См. Также:
Small Maf MAFG |
|
Доступные конструкции | PDB | Ортолог поиск: PDBe RCSB | Список идентификационных кодов PDB | 1К1В, 3А5Т | | |
Идентификаторы |
Псевдонимы | MAFG, hMAF, MAF, фактор транскрипции bZIP G |
Внешние идентификаторы | OMIM : 602020 MGI : 96911 HomoloGene : 81816 GeneCards : MAFG |
|
Расположение гена ( Мышь ) | | Chr. | Хромосома 11 (мышь) | | Группа | 11 E2 | 11 84,35 см | Начинать | 120 625 117 п.н. | Конец | 120 633 600 б.п. | |
|
Онтология генов | Молекулярная функция | • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание с ДНК • Связывание с белками GO: 0001948 • активность гетеродимеризации белков • GO: 0000980 ДНК, специфичная для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II связывание • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции активность, специфично для РНК-полимеразы II • Связывание с ДНК, специфичное для последовательности | Сотовый компонент | • нуклеоплазма • ядро | Биологический процесс | • регуляция дифференцировки эпидермальных клеток • позитивная регуляция экспрессии генов • поведение взрослых • свертывание крови • внутриутробное эмбриональное развитие • регуляция пролиферации клеточной популяции • регуляция клеточного pH • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция РНК-полимеразой II • положительная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II | Источники: Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
Разновидность | Человек | Мышь |
Entrez | | |
Ансамбль | | |
UniProt | | |
RefSeq (мРНК) | | |
RefSeq (белок) | | |
Расположение (UCSC) | Chr 17: 81.92 - 81.93 Мб | Chr 11: 120,63 - 120,63 Мб |
PubMed поиск | | |
Викиданные |
|
Фактор транскрипции MafG является BZIP Maf фактор транскрипции белка, что в организме человека кодируется MAFG гена.
MafG является одним из небольших белков Maf, которые являются факторами транскрипции основного региона и типа лейциновой молнии (bZIP). Утвержденное комитетом по номенклатуре генов HUGO название гена MAFG - «гомолог G онкогена мышечно-апоневротической фибросаркомы v-maf птиц».
СОДЕРЖАНИЕ
- 1 открытие
- 2 Структура
- 3 Выражение
- 4 Функция
- 5 Целевые гены
- 6 Связь с заболеванием
- 7 Примечания
- 8 ссылки
- 9 Дальнейшее чтение
- 10 Внешние ссылки
Открытие
MafG был впервые клонирован и идентифицирован у кур в 1995 году как новый член малых генов Maf (sMaf). MAFG был идентифицирован у многих позвоночных, включая человека. У позвоночных есть три функционально избыточных белка sMaf: MafF, MafG и MafK.
Состав
MafG имеет структуру bZIP, которая состоит из основной области для связывания ДНК и структуры лейциновой молнии для образования димеров. Подобно другим sMaf, MafG не имеет каких-либо канонических доменов активации транскрипции.
Выражение
MAFG широко, но по-разному экспрессируется в различных тканях. Экспрессия MAFG была обнаружена во всех 16 тканях, исследованных в рамках проекта BodyMap человека, но относительно много в тканях легких, лимфатических узлов, скелетных мышц и щитовидной железы. Экспрессия гена MafG индуцируется окислительными стрессами, такими как перекись водорода и электрофильные соединения. Ген Mafg мыши индуцируется гетеродимерами Nrf2-sMaf через элемент антиоксидантного ответа (ARE) в проксимальной области промотора. В ответ на действие желчных кислот ген Mafg мыши индуцируется ядерным рецептором FXR ( рецептор Фарнезоида X ).
Функция
Из-за сходства последовательностей не наблюдалось никаких функциональных различий между sMaf с точки зрения их структур bZIP. sMafs сами по себе образуют гомодимеры и гетеродимеры с другими специфическими факторами транскрипции bZIP, такими как белки CNC (cap 'n' collar) [p45 NF-E2 ( NFE2 ), Nrf1 ( NFE2L1 ), Nrf2 ( NFE2L2 ) и Nrf3 ( NFE2L3 )] и белки Баха ( BACH1 и BACH2 ).
