Бета-рецептор X печени

NR1H2
Доступные структуры PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1P8D, 1PQ6, 1PQ9, 1PQC, 1UPV, 1UPW, 3KFC, 3L0E, 4DK7, 4DK8, 4RAK, 5HJP, 4NQA, 5I4V, %% s 4NQA
Идентификаторы
Псевдонимы	NR1H2, L XR-b, LXRB, NER, NER-I, RIP15, UNR, бета-рецептор X печени, ядерный рецептор подсемейства 1, член группы H 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 600380 MGI: 1352463 HomoloGene: 21397 GeneCards: NR1H2
Местоположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек) Полоса 19q13.33 Начало 50,329,653 bp Конец 50,383,388 bp
Расположение гена (мышь) Chr. хромосома 7 (мышь) полоса 7 | 7 B3 начало 44 549 616 bp конец 44,553,951 bp
Экспрессия РНК паттерн Дополнительные справочные данные по экспрессии
Онтология генов Молекулярная функция •Связывание ДНК. •связывание ДНК, специфичное для последовательности. •GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции. •Связывание с АТФазой. •Связывание с ионами цинка. •GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфическая для РНК-полимеразы II. •связывание ионов металла. •ретиноид X rec Связывание эптора. •GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II Связывание ДНК, специфичное для последовательности. •Активность рецептора стероидного гормона. •Связывание рецептора аполипопротеина AI. •GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 ядерный рецептор активность. •GO: 0001948 связывание с белками. •GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ДНК-связывающий фактор транскрипции, активность, специфическая для РНК-полимеразы II. •регуляторная область транскрипции, специфичная для последовательности связывание ДНК. •РНК Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области полимеразы II. •связывание фактора транскрипции. •лиганд-зависимый ядерный рецептор, активность коактиватора транскрипции. •активность сигнального рецептора. Клеточный компонент •цитоплазма. •нуклеоплазма. •ядро ​​клетки. •Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II. Биологический процесс •позитивная регуляция сборки липопротеиновых частиц высокой плотности. •негативная регуляция протеолиза. •позитивная регуляция процесса биосинтеза триглицеридов. •позитивная регуляция cel метаболический процесс белкового белка. •отрицательная регуляция опосредованного интерфероном-гамма сигнального пути. •положительная регуляция транспорта холестерина. •регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •клеточный липидный метаболический процесс. •регуляция транскрипции с РНК промотор полимеразы II. •позитивная регуляция секреции лизосомальных ферментов. •позитивная регуляция накопления липидов. •позитивная регуляция активности липопротеинлипазы. •негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •позитивная регуляция жирных кислот биосинтетический процесс. •негативная регуляция экспрессии генов. •транскрипция, ДНК-шаблон. •позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •негативная регуляция накопления холестерина. •негативная регуляция пиноцитоза. •позитивная регуляция экспрессия гена. •сигнальный путь рецептора ретиноевой кислоты. •позитивная регуляция оттока холестерина. •позитивная регуляция секреции панкреатического сока. •липи d гомеостаз. •негативная регуляция транспорта липидов. •инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •негативная регуляция дифференцировки пенистых клеток, происходящих из макрофагов. •позитивная регуляция транскрипции из Промотор РНК-полимеразы II. •опосредованный стероидным гормоном сигнальный путь. •гомеостаз холестерина. •метаболизм липидов. •развитие многоклеточного организма. •дифференцировка клеток. •клеточный ответ на липополисахарид. •отрицательная регуляция термогенеза, вызванного холодом. •путь передачи сигнала внутриклеточного рецептора. Источники: Amigo / QuickGO
Orthologs
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7376	22260
Ensembl	ENSG00000131408	ENSMUSG00000060601
UniProt	P55055	Q60644
RefSeq (мРНК)	NM_007121. NM_2381200664>NM_23817003664 368>NM_001285519. NM_009473
RefSeq (белок)	NP_001243576. NP_009052. NP _009052.3	NP_001272446. NP_001272447. NP_001272448. NP_033499
Местоположение (UCSC)	Chr 19: 50,33 - 50,38 Мб	Chr 7: 44,55 - 44,55 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

бета-рецептор X печени (LXR-β ) является членом семейство ядерных рецепторов из факторов транскрипции. LXR-β кодируется геном NR1H2 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа H, член 2).

• 1 Функция
• 2 Структура
• 3 Взаимодействия
• 4 Ссылки
• 5 Дополнительная литература

Х-рецепторы печени (LXR) первоначально были идентифицированы как сиротские члены надсемейства ядерных рецепторов, поскольку их лиганды неизвестны. Подобно другим рецепторам в семействе, LXR гетеродимеризуются с рецептором ретиноида X и связываются со специфическими элементами ответа (LXRE), характеризующимися прямыми повторами, разделенными 4 нуклеотидами. Известно, что два гена, альфа (LXRA ) и бета, кодируют белки LXR.

Кристаллическая структура β-рецептора Х печени человека (LXRβ), образующая гетеродимер с его партнерский ретиноидный рецептор X α (RXRα) на его родственном элементе, прямой повтор AGGTCA, расположенный на расстоянии 4 нуклеотидов, демонстрирует расширенное X-образное расположение с перекрещенными доменами связывания ДНК и лиганда. Ядро LXRβ связывает ДНК через канонические контакты и вспомогательные контакты ДНК, которые усиливают сродство к отвечающему элементу.

Бета-рецептор X печени взаимодействует с NCOA6 и рецептор ретиноида X альфа.

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.