В генетике, сентиморган (сокращенно cM ) или единица карты (mu ) - это единица измерения генетической связи. Он определяется как расстояние между положениями хромосомы (также называемыми локусами или маркерами ), для которых ожидаемое среднее число промежуточных хромосомных кроссоверов в одном поколении - 0,01. Он часто используется для определения расстояния по хромосоме. Однако это не настоящее физическое расстояние.
Число пар оснований, которым оно соответствует, широко варьируется в геноме (разные участки хромосомы имеют разную склонность к кроссоверу) и это также зависит от того, является ли мейоз, в котором происходит кроссинговер, частью оогенеза (формирование женских гамет) или сперматогенеза (образование мужских гамет).
Один сантиморган в среднем соответствует примерно 1 миллиону пар оснований у человека. Отношения только грубые, поскольку физическое хромосомное расстояние, соответствующее одному сантиморгану, варьируется от места к месту в геноме, а также варьируется между мужчинами и женщинами, поскольку рекомбинация во время формирования гамет у женщин происходит значительно чаще, чем у мужчин. Kong et al. рассчитали, что женский геном имеет длину 4460 см, а мужской геном - всего 2590 см. Plasmodium falciparum имеет среднее расстояние рекомбинации ~ 15 kb на сантиморган: маркеры разделены 15 kb ДНК (15 000 нуклеотидов) имеют ожидаемую скорость хромосомных кроссоверов 0,01 на поколение. Обратите внимание, что не- синтенические гены (гены, расположенные на разных хромосомах) по своей природе не связаны, и расстояния сМ к ним не применимы.
Поскольку генетическая рекомбинация между двумя маркерами обнаруживается только при нечетном количестве хромосомных кроссоверов между двумя маркерами, расстояние в centimorgans не совсем соответствует вероятности генетической рекомбинации. Предполагая, что Дж. Функция карты BS Haldane, в которой количество хромосомных кроссоверов распределяется согласно распределению Пуассона, генетическое расстояние d сантиморганов приведет к нечетному количеству хромосомных кроссоверов и, следовательно, детектируемая генетическая рекомбинация с вероятностью
где sinh - функция гиперболического синуса. Вероятность рекомбинации составляет приблизительно d / 100 для малых значений d и приближается к 50%, когда d стремится к бесконечности.
Формулу можно инвертировать, получив расстояние в сантиморганах как функцию вероятности рекомбинации:
Сантиморган был назван в честь генетика Томаса Ханта Моргана Дж. Б. С. Холдейн. Однако его родительская единица, morgan, сегодня используется редко.