Войти
| Idaeovirus | |
|---|---|
| Классификация вирусов | |
| Группа: | Группа IV ((+) ssRNA ) |
| Порядок: | Не назначено |
| Семейство: | Неназначенный |
| Род: | Idaeovirus |
| Типовой вид | |
| Вирус кустистой карликовой малины . | |
Idaeovirus - это род вирусов ssRNA с положительным смыслом, содержащий один вид: вирус кустистой карликовости малины (RBDV). Хотя этот род не принадлежит ни к какому семейству или отряду, он был предложен как член семейства Bromoviridae из-за на сходство с членами этого семейства. RBDV имеет две зависимые от хозяина клады : одну для малины, другую для виноградных лоз. Инфекции являются серьезным бременем для сельского хозяйства, что приводит к снижению урожайности и качества тип урожая. RBDV имеет синергетические отношения с коинфекцией, которая значительно увеличивает концентрацию вирионов в инфицированных растениях. Вирус передается через опыление пыльцевыми зернами, инфицированными RBDV, которые сначала заражают стигму, а затем вызывают системную инфекцию.
Группа: ssRNA (+)
Порядок: Не назначеноRBDV без оболочки с изометрической белковой оболочкой диаметром около 33 нанометров.. Внутри белковой оболочки находится вирусный геном, который состоит из двух частей, с цепями РНК, которые называются РНК-1 и РНК-2. РНК-1 имеет длину 5449 нуклеотидов и содержит одну открытую рамку считывания (ORF), которая кодирует комбинированный белок, содержащий метилтрансферазу, геликазу и домены РНК-зависимой РНК-полимеразы. РНК-2 имеет длину 2231 нуклеотид и содержит две ORF, одну на 5'-конце, а другую на 3'-конце. Первая ORF кодирует белок движения от клетки к клетке, а вторая ORF экспрессируется в виде цепи субгеномной РНК. Эта цепь, РНК-3, имеет длину 946 нуклеотидов и кодирует белок оболочки. Было показано, что заражение не происходит, если РНК-3 либо отсутствует, либо достаточно повреждена.
| Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномная структура | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| IDeovirus | Икосаэдрическая, изометрическая | Без оболочки | Линейная | Двучастная |
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается за счет проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина за счет движения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Маршруты передачи связаны с пыльцой.
| Род | Сведения о хосте | Тропизм ткани | Сведения о входе | Сведения о выпуске | Сайт репликации | Место сборки | Передача |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идеовирус | Растения | Нет | Цитоплазма | Цитоплазма | Связанная с пыльцой |
Одностадийная полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией была разработана для обнаружения RBDV. Вирусы обогащаются антителами в микролунках для ПЦР с последующим лизисом вирусных частиц, а затем обратной транскрипцией вирусной РНК. Путем включения обратной транскриптазы и ДНК-полимеразы во весь процесс, процедура может быть проведена в один этап. Эти тесты достаточно чувствительны, чтобы идентифицировать конкретный штамм вируса.
RBDV можно искоренить на инфицированных растениях с помощью процедуры, в которой сначала применяется термотерапия, а затем криотерапия зараженным побегам. Воздействие тепла на инфицированные растения вызывает увеличение вакуолей в инфицированных клетках, при этом эти клетки позже погибают во время криотерапии. Добавление либо Fe- этилендиаминтетрауксусной кислоты, либо Fe-этилендиаминди (o) гидроксифенилуксусной кислоты после криотерапии стимулирует возобновление роста и предотвращает развитие хлороза в побегах растений. Используя этот метод, около 80% побегов выживают после первоначальной тепловой терапии, а 33% выживают после криотерапии и успешно отрастают.
