Chlamydophila

Chlamydophila является спорным бактериальным родом, принадлежащим к семейству Chlamydiaceae, отряд Chlamydiales, класс / тип Chlamydiae.

• 1 Таксономия
• 2 Дифференциация Chlamydophila
• 3 Виды
• 4 Ссылки
• 5 Внешние ссылки

Все Chlamydiae представляют собой анаэробные бактерии с двухфазным жизненным циклом развития, который зависит от обязательно внутриклеточного роста эукариотических клеток-хозяев.

Chlamydophila была признана рядом ученых в 1999 году: шесть видов у Chlamydophila и три в исходном роде, Chlamydia. Это было сразу видно, как спорные. В 2015 году виды Chlamydophila были реклассифицированы как Chlamydia. История классификации и реклассификации следующая.

Ранние критерии дифференциации видов хламидий не всегда работали хорошо. Например, в то время род C. psittaci отличается от C. trachomatis по устойчивости к сульфадиазину, хотя не все штаммы идентифицированы как C. psittaci в то время были устойчивыми, а C. pneumoniae был классифицирован по его внешнему виду при электронной микроскопии (ЭМ) и его способности инфицировать людей, хотя внешний вид ЭМ может отличаться от одной исследовательской группы к другой, и многие из этих видов инфицировали людей.

Систематическая таксономия, установленная для Chlamydiae в 1999 г., использовала реассоциацию ДНК-ДНК, 16S и 23S сходство генов рибосомной РНК, кластеризацию сходства последовательностей гены, кодирующие белок, и размер генома как критерии классификации. Поддерживающие критерии, такие как обнаружение антигена, окрашивание гликогена, ассоциация с хозяином и морфология EM, также использовались в зависимости от применимости и доступности.

Сравнительный геномный анализ в 2006 году выявил ряд сигнатурных белков, которые уникально присутствовали у видов из родов Chlamydia и Chlamydophila, что подтвердило отличимость Chlamydophila. Три года спустя эта точка зрения была оспорена новыми методами анализа всего генома, что привело к предложению «объединить Chlamydiaceae в единый род, Chlamydia». К 2010-м годам эта реклассификация «не была полностью принята или принята» микробиологами, что «привело к возврату к единственному оригинальному роду Chlamydia, который теперь включает все 9 видов, включая Chlamydia psittaci». По состоянию на 2013 год, Chlamydophila еще упоминается в некоторых базах данных, но спорный. Слияние рода Chlamydophila с родом Chlamydia в настоящее время является общепринятым.

Согласно авторам исследования 1999 г., означает Разница в реассоциации ДНК-ДНК, отличающая Chlamydophila от Chlamydia, составляет 10,1%, что является приемлемым значением для разделения родов. Хотя последовательности гена 16S рибосомной РНК этих двух близких к 95% идентичны, в отличие от других ранее установленных родов, авторы считают сходство менее 95% только руководством для создания новых родов в семьях хламидий. В исследовании авторы использовали сходство мест кодирования генов белков и рибосомных РНК в геноме (кластеры генов), чтобы помочь отличить Chlamydophila от Chlamydia. Кроме того, гены полноразмерной 23S рибосомной РНК видов двух родов были идентичны менее чем на 95%.

Такие различия, как морфология EM, устойчивость к антибиотикам, и внехромосомная плазмида обычно имеют видоспецифические характеристики.

К видам Chlamydophila относятся:

• Chlamydophila pneumoniae
• Chlamydophila pecorum
• Chlamydophila felis
• Chlamydophila psittaci
• Chlamydophila abortus
• Chlamydophila>8 References>Внешние ссылки