Negativicutes

Negativicutes
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Firmicutes
Класс :	Negativicutes. Marchandin et al. 2010
Отряды и семейства
Selenomonadales Marchandin et al. 2010 исправление. Кэмпбелл и др. 2015 Кэмпбелл и др. 2015 Кэмпбелл и др. 2015 Кэмпбелл и др. 2015 Acidaminococcaceae Marchandin et al. 2010 исправление. Кэмпбелл и др. 2015 Кэмпбелл и др. 2015 Veillonellaceae Rogosa 1969 исправить. Кэмпбелл и др. 2015

Negativicutes - это класс из бактерий в типе Firmicutes, члены которого имеют своеобразная клеточная стенка с внешней мембраной липополисахарида, которая окрашивает грамотрицательные, в отличие от большинства других представителей Firmicutes. Хотя несколько соседних видов Clostridia (бактерии-фирмикуты) также окрашивают грамотрицательные, белки, ответственные за необычную дидермальную структуру Negativicutes, на самом деле могли быть приобретены латерально от Proteobacteria. Требуются дополнительные исследования, чтобы подтвердить происхождение оболочки клеток дидерм у Negativicutes.

Большинство представителей этого класса являются облигатными анаэробами и встречаются в таких средах обитания, как реки, озера и кишечник позвоночных. Они варьируются от сферических форм, таких как Megasphaera и Veillonella, до изогнутых стержней, характерными для селеномонад. Selenomonas имеет характерную серповидную форму со жгутиками, вставленными на вогнутой стороне, в то время как Sporomusa похожа, но неподвижна. Их имена относятся к этой отличительной морфологии: selene означает луна, а musa означает банан.

• 1 Таксономия
• 2 Молекулярные сигнатуры
• 3 Филогения
• 4 Ссылки

Класс в настоящее время состоит из 32 правильно названных родов трех отрядов и четырех семейств. Отряды и каждый содержат одно семейство, Veillonellaceae и Acidaminococcaceae соответственно, тогда как отряд Selenomonadales содержит два семейства: Selenomonadaceae и Sporomusaceae.

Исторически Negativicutes состояли из одного отряда, Selenomonadales, и двух семейств, Veillonellaceae и Acidaminococcaceae, на основе сходства последовательностей гена 16S рРНК. Однако в эти группировки не входили несколько членов Negativicutes, которые разветвлялись за пределами двух семей. Текущее таксономическое представление включает этих членов, которые были правомерно отнесены к семействам Selenomonadaceae и Sporomusaceae в измененном порядке Selenomonadales. Молекулярные маркеры в форме консервативных сигнатурных инделей (CSI) и белков (CSP) оправдывают существующие таксономические подразделения. Эти молекулярные маркеры находятся в каждом таксономическом ранге, и их распределение согласуется с наблюдаемым филогенетическим ветвлением.

Многие работы предполагают, что Negativicutes следует реклассифицировать как отряд внутри класса Clostridia, на основании тесного филогенетического ветвления и наблюдения, что спорообразующие члены Negativicutes имеют общие гены споруляции, что и Clostridia, и что оба окрашивают грамотрицательные. Однако неоднородность членов в пределах Negativicutes, а также распределение молекулярных сигнатур поддерживает точку зрения, что Negativicutes фактически являются независимым классом внутри Firmicutes, а Clostridia - их ближайшими филогенетическими соседями. Кроме того, было обнаружено, что несколько CSI и CSP являются уникально общими для всех Negativicutes, в то время как CSI не являются общими для Negativicutes и Clostridia.

В основе принятой в настоящее время таксономии в Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) и Национального центра биотехнологической информации (NCBI)

• Selenomonadales Marchandin et al. 2010 исправление. Кэмпбелл и др. 2015
  • Кэмпбелл и др. 2015
    • Hungate 1966
    • Lai et al. 1983
    • Megamonas Shah and Collins 1983
    • Shah and Collins 1983
    • Pectinatus Lee et al. 1978 исправление. Ювонен и Суйко 2006
    • Schink et al. 1983
    • van Gylswyk et al. 1997
    • Selenomonas von Prowazek 1913
    • Zymophilus Schleifer et al. 1990
  • Кэмпбелл и др. 2015
    • Acetonema Кейн и Брезнак 1992
    • Anaeroarcus Strömpl et al. 1999
    • Anaeromusa Baena et al. 1999
    • Anaerosinus Strömpl et al. 1999
    • Anaerospora ♠ Woo et al. 2005
    • Dendrosporobacter Strömpl et al. 2000
    • Desulfosporomusa ♠ Sass et al. 2004
    • Pelosinus Shelobolina et al. 2007
    • Propionispora Biebl et al. 2001
    • ♠ Sattley et al. 2008
    • Ogg and Patel 2009
    • Sporomusa Möller et al. 1985
    • Thermosinus Sokolova et al. 2004
• Кэмпбелл и др. 2015
  • Acidaminococcaceae Marchandin et al. 2010 исправление. Кэмпбелл и др. 2015
    • Acidaminococcus Rogosa 1969 исправить. Юмас-Билак и др. 2007
    • Del Dot et al. 1994
    • ван Гилсвик 1995
    • Янссен и О'Фаррелл 1999
• Кэмпбелл и др. 2015
  • Veillonellaceae Rogosa 1969 исправить. Кэмпбелл и др. 2015
    • Allisonella Garner et al. 2003
    • Anaeroglobus Carlier et al. 2002
    • Dialister (бывший Bergey et al. 1923). Мур и Мур 1994 исправляют. Morotomi et al. 2008
    • Megasphaera Rogosa 1971 исправить. Marchandin et al. 2003
    • Negativicoccus Marchandin et al. 2010
    • Veillonella Прево 1933 исправить. Mays et al. 1982
• Несекретный
  • • Quinella ♪ Krumholz et al. 1993

Примечания:. ♠ Штаммы, обнаруженные в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не перечисленные в Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). ♪ Прокариоты, у которых чистые (аксенические ) культуры не изолированы или недоступны, т.е. е. не культивируется или не может поддерживаться в культуре более нескольких серийных пассажей