ПТРФ

CAVIN1
Идентификаторы
Псевдонимы	CAVIN1, CAVIN, CGL4, cavin-1, FKSG13, PTRF, полимераза I и фактор высвобождения транскрипта, белок 1, связанный с кавеолами
Внешние идентификаторы	OMIM : 603198 MGI : 1277968 HomoloGene : 7499 GeneCards : CAVIN1
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 17 (человек) Группа 17q21.2 Начинать 42 402 449 п.н. Конец 42 423 256 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 11 (мышь) Группа 11 D | 11 63,95 см Начинать 100 956 733 п.н. Конец 100970887 п.н.
Паттерн экспрессии РНК Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • рРНК связывания • рРНК первичный транскрипт связывания • GO: связывание белка 0001948 • связывание РНК • связывание белка идентичны Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • нуклеоплазма • эндоплазматический ретикулум • митохондрия • кавеола • мембранный плот • ядро • плазматическая мембрана • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • белковый комплекс Биологический процесс • прекращение транскрипции РНК-полимеразы I • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • ДНК-шаблонная транскрипция, терминация • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция рРНК • позитивная регуляция подвижности клеток • секреция белка Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	284119	19285
Ансамбль	ENSG00000177469	ENSMUSG00000004044
UniProt	Q6NZI2	O54724
RefSeq (мРНК)	NM_012232	NM_008986 NM_001359105 NM_027160
RefSeq (белок)	NP_036364	NP_033012 NP_001346034
Расположение (UCSC)	Chr 17: 42,4 - 42,42 Мб	Chr 11: 100.96 - 100.97 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Полимераза I и фактор высвобождения транскрипта, также известный как Cavin1, Cavin1 или ПСРФ, является белком, который в организме человека кодируется ПСРФ ген.

• 1 Функция
• 2 взаимодействия
• 3 ссылки
• 4 Дальнейшее чтение

PTRF (Cavin1), как было показано, имеет решающее значение для образования и функционирования кавеолы.

Прекращение транскрипции, катализируемой РНК-полимеразой I, представляет собой двухэтапный процесс, который включает приостановку элонгации транскрипции и высвобождение как прерибосомной РНК, так и Pol I из матрицы ДНК. Пауза опосредуется TTF1 и PTRF.

PTRF представляет собой растворимый белок, содержащий предполагаемую лейциновую молнию, сигнал ядерной локализации и домены PEST.

PTRF (Cavin1) образует тримеры с Cavin2 и Cavin3 при образовании кавеол и, как было показано, взаимодействует с другими ассоциированными с мембранами белками, такими как EHD2 и кавеолины.

Было показано, что PTRF взаимодействует с ZNF148.

• Янса П., Мейсон С.В., Hoffmann-Rohrer U, Grummt I (май 1998 г.). «Клонирование и функциональная характеристика PTRF, нового белка, который вызывает диссоциацию приостановленных комплексов тройной транскрипции». Журнал EMBO. 17 (10): 2855–64. DOI : 10.1093 / emboj / 17.10.2855. PMC   1170626. PMID   9582279.
• Хасэгава Т., Такеучи А., Мияиси О, Сяо Х., Мао Дж., Исобэ К. (апрель 2000 г.). «PTRF (полимераза I и фактор высвобождения транскрипта) является тканеспецифичным и взаимодействует с фактором транскрипции цинковых пальцев BFCOL1 (фактор связывания промотора коллагена типа I), который связывается с двумя промоторами гена коллагена типа I мыши». Биохимический журнал. 347 Pt 1 (Pt 1): 55–9. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3470055. PMC   1220930. PMID   10727401.
• Абулайх Н., Вайнонен Дж. П., Стролфорс П., Венер А. В. (октябрь 2004 г.). «Векторная протеомика выявляет нацеливание, фосфорилирование и специфическую фрагментацию полимеразы I и фактора высвобождения транскрипта (PTRF) на поверхности кавеол в адипоцитах человека». Биохимический журнал. 383 (Pt 2): 237–48. DOI : 10.1042 / BJ20040647. PMC   1134064. PMID   15242332.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природа Биотехнологии. 23 (1): 94–101. DOI : 10.1038 / nbt1046. PMID   15592455. S2CID   7200157.
• Чжан Ю., Вольф-Ядлин А., Росс П.Л., Паппин DJ, Раш Дж., Лауффенбургер Д.А., White FM (сентябрь 2005 г.). «Масс-спектрометрия с временным разрешением сайтов фосфорилирования тирозина в сигнальной сети рецептора эпидермального фактора роста выявляет динамические модули». Молекулярная и клеточная протеомика. 4 (9): 1240–50. DOI : 10.1074 / mcp.M500089-MCP200. PMID   15951569.
• Aboulaich N, Ortegren U, Vener AV, Strålfors P (ноябрь 2006 г.). «Ассоциация и регулируемая инсулином транслокация гормон-чувствительной липазы с PTRF». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 350 (3): 657–61. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2006.09.094. PMID   17026959.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell. 127 (3): 635–48. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID   17081983. S2CID   7827573.

• v
• т
• е