ARID1B

редактировать

ARID1B

Доступные структуры

Поиск по ортологу: PDBe RCSB

Список кодов идентификаторов PDB
2CXY, 2EH9

Идентификаторы

Псевдонимы

ARID1B, 6A3-5, BAF250B, BRIGHT, DAN15, ELD / OSA1, MRD12, OSA2, P250R, CSS1, AT-rich интерактивный домен 1B

Внешние идентификаторы

OMIM: 614556 MGI: 1926129 HomoloGene: 32344 GeneCard: ARID1B

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 6 (человек)

Полоса	6q25.3	Начало	156,776,020 bp
Полоса	6q25.3	Конец	157,210,779 bp

Расположение гена (мышь)

Chr.	Хромосома 17 (мышь)

Полоса	17 \| 17 A1	Начало	4,994,332 bp
Полоса	17 \| 17 A1	конец	5,347,656 bp

генная онтология
молекулярная функция	•связывание ДНК •GO: 0001105 коактиватор транскрипции активность •GO: 0001948 связывание с белками •GO : 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая
Клеточный компонент	•комплекс nBAF •ядро клетки •нуклеоплазма •цитозоль •клеточная мембрана •цитоплазма •SWI / SNF комплекс суперсемейного типа •SWI / SNF комплекс •комплекс brahma
биологический процесс	•ремоделирование хроматина •регуляция транскрипции, ДНК-шаблон •хроматин -опосредованное поддержание транскрипции •транс критика, ДНК-шаблон •развитие нервной системы •нейрон-нейронная синаптическая передача •развитие дендритного шипа •дендритная сборка дендритных клеток •ответ на ишемию •клеточный ответ на ангиотензин •организация хроматина •регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO

Orthologs

Species

Human

Mouse

Entrez


57492


239985

Ensembl


ENSG00000049618


ENSMUSG00000069729

UniProt


Q8NFD5


E9Q4N7

RefSeq (mRNA)


NM_37613700_NM_3762500_195 275>NM_001374820 NM_001374828


NM_001085355

RefSeq (белок)

NP_059989
NP_001350654
NP_001358585
NP_001361749
NP_001361700C
NP_001361700C
NP_001361700C 283>Chr 6: 156,78 - 157,21 Мб

Chr 17: 4,99 - 5,35 Мб

PubMed поиск

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

AT- белок 1B, содержащий богатый интерактивный домен, представляет собой белок, который в человека кодируется геном ARID1B . ARID1B является компонентом комплекса ремоделирования хроматина человека SWI / SNF.

Содержание

1 Клиническая значимость
2 Взаимодействия
3 Ссылки
4 Дополнительная литература
5 Внешние ссылки

Клиническая значимость

Мутации зародышевой линии в ARID1B связаны с Синдром Коффина-Сириса. Соматические мутации в ARID1B связаны с несколькими подтипами рака, что позволяет предположить, что это ген-супрессор опухоли.

Взаимодействия

Было показано, что ARID1B взаимодействует с SMARCA4 и SMARCA2.

Ссылки

Дополнительная литература

Внешние ссылки

ARID1B + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Медицинские предметные заголовки (MeSH)
Местоположение генома человека ARID1B и страница сведений о гене ARID1B в Браузере генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, которая находится в общественном достоянии.

Последняя правка сделана 2021-06-09 02:01:45

Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).

Обратная связь: support@alphapedia.ru

Соглашение

О проекте