Войти
| Хламидии | |
|---|---|
 | |
| Chlamydia trachomatis | |
| Научная классификация | |
| Домен: | Бактерии |
| Superphylum: | Группа PVC |
| Тип: | Chlamydiae. Garrity Holt 2012 |
| Класс: | Chlamydiia. Гупта и др. 2016 |
| Отряды и семейства | |
| Синонимы | |
| |
Chlamydiae относятся к бактериальному типу и классу, члены которого представляют собой группу облигатных внутриклеточных бактерий, представители которых очень разнообразны., от патогенов людей и животных до симбионтов вездесущих простейших. Они имеют яйцевидную форму и окрашивают грамотрицательные. Исторически считалось, что все виды Chlamydiae имеют клеточную стенку, свободную от пептидогликана, но недавняя работа демонстрирует обнаруживаемое присутствие пептидогликана, а также других важных белков. Многие виды, принадлежащие к этому отряду, чувствительны к антимикробным препаратам. Все известные хламидии растут только при заражении эукариотических клеток-хозяев. По размеру они равны или меньше многих вирусов. Они зависят от репликации внутри клеток-хозяев, поэтому некоторые виды называются облигатными внутриклеточными патогенами, а другие - симбионтами вездесущих простейших. Большинство внутриклеточных хламидий находится в теле включения или вакуоли. Вне клеток они выживают только как внеклеточная инфекционная форма. Хламидии могут расти только там, где растут их клетки-хозяева, и развиваться в соответствии с характерным двухфазным циклом развития. Следовательно, хламидии нельзя размножать в бактериальной культуральной среде в клинической лаборатории. Хламидии наиболее успешно изолировать, пока они еще находятся внутри клеток-хозяев. Хламидии - это наиболее распространенная бактериальная ЗППП в Соединенных Штатах, и ежегодно регистрируется 2,86 миллиона хламидийных инфекций.
Хламидийное заболевание, поражающее глаза людей, впервые было описано в древних китайских и египетских рукописях. Современное описание хламидийных организмов было предоставлено Halberstaedrrter и von Prowazek в 1907 году. Изоляты хламидий, культивированные в желточных мешочках эмбрионирующих яиц, были получены в результате вспышки пневмонита у людей в конце 1920-е и начало 1930-х годов, а к середине 20-го века изоляты были получены от десятков видов позвоночных. Термин хламидиоз (плащ) появился в литературе в 1945 году, хотя продолжали использоваться и другие названия, в том числе Bedsonia, Miyagawanella, агенты орнитоза, TRIC- и PLT. В 1956 году Chlamydia trachomatis был впервые культивирован Тан Фей-фань, хотя они еще не были признаны бактериями.
В 1966 году., Chlamydiae были признаны бактериями, и род Chlamydia был подтвержден. Отряд Chlamydiales был создан Сторцем и Пейджем в 1971 году. Класс Chlamydiia был недавно опубликован. В период с 1989 по 1999 годы были признаны новые семейства, роды и виды. Тип Chlamydiae был установлен в Руководстве по систематической бактериологии Берджи. К 2006 г. были зарегистрированы генетические данные для более чем 350 линий хламидий,
Хламидии в настоящее время содержат восемь правомерно названных родов и 14 родов. В настоящее время тип состоит из двух отрядов (Chlamydiales, Parachlamydiales) и девяти семейств внутри одного класса (Chlamydiia). Только четыре из этих семейств имеют правильные названия (Chlamydiaceae, Parachlamydiaceae, Simkaniaceae, Waddliaceae ), а пять описаны как семейства (, и Rhabdochlamydiaceae ). Недавно описанный отряд Chlamydiales включает в себя семейства Chlamydiaceae, а новый отряд Parachlamydiales - оставшиеся семь семейств. Это предложение подтверждается наблюдением двух различных филогенетических клад, которые требуют таксономических рангов выше уровня семейства. Было обнаружено, что молекулярные сигнатуры в форме (CSI) и белков (CSP) уникально разделяются каждым отдельным отрядом, обеспечивая средства различения каждой клады от другой и поддерживая представление об общем происхождении семейств внутри каждого отряда. Отличие двух отрядов подтверждается также тем фактом, что CSI не были обнаружены среди других комбинаций семейств.
Также были обнаружены молекулярные сигнатуры, которые являются исключительными для семейства Chlamydiaceae. Chlamydiaceae первоначально состояли из одного рода, Chlamydia, но в 1999 году были разделены на два рода, Chlamydophila и Chlamydia. С 2015 года роды были объединены, а виды, принадлежащие к роду Chlamydophila, были реклассифицированы как виды Chlamydia. Однако CSI и CSP были обнаружены специально для видов Chlamydophila, что подтверждает их отличие от Chlamydia, что, возможно, требует дополнительного рассмотрения двух отдельных групп внутри семейства. Также были обнаружены CSI и CSP, которые являются исключительно общими для всех Chlamydia, что дополнительно указывает на происхождение, независимое от Chlamydophila, поддерживая способ отличить виды Chlamydia от соседних членов Chlamydophila.
Хламидии образуют уникальную бактериальную эволюционную группу, которая отделилась от других бактерий около миллиарда лет назад, и ее можно отличить по наличию нескольких CSI и CSP. Виды из этой группы можно отличить от всех других бактерий по наличию консервативных инделей в ряде белков и по большому количеству сигнатурных белков, которые уникально присутствуют в разных видах Chlamydiae. Различались сообщения о том, связаны ли хламидии с Planctomycetales или спирохетами. Однако секвенирование генома показывает, что 11% генов в UWE25 и 4% в Chlamydiaceae наиболее сходны с генами хлоропластов, растений и цианобактерий. Кавалер-Смит предположил, что хламидии попадают в кладу Planctobacteria в более крупную кладу Gracilicutes. Однако филогения и общее присутствие CSI в белках, которые являются клон-специфичными, указывают на то, что Verrucomicrobia являются ближайшими свободноживущими родственниками этих паразитических организмов. Сравнение генов рибосомной РНК предоставило филогению известных штаммов внутри Chlamydiae.
Три вида Chlamydiae, которые обычно инфицируют описаны люди:
Уникальный физиологический статус хламидий, включая их двухфазный жизненный цикл и обязанность реплицироваться в эукариотическом хозяине, позволил использовать анализ ДНК для диагностики хламидий. Горизонтальный перенос генов очевиден и усложняет эту область исследований. В одном крайнем примере два гена, кодирующие гистоноподобные белки H1 эукариотического происхождения, были обнаружены в прокариотическом геноме C. trachomatis, облигатного внутриклеточного патогена.
Филогения основана на Выпуск 123 LTP на основе 16S рРНК от The All-Species Living Tree Project.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chlamydiaceae |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) и NCBI
