Бета-спираль

редактировать
Мономерный, левосторонний β- helix антифриз белка еловой почковой червя Choristoneura fumiferana (PDB : 1M8N ). Димерный правосторонний антифриз β-спиральный белок жука Tenebrio molitor (PDB : 1EZG ). Прямая ассоциация β-спиралей.

A бета-спираль представляет собой структуру тандемного повтора белка, образованную объединением параллельных бета-цепей в спиральном узоре с либо два, либо три лица. Бета-спираль представляет собой тип соленоидного белкового домена. Структура стабилизирована межцепочечными водородными связями, белок-белковыми взаимодействиями и иногда связанными ионами металлов . Идентифицированы как левая, так и правая бета-спирали. Двухцепочечные бета-спирали также являются очень распространенными характеристиками белков и обычно являются синонимами складок желеобразного валика.

. Первая бета-спираль наблюдалась в ферменте пектатлиазе, который содержит семи- спираль поворота достигает 34 Å (3,4 нм ) в длину. Хвостовой белок фага P22, компонент бактериофага P22 , имеет 13 витков, а длина собранного гомо тример составляет 200 Å (20 нм).. Его внутренняя часть плотно упакована без центральной поры и содержит как гидрофобные остатки, так и заряженные остатки, нейтрализованные солевыми мостиками.

И пектатлиаза, и белок хвостовой спинки P22 содержат правые спирали; левосторонние версии наблюдались в ферментах, таких как архейная карбоангидраза. Другие белки, которые содержат бета-спирали, включают белки антифриза жука Tenebrio molitor (правосторонний) и елового почкопряда Choristoneura fumiferana (левосторонний), где регулярно расположенные треонины на β-спиралях связываются с поверхностью кристаллов льда и ингибируют их рост.

Бета-спирали могут эффективно связываться друг с другом, либо лицом к лицу (сопрягая грани своих треугольных призм), либо встык (образуя водородные связи). Следовательно, β-спирали можно использовать в качестве «меток» для побуждения других белков к ассоциации, подобно сегментам спиральной спирали.

Было показано, что члены семейства пентапептидных повторов обладают четырехугольной бета-спиральной структурой.

Ссылки
  • Branden C, Tooze J. (1999). Введение в структуру белка 2-е изд. Издательство Гарленд: Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. pp 84–6.
  • Дикер И.Б. и Ситхарам С. (1992) «Что известно о структуре и функциях белка FirA Escherichia coli?» Мол. Microbiol., 6, 817-823.
  • Raetz CRH и Roderick SL. (1995) «Левосторонняя параллельная β-спираль в структуре UDP-N-ацетилглюкозаминацилтрансферазы», ​​Science, 270, 997-1000. (Левша)
  • Штейнбахер С., Секлер Р., Миллер С., Штайпе Б., Хубер Р. и Рейнемер П. (1994) «Кристаллическая структура белка хвостовой шипа Р22: встречно-гребенчатые субъединицы в термостабильном тримере», Science, 265, 383-386. (Правша)
  • Ваара М. (1992) «Восемь бактериальных белков, включая UDP-N-ацетилглюкозаминацилтрансферазу (LpxA) и три другие трансферазы Escherichia coli, состоят из темы периодичности с шестью остатками», FEMS Microbiol. Lett, 97, 249-254.
  • Yoder MD, Keen NT и Jurnak F. (1993) «Новый мотив домена: структура пектатлиазы C, секретируемый фактор вирулентности растений », Science, 260, 1503-1507. (Правые)
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-12 14:19:56
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте