Семейство гликозилгидролаз 19

редактировать
Семейство гликозилгидролаз 19
PDB 2baa EBI.jpg усовершенствованная кристаллическая структура эндохитиназы из Hordeum vulgare l. семена с разрешением 1,8 ангстрем
Идентификаторы
СимволGlyco_hydro_19
Pfam PF00182
Pfam кланCL0037
InterPro IPR000726
PROSITE PDOC00620
SCOPe 2baa / SUPFAM
CAZy GH19
CDD cd00325

В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 19 представляет собой семейство из гликозидгидролаз.

гликозидгидролаз EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизуют гликозидную связь между двумя или более углеводами или между углеводным и неуглеводным фрагментом. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению>100 различных семейств. Эта классификация доступна на веб-сайте CAZy, а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов. y [_] 9

Семейство гликозидгидролаз 19 CAZY GH_19 включает ферменты только с одной известной активностью; хитиназа (EC 3.2.1.14 ).

Хитиназы представляют собой ферменты, которые катализируют гидролиз бета-1,4-N-ацетил-D-глюкозаминовых связей в хитиновых полимерах. Хитиназы принадлежат к семействам гликозидгидролаз 18 или 19. Хитиназы семейства 19 (также известные как классы IA или I и IB или II) представляют собой ферменты растений, которые действуют в защите от грибов и насекомых патогенов путем разрушения их хитинсодержащих клеточной стенки. Ферменты классов IA / I и IB / II различаются наличием (IA / I) или отсутствием (IB / II) N-концевого хитин-связывающего домена. Каталитический домен этих ферментов состоит примерно из 220-230 аминокислотных остатков.

Активный сайт
Активный сайт хитиназы папайи 19 семейства гикозидгидролаз (PDB : 3cql ) . Сохраненные остатки показаны вокруг каталитической кислоты Glu67. Связывание единицы GlcNAc2 в субсайтах -1 и +1 показано узкими полосками, а стрелка указывает положение гликозидного кислорода.

Ферменты GH19 имеют консервативный мотив последовательности ([FHY] -GRG- [AP] - ζ-Q- [IL] - [ST] - [FHYW] - [HN] - [FY] - [NY], ζ = гидрофильная аминокислота) в его активном сайте.

Ссылки
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR000726
Последняя правка сделана 2021-05-21 11:25:58
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте