Войти
| Домен DM | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Drosophila melanogaster doublesex (dsx), nmr, 18 структур | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | DM | ||||||||
| Pfam | PF00751 | ||||||||
| InterPro | IPR001275 | ||||||||
| SMART | SM00718 | ||||||||
| SCOPe | 1rvv / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии домен DM представляет собой белок домен, впервые обнаруженный в белках doublesex из Drosophila melanogaster, а также обнаруживается в C. elegans и белках млекопитающих. У D. melanogaster ген doublesex контролирует соматическую половую дифференцировку путем производства альтернативно сплайсированных мРНК, кодирующих родственные полоспецифичные полипептиды. Считается, что эти белки действуют как факторы транскрипции в нижестоящих генах, определяющих пол, особенно в отношении дифференцировки нейробластов и белка желтка гены транскрипция.
Домен DM связывает ДНК в виде димера, что позволяет распознавать псевдопалиндромные последовательности. ЯМР-анализ домена DSX DM выявил новый модуль цинк, содержащий «переплетенные» сайты связывания цинка CCHC и HCCC. Для распознавания ДНК требуется карбоксиконцевой основной хвост, который контактирует с малой бороздкой целевой последовательности.
Обнаружены белки с доменом DM во многих модельных организмах. Многие С. elegans Mab белки содержат этот домен, наиболее известным из которых является mab-3. Белки человека, содержащие этот домен, включают DMRT1, и; у каждого из них есть гомолог мыши.
| Dmrt1-specific | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifiers | |||||||||
| Symbol | Dmrt1 | ||||||||
| Pfam | PF12374 | ||||||||
| InterPro | IPR022114 | ||||||||
| |||||||||
Гомологи DMRT1 имеют дополнительный C-конец общего домена по отношению к домену DM. Этот домен встречается только у костных позвоночных, и ни его структура, ни функция неизвестны. Jpred предсказывает, что человеческая версия секции будет в основном катушками; он также предполагает слабое сходство с PDB : 6BO4 по BLAST.
| мотиву DMRTA | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | DMA | ||||||||
| Pfam | PF03474 | ||||||||
| InterPro | IPR005173 | ||||||||
| |||||||||
Белки DMRTA имеют дополнительный мотив на их С-конце. Этот мотив, распространенный у эукариот, имеет неизвестную функцию. Он аналогичен по последовательности некоторым мотивам, связанным с убиквитином.
