Войти
| Sterkiella histriomuscorum | |
|---|---|
 | |
Научная классификация  | |
| Клэйд: | SAR |
| Infrakingdom: | Альвеолаты |
| Тип: | Цилиофора |
| Класс: | Спиротричея |
| Семья: | Oxytrichidae |
| Род: | Sterkiella |
| Разновидность: | С. histriomuscorum |
| Биномиальное имя | |
| Sterkiella histriomuscorum ( Фойсснер, Блаттерер, Бергер и Кохманн, 1991 г.) Фойсснер, Блаттерер, Бергер и Кохманн, 1991 г. | |
| Синонимы | |
| |
Sterkiella histriomuscorum, ранее Oxytricha trifallax, является реснитчатым видом рода Sterkiella, известным своими сильно фрагментированных геномкоторые были использованыкачестве модели для ресничкообразной генетики.
Как и все инфузории, O. trifallax имеет два разных типа ядер: макронуклеусы, которые являются местом транскрипции и экспрессии генов, и микроядра, которые активны только во время полового размножения, но в остальном транскрипционно неактивны. Макронуклеусы образуются в результате дифференцировки микроядер, которая обычно включает некоторую степень РНК-опосредованного редактирования ДНК. O. trifallax - первый вид, секвенированный с необычно высокой степенью фрагментации в его макроядерном геноме. До 96% микроядерного генома удаляется во время дифференцировки в макронуклеус; для сравнения, у других инфузорий, таких как Paramecium, удаляется только около 30%. Макроядерный геном имеет гаплоидный размер около 50 Мбит / с.
В хромосомах этих макронуклеуса также необычно короткие. Макроядерный геном кодирует около 18 500 генов, но они распределены по 16 000 хромосомам, которые из-за их длины называются нанохромосомами. Из-за их необычно коротких нанохромосом, большинство из которых содержат только один ген, они использовались в качестве модельных организмов для изучения теломер и скрининга некодирующих генов РНК.
Микроядерный геном также был секвенирован и содержит около 3500 зашифрованных генов. Скремблированные гены - это гены, отдельные сегменты которых расположены в разных частях микроядерного генома, и поэтому их необходимо «расшифровать» на этапе редактирования ДНК в обычный ген в макроядерном геноме. Более 225 000 отдельных сегментов ДНК необходимо расшифровать во время развития макроядерного генома из его микроядерного предшественника.
Митохондриальный геном также секвенировали, и является самым крупным известным реснитчатым митохондриальным геномом, с длиной около 70 т.п.н.. Подобно другим митохондриальным геномам инфузорий, O. trifallax представляют собой линейные молекулы и содержат ряд расщепленных генов. Их митохондрии также обладают отдельной плазмидой, которая, возможно, участвовала в горизонтальном переносе генов во время эволюции митохондриального генома.
Таксономия O. trifallax оспаривается. Он был реклассифицирован как Sterkiella histriomuscorum на основе морфологических характеристик, но молекулярная филогения поддерживает первоначальную классификацию как разновидность Oxytricha.
