ||||||||||
|
Формиатдегидрогеназы набор ферментов, которые катализируют окисление формиата до диоксида углерода, отдавая электроны второму субстрату, например NAD в формиат: НАД + оксидоредуктаза (EC 1.2.1.2) или к цитохрому в формиате: феррицитохром-b1 оксидоредуктаза (EC 1.2.2.1).
НАД-зависимые формиатдегидрогеназы важны в метилотрофных дрожжи и бактерии и жизненно важны для катаболизма соединений C1, таких как метанол. Цитохром-зависимые ферменты более важны в анаэробном метаболизме прокариот. Например, в E. coli, формиат: феррицитохром-b1 оксидоредуктаза представляет собой внутренний мембранный белок с двумя субъединицами и участвует в анаэробном нитратном дыхании.
НАД-зависимая реакция
Формиат + НАД ⇌ CO 2 + НАДН + Н
Цитохром-зависимая реакция
Формиат + 2 феррицитохром b1 ⇌ CO 2 + 2 ферроцитохром b1 + 2 H
Известно, что один из ферментов семейства оксидоредуктаз, в котором иногда используется вольфрам (бактериальная формиатдегидрогеназа H ), использует селен-молибденовый вариант молибдоптерина.
Трансмембранный домен бета-субъединицы формиатдегидрогеназы состоит из одной трансмембранной спирали. Этот домен действует как трансмембранный якорь, обеспечивая проводимость электронов внутри белка.
.