Разработчик пространственно-временных эпидемиологических моделей

редактировать
STEM
STEM LOGO.jpg
Разработчик (и) IBM, BfR, Eclipse Foundation
Первоначальный выпуск2006
Стабильный выпуск V4.0.0 / Ошибка: отсутствует первый параметр. ()
Репозиторий Редактировать в Викиданных
Написано наПрограммное обеспечение Java
Операционная система Любая (Программное обеспечение Java )
Доступно наанглийском языке (с поддержкой национального языка Java)
Тип Программное обеспечение для научных исследований
Лицензия EPL
Веб-сайтwww.eclipse.org / stem /

Программа Пространственно-временное эпидемиологическое моделирование (STEM ) - это бесплатное программное обеспечение, доступное через Eclipse Foundation. Первоначально разработанное IBM Research, STEM представляет собой платформу и инструмент разработки, призванный помочь ученым создавать и использовать пространственные и временные модели инфекционного заболевания. STEM использует компонентную архитектуру программного обеспечения, основанную на стандарте OSGi. Платформа Eclipse Equinox является эталонной реализацией этого стандарта. Используя компонентную архитектуру программного обеспечения, все компоненты или элементы, необходимые для модели заболевания, включая код и d данные доступны в виде стандартных блоков программного обеспечения, которыми можно независимо обмениваться, расширять, повторно использовать или заменять. Эти строительные блоки или надстройки называются eclipse «надстройками» или «расширениями». Плагины STEM содержат данные знаменателя для интересующих административных регионов. Регионы индексируются стандартными кодами (ISO3166 ).

STEM в настоящее время включает большое количество подключаемых модулей для 244 стран и зависимых областей, определенных в стандарте географического кодирования, поддерживаемом Международной организацией по стандартизации. Эти подключаемые модули содержат глобальные данные, включая географические данные, данные о населении, демографические данные и базовые модели болезни. Модели заболевания, распространяемые с помощью STEM, включают эпидемиологические компартментные модели. Другие плагины описывают отношения между регионами, включая отношения ближайшего соседа или смежности, а также информацию о транспорте, например, соединения по дорогам и модель воздушный транспорт.

Взаимоотношения между регионами затем могут быть включены в модели того, как болезнь распространяется с места на место. Для этого STEM представляет мир в виде «графика». Узлы в графе соответствуют местам или регионам, а ребра в графе описывают отношения или связи между регионами. Как узлы, так и края могут быть помечены или «украшены» различными данными и моделями знаменателя. Это графическое представление реализовано с использованием Eclipse Modeling Framework (EMF). Поскольку модель может быть построена с использованием отдельных подграфов, STEM позволяет составить модель композицию. Предопределенные подграфы, определяющие разные страны, могут быть собраны с помощью интерфейса перетаскивания. Новые векторы болезней можно просто добавить к существующим моделям, дополнив модель новым набором ребер. Архитектура также поддерживает сотрудничество, поскольку пользователи могут не только создавать новые модели и составлять новые сценарии, но также обмениваться этими моделями и сценариями как повторно используемыми компонентами и, таким образом, опираться на работу друг друга. В качестве проекта с открытым исходным кодом пользователям рекомендуется создавать свои собственные плагины (как данные, так и модели) и, при необходимости, вносить свою работу обратно в проект.

Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-09 01:52:17
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте