Войти
| MicX Vibrio cholerae мРНК | |
|---|---|
 Вторичная структура мРНК MicX. | |
| Идентификаторы | |
| Условное обозначение | MicX |
| Рфам | RF01808 |
| Прочие данные | |
| Тип РНК | мРНК |
| Домен (ы) | Холерный вибрион |
| Структуры PDB | PDBe |
MicX sRNA (ранее известная как A10) представляет собой небольшую некодирующую РНК, обнаруженную в Vibrio cholerae. Ему было присвоено название MicX, так как он выполняет функции, аналогичные функциям MicA, MicC и MicF в E. coli. MicX sRNA отрицательно регулирует белок внешней мембраны (кодируемый VC0972 ), а также компонент транспортера ABC (ген VC0620 ). Эти взаимодействия были предсказаны, а затем подтверждены с помощью микрочипа ДНК.
MicX был идентифицирован через экран биоинформатики из В. вибрион, имеющий ранее предсказано. Уровни транскрипции этой мРНК сравнивали в нескольких условиях: было обнаружено, что она экспрессируется на всех тестируемых средах ; более богатые среды немного снижают транскрипцию; Репрессия некоторых сигма-факторов (δ S и δ E) не изменяла транскрипцию, но резко снижалась в отсутствие белка Hfq. Это наблюдение согласуется с другими паттернами экспрессии мРНК.
Ген РНК MicX перекрывается с VCA0943 - геном, кодирующим пермеазу, переносящую мальтозу, - но рибонуклеаза РНКаза E обрабатывает транскрипт MicX для создания активной и стабильной формы, содержащей только 3 'UTR VCA0943.
