Протон-зависимый переносчик олигопептидов

Белки семейства протон-зависимых переносчиков олигопептидов (POT) (также называемого семейством PTR (перенос пептидов) ) обнаружены у животных, растений, дрожжей, архей, а также грамотрицательных и грамположительных бактерий, и являются частью главного посредника надсемейство. Транспортировка пептидов в клетки - это хорошо задокументированный биологический феномен, который осуществляется специфическими энергозависимыми переносчиками, обнаруженными у ряда организмов, столь же разнообразных, как бактерии и люди. Семейство белков протон-зависимых переносчиков олигопептидов (PTR) отличается от белков-переносчиков пептидов типа ABC и было обнаружено анализом последовательности ряда недавно открытых белков-переносчиков пептидов. Эти белки, по-видимому, в основном участвуют в поглощении малых пептидов с сопутствующим захватом протона.

• 1 Функция
• 2 Транспортная реакция
• 3 Структура и механизм
• 4 Подсемейства
• 5 Человеческих белков, содержащих этот домен
• 6 Ссылки

В то время как большинство членов семейства POT катализируют транспорт пептида, одним из них является нитрат пермеаза, и можно транспортировать гистидин, а также пептиды. Некоторые из переносчиков пептидов могут также транспортировать антибиотики. Они функционируют с помощью протона symport, но стехиометрия субстрат: H варьируется: высокоаффинный носитель PepT2 крысы катализирует поглощение 2 и 3 H нейтральными и анионными дипептидами, соответственно, в то время как носитель PepT1 с низким сродством катализирует поглощение одного H на нейтральный пептид.

Общая транспортная реакция, катализируемая белками семейства POT:

субстрат (выход) + H (выход) → субстрат (in) H (in)

Белки имеют длину около 450-600 аминоацильных остатков, при этом эукариотические белки в целом длиннее, чем бактериальные белки. Они демонстрируют 12 предполагаемых или установленных трансмембранных α-спиральных гаечных ключей.

Пары солевых мостиков взаимодействий между трансмембранными спиралями работают в тандеме, чтобы организовать транспорт с альтернативным доступом в семействе PTR. Ключевые роли остатков, консервативных между бактериальными и эукариотическими гомологами, предполагают консервативный механизм распознавания и транспорта пептидов, который в некоторых случаях был слегка модифицирован у отдельных видов.

• InterPro : IPR004768
• InterPro : IPR005279

; ; ; SLC15A1 ; SLC15A2 ; ; SLC15A4 ; ;

На данный момент в этой статье используется контент из «2.A.17 Семейство протон-зависимых переносчиков олигопептидов (POT / PTR)», на которое распространяется лицензия таким образом, чтобы разрешить повторное использование в соответствии с непортированной лицензией Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0, но не в рамках GFDL. Все соответствующие условия должны быть соблюдены.