Гомодимеры sMaf связываются с палиндромной последовательностью ДНК, называемой элементом распознавания Maf (MARE: T GC TGACTCA GC A), и его родственными последовательностями. Структурный анализ показал, что основная область фактора Maf распознает фланкирующие последовательности GC. Напротив, гетеродимеры CNC-sMaf или Bach-sMaf предпочтительно связываются с последовательностями ДНК (RTGA (C / G) NNN GC: R = A или G), которые немного отличаются от MARE. Последние последовательности ДНК были признаны как элементы антиоксидантного / электрофильного ответа или мотивы связывания NF-E2, с которыми связываются гетеродимеры Nrf2-sMaf и гетеродимеры p45 NF-E2-sMaf, соответственно. Было предложено, чтобы последние последовательности были классифицированы как элементы связывания CNC-sMaf (CsMBEs).
Также сообщалось, что sMaf образуют гетеродимеры с другими факторами транскрипции bZIP, такими как c-Jun и c-Fos.
Целевые гены
sMaf регулируют различные гены-мишени в зависимости от своих партнеров. Например, гетеродимер p45-NF-E2-sMaf регулирует гены, ответственные за продукцию тромбоцитов. Гетеродимер Nrf2-sMaf регулирует батарею цитопротекторных генов, таких как гены ферментов, метаболизирующих антиоксидант / ксенобиотик. Гетеродимер Bach1-sMaf регулирует ген гемоксигеназы-1. В частности, сообщалось, что гетеродимеры Bach1-MafG участвуют в гиперметилировании генов с промоторами островков CpG при определенных типах рака. Вклад отдельных sMafs в регуляцию транскрипции их генов-мишеней еще недостаточно изучен.
Связь с заболеванием
Утрата sMaf приводит к появлению болезнеподобных фенотипов, как показано в таблице ниже. Мыши, лишенные MafG, проявляют мягкий нейрональный фенотип и умеренную тромбоцитопению. Однако у мышей, лишенных Mafg и одного аллеля Mafk ( Mafg - / -:: Mafk +/-), наблюдаются более тяжелые нейрональные фенотипы, тяжелая тромбоцитопения и катаракта. Мыши без MafG и MafK ( Mafg - / -:: Mafk - / -) умирают в перинатальной стадии. Наконец, мыши, лишенные MafF, MafG и MafK, являются эмбриональными летальными. Эмбриональные фибробласты, которые получены из Maff - / -:: Mafg - / -:: Mafk - / - мышей не в состоянии активировать Nrf2-зависимые гены цитопротекторных в ответ на стресс.
Генотип | Фенотип мыши |
Maff | Mafg | Mafk |
| - / - | | Легкая моторная атаксия, легкая тромбоцитопения |
| - / - | +/− | Тяжелая моторная атаксия, прогрессирующая дегенерация нейронов, тяжелая тромбоцитопения и катаракта |
| - / - | - / - | Более тяжелые нейрональные фенотипы и перинатальный летальный исход |
- / - | +/− | - / - | Нет серьезных отклонений от нормы (фертильность) |
- / - | - / - | - / - | Задержка роста, гипоплазия печени плода и летальный исход около эмбрионального дня, 13,5 |
+/- ( гетерозигота ), - / - ( гомозигота ), пустой (дикий тип) |
Кроме того, накапливающиеся данные свидетельствуют о том, что как партнеры белков CNC и Баха sMaf участвуют в возникновении и прогрессировании различных заболеваний человека, включая нейродегенерацию, артериосклероз и рак.
Примечания
использованная литература
дальнейшее чтение
- Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791. PMID 8889548.
- Johnsen O, Skammelsrud N, Luna L, Nishizawa M, Prydz H, Kolstø AB (ноябрь 1996 г.). «Малые белки Maf взаимодействуют с человеческим фактором транскрипции TCF11 / Nrf1 / LCR-F1». Исследования нуклеиновых кислот. 24 (21): 4289–97. DOI : 10.1093 / NAR / 24.21.4289. PMC 146217. PMID 8932385.
