UPF3B

UPF3B
Доступные структуры PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список кодов идентификаторов PDB 1UW4, 2XB2
Идентификаторы
Псевдонимы	UPF3B, HMRX62, MRXS14, RENT3B, UPF3X, Upf3p-X, UPF3BP1, UPF3BP2, UPF3BP3, UPF3 регулятор гомолога B бессмысленных транскриптов (дрожжи), UPF3 регулятор гомолога B бессмысленных транскриптов, регулятор нонсенс-опосредованного распада мРНК, UPF3B регулятор нонсенс-опосредованного распада внешней мРНК			OMIM : 300298 MGI: 1915384 HomoloGene : 11307 Генные карты: UPF3B
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек) Полоса Xq24 Начало 119,805,311 bp Конец 119,852,998 bp
Расположение гена (мышь) Chr. Х-хромосома (мышь) Полоса X | X A3.3 Начало 37 091 678 bp Конец 37,110,322 bp
Экспрессия РНК паттерн Дополнительные справочные данные по экспрессии
Генная онтология Молекулярная функция •GO: 0001948 связывание с белками. •связывание мРНК. •GO: 0005487 структурный компонент ядерной поры. •связывание нуклеиновой кислоты. •связывание РНК. клеточный компонент •комплекс экзон-экзонный переход. •нуклеоплазма. •центр организации микротрубочек. •ядрышко. •ядро ​​клетки. •цитоплазма. •цитозоль. Биологический процесс •сплайсинг мРНК посредством сплайсосомы. •терминация транскрипции РНК-полимеразы II. •транспорт мРНК. •экспорт мРНК из ядра. •позитивная регуляция трансляции. •ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, нонсенс-опосредованный распад. •процессинг 3'-конца мРНК. •экспорт РНК из ядра. •транспорт. Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Энтрез	65109	68134
Энсембл	ENSG00000125351	ENSMUSG00000036572
UniProt	Q9BZI7 н / д
RefSeq (мРНК)	NM_023010. NM_080632	NM_026573
RefSeq (белок)	NP_075386. NP_542199	нет данных
Местоположение (UCSC)	Chr X: 119,81 - 119,85 Mb	Chr X : 37.09 - 37.11 Mb
PubMed поиск
Wikidata
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Регулятор бессмысленных транскриптов 3B - это белок который у человека кодируется геном UPF3B .

. Этот ген кодирует белок, который является частью пост-сплайсингового мультибелкового комплекса, участвующего как в ядерном экспорте мРНК, так и в наблюдении за мРНК. Кодируемый белок является одним из двух функциональных гомологов дрожжевого Upf3p. Наблюдение за мРНК обнаруживает экспортированные мРНК с усеченными открытыми рамками считывания и инициирует нонсенс-опосредованный распад мРНК (NMD). Когда трансляция заканчивается выше последнего соединения экзон-экзон, это запускает NMD для разрушения мРНК, содержащей преждевременные стоп-кодоны. Этот белок связывается с мРНК и остается связанным после ядерного экспорта, действуя как ядерно-цитоплазматический челночный белок. Он образует с Y14 комплекс, который специфически связывается на 20 нуклеотидов выше экзон-экзонных соединений. Этот ген расположен на длинном плече хромосомы X. Для этого гена были обнаружены два варианта сплайсинга, кодирующие разные изоформы.

Было показано, что UPF3B взаимодействует с UPF2 и UPF1.