Войти
| Белок SecY / Sec61α | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура белок-проводящего канала. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Symbol | SecY | ||||||||
| Pfam | PF00344 | ||||||||
| InterPro | IPR002208 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00612 | ||||||||
| SCOPe | 1rh5 / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.A.5 | ||||||||
| суперсемейство OPM | 19 | ||||||||
| O Белок PM | 1rh5 | ||||||||
| Мембранома | 165 | ||||||||
| |||||||||
Белок SecY является основной трансмембранной субъединицей бактериального Sec или типа II секреторного пути и белок-секретирующий комплекс АТФазы, также известный как SecYEG транслокон. Гомологи комплекса SecYEG обнаружены у эукариот, где субъединица известна как Sec61α, и у архей.
Секреция некоторых белков, несущих сигнальный пептид через внутренняя мембрана в грамотрицательных бактериях происходит через путь препротеинтранслоказы. Белки продуцируются в цитоплазме в качестве предшественников и требуют наличия шаперонной субъединицы, чтобы направлять их к компоненту транслоказы внутри мембраны. Оттуда зрелые белки либо направляются на внешнюю мембрану, либо остаются в виде периплазматических белков. Белковые субъединицы транслоказы кодируются на бактериальной хромосоме.
Путь транслоказы включает 7 белков, включая шаперонный белок (), АТФазу (SecA ), интегральный мембранный комплекс (SecY, SecE и SecG), и два дополнительных мембранных белка, которые способствуют высвобождению зрелого пептида в периплазму (SecD и SecF). Белок-шаперон SecB представляет собой высококислотный гомотетрамерный белок, который существует в виде «димера димеров» в бактериальной цитоплазме. SecB поддерживает препротеины в развернутом состоянии после трансляции и направляет их на периферический мембранный белок АТФазу SecA для секреции. Структура сборки SecYEG Escherichia coli выявила сэндвич из двух мембран, взаимодействующих через обширные цитоплазматические домены. Каждая мембрана состоит из димеров SecYEG. Мономерный комплекс содержит 15 трансмембранных спиралей.
Белок SecY эубактерий взаимодействует с сигнальными последовательностями секреторных белков, а также с двумя другими компонентами системы транслокации белка: SecA и SecE. SecY представляет собой интегральный белок плазматической мембраны, содержащий от 419 до 492 аминокислотных остатков, который, по-видимому, содержит 10 трансмембранных (TM), 6 цитоплазматических и 5 периплазматических областей.
Цитоплазматические области 2 и 3 и TM-домены 1, 2, 4, 5, 7 и 10 хорошо консервативны: консервативные цитоплазматические области, как полагают, взаимодействуют с цитоплазматическими факторами секреции, в то время как ТМ домены могут участвовать в экспорте белка. SecY также кодируется в геноме хлоропластов некоторых водорослей, где он может участвовать в системе экспорта белка, подобной прокариотам, через две мембраны эндоплазматического ретикулума хлоропластов (CER), который присутствует у хромофитных и криптофитных водорослей.
SEC61A1 ; ;