- Токи Т., Ито Дж., Китадзава Дж., Араи К., Хатакеяма К., Акасака Дж., Игараси К., Номура Н., Ёкояма М., Ямамото М., Ито Э. (апрель 1997 г.). «Человеческие малые белки Maf образуют гетеродимеры с факторами транскрипции семейства CNC и распознают мотив NF-E2». Онкоген. 14 (16): 1901–10. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201024. PMID 9150357.
- Бланк В., Ким MJ, Эндрюс, Северная Каролина (июнь 1997 г.). «Человеческий MafG является функциональным партнером p45 NF-E2 в активации экспрессии гена глобина». Кровь. 89 (11): 3925–35. DOI : 10.1182 / blood.V89.11.3925. PMID 9166829.
- Марини М.Г., Чан К., Казула Л., Кан Ю.В., Цао А., Мой П. (июнь 1997 г.). «hMAF, небольшой фактор транскрипции человека, который специфически гетеродимеризуется с Nrf1 и Nrf2». Журнал биологической химии. 272 (26): 16490–7. DOI : 10.1074 / jbc.272.26.16490. PMID 9195958.
- Blank V, Knoll JH, Andrews NC (август 1997 г.). «Молекулярная характеристика и локализация человеческого гена MAFG». Геномика. 44 (1): 147–9. DOI : 10.1006 / geno.1997.4847. PMID 9286713.
- Дхакшинамурти С., Джайсвал А.К. (декабрь 2000 г.). «Малые белки maf (MafG и MafK) негативно регулируют опосредованную элементами антиоксидантного ответа экспрессию и антиоксидантную индукцию гена NAD (P) H: хинон оксидоредуктазы1». Журнал биологической химии. 275 (51): 40134–41. DOI : 10.1074 / jbc.M003531200. PMID 11013233.
- Катаока К., Ёситомо-Накагава К., Сиода С., Нисидзава М. (январь 2001 г.). «Набор белков Hox взаимодействует с онкобелком Maf, подавляя его ДНК-связывание, трансактивацию и трансформирующую активность». Журнал биологической химии. 276 (1): 819–26. DOI : 10.1074 / jbc.M007643200. PMID 11036080.
- Хунг Х.Л., Ким А.Ю., Хонг В., Раковски С., Блобель Г.А. (апрель 2001 г.). «Стимуляция связывания ДНК NF-E2 ацетилированием, опосредованным CREB-связывающим белком (CBP)». Журнал биологической химии. 276 (14): 10715–21. DOI : 10.1074 / jbc.M007846200. PMID 11154691.
- Кусуноки Х., Мотохаши Х., Кацуока Ф., Морохаши А., Ямамото М., Танака Т. (апрель 2002 г.). «Структура раствора ДНК-связывающего домена MafG». Структурная биология природы. 9 (4): 252–6. DOI : 10.1038 / nsb771. PMID 11875518. S2CID 23687470.
- Дхакшинамурти С., Джайсвал А.К. (август 2002 г.). «c-Maf отрицательно регулирует опосредованную ARE экспрессию генов детоксицирующих ферментов и индукцию антиоксидантов». Онкоген. 21 (34): 5301–12. DOI : 10.1038 / sj.onc.1205642. PMID 12149651.
- Трамьер М., Готье I, Пиолот Т., Равале С., Кемниц К., Коппи Дж., Дюрье С., Миньотт В., Коппи-Мойзан М. (декабрь 2002 г.). «Пикосекундная гетеро-FRET микроскопия для исследования белок-белковых взаимодействий в живых клетках». Биофизический журнал. 83 (6): 3570–7. Bibcode : 2002BpJ.... 83.3570T. DOI : 10.1016 / S0006-3495 (02) 75357-5. PMC 1302432. PMID 12496124.
- Ямамото Т., Кио М., Камия Т., Танака Т., Энгель Д.Д., Мотохаши Х., Ямамото М. (июнь 2006 г.). «Правила предиктивной замены оснований, которые определяют связывание и транскрипционную специфичность элементов распознавания Maf» (PDF). Гены в клетки. 11 (6): 575–91. DOI : 10.1111 / j.1365-2443.2006.00965.x. ЛВП : 2027,42 / 71635. PMID 16716189. S2CID 5546846.
внешние ссылки
- MAFG + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O54790 (фактор транскрипции MafG) в PDBe-KB.
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.