Генетический маркер

редактировать
Цыплята на изображении генетической карты курица. Геном курицы содержит 39 пар хромосом, тогда как геном человека содержит 23 пары

A генетический маркер - это ген или последовательность ДНК с известным расположением на хромосома, которая может использоваться для идентификации людей или видов. Его можно описать как вариацию (которая может возникнуть из-за мутации или изменения в геномных локусах), которую можно наблюдать. Генетический маркер может быть короткой последовательностью ДНК, такой как последовательность, окружающая изменение одной пары оснований (однонуклеотидный полиморфизм, SNP), или длинной, например, минисателлиты.

Содержание
  • 1 Фон
  • 2 Типа
  • 3 Использование
  • 4 Ссылки
  • 5 См. Также
  • 6 Дополнительная литература
  • 7 Внешние ссылки
Предпосылки

На протяжении многих лет, картирование генов ограничивалось идентификацией организмов по традиционным фенотипическим маркерам. Это включало гены, которые кодировали легко наблюдаемые характеристики, такие как группа крови или форма семян. Недостаточное количество этих типов характеристик у некоторых организмов ограничивало усилия по картированию, которые могли быть выполнены. Это побудило к разработке генных маркеров, которые могли бы идентифицировать генетические характеристики, которые не так легко наблюдать у организмов (например, вариации белков).

Типы
Принцип обнаружения SFP для исследования генов

Некоторые часто используемые типы генетическими маркерами являются:

Молекулярно-генетические маркеры можно разделить на два класса: а) биохимические маркеры, которые обнаруживают вариации на уровне генных продуктов, такие как изменения в белках и аминокислоты и б) молекулярные маркеры, которые обнаруживают вариации на уровне ДНК, такие как нуклеотидные изменения: делеция, дупликация, инверсия и / или вставка. Маркеры могут иметь два типа наследования: доминантный / рецессивный или кодоминантный. Если генетический образец гомозигот можно отличить от гетерозигот, то считается, что маркер является содоминантным. Как правило, кодоминантные маркеры более информативны, чем доминантные.

Использование

Генетические маркеры могут использоваться для изучения взаимосвязи между наследственным заболеванием и его генетическая причина (например, конкретная мутация гена, которая приводит к дефектному белку ). Известно, что фрагменты ДНК, расположенные рядом друг с другом на хромосоме, обычно наследуются вместе. Это свойство позволяет использовать маркер, который затем можно использовать для определения точного паттерна наследования гена, который еще не был точно локализован.

Генетические маркеры используются в генеалогическом ДНК-тестировании для генетической генеалогии для определения генетического расстояния между людьми или популяциями. Однородительские маркеры (на митохондриальной или Y-хромосомной ДНК) изучаются для оценки материнских или отцовских линий. Аутосомные маркеры используются для всех предков.

Генетические маркеры должны быть легко идентифицируемыми, связанными с конкретным локусом и высоко полиморфными, поскольку гомозиготы не предоставляют никакой информации. Обнаружение маркера может быть прямым путем секвенирования РНК или непрямым с использованием аллозимов.

Некоторые из методов, используемых для изучения генома или филогенетики, включают ПДРФ, AFLP, RAPD., ССР. Их можно использовать для создания генетических карт любого изучаемого организма.

Были споры по поводу того, что является возбудителем передачи CTVT (трансмиссивная венерическая опухоль собак ). Многие исследователи выдвинули гипотезу о том, что вирусоподобные частицы были ответственны за трансформацию клетки, в то время как другие считали, что сама клетка способна инфицировать других собак как аллотрансплантат. С помощью генетических маркеров исследователи смогли предоставить убедительные доказательства того, что раковые опухолевые клетки превратились в трансмиссивного паразита. Кроме того, молекулярно-генетические маркеры были использованы для решения проблемы естественной передачи, породы происхождения (филогенетика ) и возраста опухоли у собаки.

Генетические маркеры также использовались для измерить геномный ответ на отбор домашнего скота. Естественный и искусственный отбор приводит к изменению генетического состава клетки. Присутствие разных аллелей из-за искаженной сегрегации по генетическим маркерам указывает на разницу между отобранным и невыборным домашним скотом.

Ссылки
См. Также
Дополнительная литература

.

Внешние ссылки

СМИ, относящиеся к генетическим маркерам на Wikimedia Commons

Последняя правка сделана 2021-05-21 14:57:22
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте