Лимфоидный энхансер-связывающий фактор 1

LEF1
Доступные конструкции PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2LEF, 3OUW, 3OUX
Идентификаторы
Псевдонимы	LEF1, LEF-1, TCF10, TCF1ALPHA, TCF7L3, фактор связывания лимфоидного энхансера 1
Внешние идентификаторы	MGI : 96770 HomoloGene : 7813 GeneCards : LEF1
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 4 (человек) Группа 4q25 Начинать 108 047 545 п.н. Конец 108 168 956 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 3 (мышь) Группа 3 G3 | 3 60,78 см Начинать 131 110 471 п.н. Конец 131 224 356 п.н.
Паттерн экспрессии РНК Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, РНК полимеразы II, специфичные • гистондеацетилазы связывания • броненосец повтора домена связывания • эстроген связывание рецептор • связывания ДНК последовательности специфического РНК - полимераза II транскрипция регуляторной области • транскрипционного фактора связывание • активности рецептора эстроген • гамма-катениной связывания • гистон связывания • С2Н2 цинк домен пальца связывание • хроматина связывания • цистеина типа ингибитора эндопептидазы активности участвуют в апоптотической процесса • ГО: связывание 0001948 белок • связывания ДНК, гибка • ДНК связывания • последовательность-специфическое связывание ДНК • фактор транскрипции, активность РНК - полимеразы II, дистальный энхансер последовательность-специфический связывающий • Связывание с бета-катенином • GO: 0000980 Связывание ДНК с цис-регуляторной областью РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции активность, специфическая к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • цитоплазма • ядро • транскрипция регулятор комплекс • бета-катенин-TCF комплекс • нуклеоплазма • комплекс белок-ДНК Биологический процесс • сомитогенез • развитие языка • формирование параксиальной мезодермы • регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • негативная регуляция связывания ДНК • рекомбинация Т-клеточного рецептора V (D) J • транскрипция с помощью РНК-полимеразы II • клеточный ответ на цитокиновый стимул • развитие молочной железы • отрицательная регуляция выработки интерлейкина-13 • одонтогенез дентинсодержащего зуба • апоптотический процесс, участвующий в морфогенезе кровеносных сосудов • хемотаксис клеток • негативная регуляция канонического пути передачи сигналов Wnt • морфогенез лица • дифференцировка нейтрофилов • негативная регуляция продукции интерлейкина-5 • регуляция транскрипция, ДНК-шаблон • развитие зубчатой ​​извилины • апоптотический процесс, участвующий в морфогенезе • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • позитивная регуляция роста клеток • регуляция сигнального пути Wnt • эмбриональный морфогенез конечности • развитие гипоталамуса • разветвление кровеносных сосудов морфогенез • развитие трахеи • регуляция развития поперечно-полосатой мышечной ткани • позитивная регуляция клеточно-клеточной адгезии • деление нейробластов переднего мозга • пигментация глаза • негативная регуляция апоптотического процесса • прорастание ангиогенеза • негативная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II • позитивная регуляция эпителия к мезенхимальному переходу • сигнальный путь BMP • позитивная регуляция процесса клеточного цикла • дифференцировка остеобластов • ацетилирование гистона H3 • образование радиальных глиальных каркасов • позитивная регуляция дифференцировки гранулоцитов • дифференцировка альфа-бета-Т-клеток • канонический сигнальный путь Wnt • негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • сенсорное восприятие вкуса • клеточный ответ на интерлейкин-4 • негативная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • развитие клеток • негативная регуляция межклеточной адгезии • негативная регуляция продукции интерлейкина-4 • негативная р регуляция развития поперечно-полосатой мышечной ткани • позитивная регуляция миграции клеток • сигнальный путь Wnt • дифференцировка Т-хелперов 1 клеток • позитивная регуляция пролиферации клеток в костном мозге • регресс анатомической структуры • слияние хорио-аллантоиса • негативная регуляция апоптотического процесса в костном мозге клетки • пролиферация В-клеток • позитивная регуляция экспрессии генов • развитие сосудистой сети • дифференцировка радиальных глиальных клеток переднего мозга • миграция клеток нервного гребня • позитивная регуляция пролиферации клеточной популяции • дифференцировка нейронов переднего мозга • ацетилирование гистона H4 • развитие гиппокампа • позитивная регуляция транскрипции с помощью РНК полимеразы II • Wnt - сигнальный путь, кальций модулирующего путь • стероидный гормон, опосредованное сигнальный путь • одонтобласт дифференциация • беты-катенин-TCF комплекс сборка • эпителиальный к мезенхимальному переходу • регуляция межклеточной адгезии • развитие вторичного неба Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51176	16842
Ансамбль	ENSG00000138795	ENSMUSG00000027985
UniProt	Q9UJU2 Q659G9	P27782
RefSeq (мРНК)	NM_001130713 NM_001130714 NM_001166119 NM_016269	NM_001276402 NM_001276403 NM_010703 NM_001379059 NM_001379060 NM_001379061 NM_001379062
RefSeq (белок)	NP_001124185 NP_001124186 NP_001159591 NP_057353 NP_057353.1	NP_001263331 NP_001263332 NP_034833 NP_001365988 NP_001365989 NP_001365990 NP_001365991
Расположение (UCSC)	Chr 4: 108.05 - 108.17 Мб	Chr 3: 131.11 - 131.22 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Лимфоидная энхансер-связывающий фактор 1 ( LEF1) представляет собой белок, который у человека кодируется Lef1 гена.

• 1 Функция
• 2 Клиническое значение
• 3 взаимодействия
• 4 ссылки
• 5 Дальнейшее чтение
• 6 Внешние ссылки

Лимфоидный энхансер-связывающий фактор-1 (LEF1) представляет собой ядерный белок 48 кДа, который экспрессируется в пре- В- и Т-клетках. Он связывается с функционально важным сайтом энхансера Т-клеточного рецептора-альфа ( TCRA ) и обеспечивает максимальную активность энхансера. LEF1 принадлежит к семейству регуляторных белков, которые имеют гомологию с белком-1 группы высокой подвижности ( HMG1 ).

LEF1 сильно сверхэкспрессируется и связан с прогрессированием заболевания и плохим прогнозом при В-клеточном хроническом лимфоцитарном лейкозе и других видах злокачественных новообразований, таких как колоректальный рак. Это также многообещающая потенциальная мишень для лекарств.

Фактор 1, связывающий лимфоидный энхансер, взаимодействует с:

• ALX4,
• AML-1,
• CTNNB1,
• EP300,
• MITF
• PIAS4,
• SMAD2 и
• SMAD3.

• Уотерман М.Л. (2004). «Экспрессия фактора лимфоидного энхансера / Т-клеточного фактора при колоректальном раке». Рак Метастазы Rev. 23 (1–2): 41–52. DOI : 10,1023 / A: 1025858928620. PMID   15000148. S2CID   20996511.
• Скокова Дж., Велте К. (2007). «LEF-1 является решающим фактором транскрипции в гранулопоэзе нейтрофилов». Анна. NY Acad. Sci. 1106: 143–51. DOI : 10.1196 / анналы.1392.012. PMID   17360796. S2CID   30579011.
• Трэвис А., Амстердам А., Белэнджер С., Гроссчедл Р. (1991). «LEF-1, ген, кодирующий лимфоид-специфический белок с доменом HMG, регулирует функцию усилителя альфа рецептора Т-клеток [исправлено]». Genes Dev. 5 (5): 880–94. DOI : 10,1101 / gad.5.5.880. PMID   1827423.
• ван де Ветеринг М., Остервегель М., Дойес Д., Клеверс Н. (1991). «Идентификация и клонирование TCF-1, фактора транскрипции, специфичного для Т-лимфоцитов, содержащего специфичный для последовательности HMG-бокс». EMBO J. 10 (1): 123–32. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07928.x. PMC   452620. PMID   1989880.
• Уотерман М.Л., Фишер WH, Джонс К.А. (1991). «Специфичный для тимуса член семейства белков HMG регулирует энхансер С-альфа рецептора Т-клеток человека». Genes Dev. 5 (4): 656–69. DOI : 10,1101 / gad.5.4.656. PMID   2010090.
• Чжоу П., Бирн С., Джейкобс Дж., Фукс Э. (1995). «Фактор лимфоидного энхансера 1 управляет формированием рисунка волосяного фолликула и судьбой эпителиальных клеток». Genes Dev. 9 (6): 700–13. DOI : 10,1101 / gad.9.6.700. PMID   7537238.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин. 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8. PMID   8125298.
• Prieve MG, Guttridge KL, Munguia JE, Waterman ML (1996). «Сигнал ядерной локализации фактора-1 лимфоидного усилителя распознается двумя дифференциально экспрессируемыми белками рецептора последовательности ядерной локализации Srp1». J. Biol. Chem. 271 (13): 7654–8. DOI : 10.1074 / jbc.271.13.7654. PMID   8631802.
• Беренс Дж., Фон Крис Дж. П., Кюль М. и др. (1996). «Функциональное взаимодействие бета-катенина с фактором транскрипции LEF-1». Природа. 382 (6592): 638–42. DOI : 10.1038 / 382638a0. PMID   8757136. S2CID   4369341.
• Багга Р., Эмерсон Б.М. (1997). «Репрессорный комплекс, содержащий HMG I / Y, и топология суперспиральной ДНК имеют решающее значение для транскрипции, зависимой от энхансера на большие расстояния, in vitro». Genes Dev. 11 (5): 629–39. DOI : 10,1101 / gad.11.5.629. PMID   9119227.
• Брюн Л., Маннерлин А., Гросседл Р. (1997). «ALY, зависимый от контекста коактиватор LEF-1 и AML-1, необходим для функции энхансера TCRalpha». Genes Dev. 11 (5): 640–53. DOI : 10,1101 / gad.11.5.640. PMID   9119228.
• Браннон М., Гомпертс М., Сумой Л. и др. (1997). «Комплекс бета-катенин / XTcf-3 связывается с промотором siamois, чтобы регулировать спецификацию дорсальной оси у Xenopus». Genes Dev. 11 (18): 2359–70. DOI : 10,1101 / gad.11.18.2359. PMC   316518. PMID   9308964.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин. 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID   9373149.
• Коринек В., Баркер Н., Виллерт К. и др. (1998). «Два члена семейства Tcf участвуют в передаче сигналов Wnt / бета-катенин во время эмбриогенеза у мышей». Мол. Клетка. Биол. 18 (3): 1248–56. DOI : 10,1128 / MCB.18.3.1248. PMC   108837. PMID   9488439.
• Prieve MG, Guttridge KL, Munguia J, Waterman ML (1998). «Дифференциальное распознавание импортина-альфа и ядерный транспорт с помощью сигналов ядерной локализации в доменах связывания ДНК с высокой подвижностью группы лимфоидного фактора энхансера 1 и Т-клеточного фактора 1». Мол. Клетка. Биол. 18 (8): 4819–32. DOI : 10,1128 / MCB.18.8.4819. PMC   109067. PMID   9671491.
• Леванон Д., Гольдштейн Р. Э., Бернштейн Ю. и др. (1998). «Репрессия транскрипции с помощью AML1 и LEF-1 опосредуется корепрессорами TLE / Groucho». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 95 (20): 11590–5. DOI : 10.1073 / pnas.95.20.11590. PMC   21685. PMID   9751710.
• Хованес К., Ли Т.В., Уотерман М.Л. (2000). «Ген LEF-1 человека содержит промотор, предпочтительно активный в лимфоцитах, и кодирует множество изоформ, полученных в результате альтернативного сплайсинга». Nucleic Acids Res. 28 (9): 1994–2003. DOI : 10.1093 / NAR / 28.9.1994. PMC   103301. PMID   10756202.
• Лаббе Э, Летамендия А, Аттисано Л. (2000). «Ассоциация Smads с лимфоидным энхансером, связывающим фактор 1 / Т-клеточно-специфический фактор, опосредует кооперативную передачу сигналов трансформирующим фактором роста бета и путями wnt». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 97 (15): 8358–63. DOI : 10.1073 / pnas.150152697. PMC   26952. PMID   10890911.
• Brantjes H, Roose J, van De Wetering M, Clevers H (2001). «Все факторы транскрипции Tcf HMG box взаимодействуют с корепрессорами, связанными с Groucho». Nucleic Acids Res. 29 (7): 1410–9. DOI : 10.1093 / NAR / 29.7.1410. PMC   31284. PMID   11266540.

• LEF1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.