Войти
Малая РНК - это <200 nt (нуклеотид ) по длине и обычно представляют собой молекулы некодирующей РНК. подавление РНК часто является функцией этих молекул, наиболее распространенным и хорошо изученным примером является РНК-интерференция (РНКи), в которой эндогенно экспрессируемая микроРНК (миРНК) или экзогенно полученная малая интерферирующая РНК (миРНК) индуцирует деградацию комплементарной информационная РНК. Были идентифицированы другие классы малых РНК, включая piwi-взаимодействующую РНК (piRNA) и ее подвид связанную с повтором малую интерферирующую РНК (rasiRNA). Малая РНК «неспособна индуцировать только РНКи, и для выполнения поставленной задачи она должна формировать ядро РНК-белкового комплекса, называемого РНК-индуцированным комплексом подавления (RISC), особенно с белком аргонавта». Также мРНК используется при транскрипции.
Малая РНК может быть выбрана с помощью секвенирования микроРНК, метода, который выбирает малые молекулы РНК, а затем секвенирует молекулы размером 21-25 п.н. Первый анализ малых РНК с использованием методов miRNA-seq исследовал приблизительно 1,4 миллиона малых РНК из модельного растения Arabidopsis thaliana с использованием платформы для секвенирования массивно-параллельной сигнатуры Lynx Therapeutics 'Massively Parallel Signature Sequencing (MPSS). Это исследование продемонстрировало потенциал новых технологий высокопроизводительного секвенирования для изучения малых РНК и показало, что геномы генерируют большое количество малых РНК, причем растения являются особенно богатыми источниками малых РНК. В более поздних исследованиях использовались другие технологии секвенирования, такие как исследование C. elegans, которые идентифицировали 18 новых генов miRNA, а также новый класс малых РНК нематод, названный 21U-РНК. В другом исследовании, сравнивающем профили малых РНК опухолей шейки матки человека и нормальной ткани, использовался анализатор генома Illumina (компания) для идентификации 64 новых генов miРНК человека, а также 67 дифференциально экспрессируемых miRNA. Applied Biosystems Платформа для секвенирования SOLiD также использовалась для изучения прогностической ценности miRNA в обнаружении рака груди человека. Малая РНК полезна для определенных видов исследований, потому что ее молекулы «не нужно фрагментировать перед приготовлением библиотеки».
Виды малых РНК включают:
