Вторичная структура контрольной области митохондриальной ДНК A | |
---|---|
Консенсусная вторичная структура для всех гаплотипов контрольной области мтДНК. | |
Идентификаторы | |
Символ | мтДНК ssA |
Рфам | RF01853 |
Прочие данные | |
Тип РНК | Антисмысловая РНК |
Домен (ы) | Млекопитающие |
Структуры PDB | PDBe |
Контрольная область мтДНК представляет собой площадь митохондриального генома, который является некодирующей ДНК. Эта область контролирует синтез РНК и ДНК. Это наиболее полиморфная область генома мтДНК человека, причем полиморфизм сосредоточен в гипервариабельных областях. Среднее нуклеотидное разнообразие в этих регионах составляет 1,7%. Несмотря на эту вариабельность, транскрипт РНК из этого региона имеет консервативную вторичную структуру (на фото ), которая, как было обнаружено, находится под давлением отбора.
Контрольная область мтДНК содержит точку начала репликации одной цепи и точку начала транскрипции обеих цепей. Существует также открытая рамка считывания, которая, как считается, кодирует 7s рибосомную РНК у людей, но не у мышей или коров, где она была удалена.
Контрольная область и D-петля мтДНК иногда используются в литературе как синонимы; в частности, контрольная область включает D-петлю вместе с соседними участками промотора транскрипции. По этой причине, область управления также известна под аббревиатурой DLP, стоя на D - L OOP и связанную с P romoters.
Гаплотипы контрольной области мтДНК связаны с выносливостью у людей. В исследовании 2002 года была проведена секвенирование контрольной области 55 субъектов и сравнение их гаплотипа с увеличением VO 2 max после восьминедельной программы тренировок. Они обнаружили, что разные гаплотипы в значительной степени связаны с выносливостью испытуемых. Было высказано предположение, что это произошло потому, что контрольная область влияет на репликацию и транскрипцию в митохондриях.