Кринивирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Рибовирия |
Царство: | Orthornavirae |
Тип: | Kitrinoviricota |
Класс: | Alsuviricetes |
Отряд: | Martellivirales |
Семья: | Closteroviridae |
Род: | Кринивирус |
Типовой вид | |
Вирус инфекционной желтизны салата. | |
Вид | |
См. Текст |
3'-концевой псевдоузел в SPCSV | |
---|---|
Прогнозируемая вторичная структура 3'-концевого псевдоузла в SPCSV | |
Идентификаторы | |
Rfam | RF01091 |
Другие данные | |
РНК тип | Цис-рег |
Домен (ы) | Кринивирус |
PDB структуры | PDBe |
Кринивирус, ранее принадлежавший к группе вирусов инфекционной желтизны салата, представляет собой род вирусов семейства Closteroviridae. Они представляют собой линейные одноцепочечные вирусы с положительной смысловой РНК (и поэтому относятся к группе IV ). В настоящее время этот род насчитывает 14 видов, включая типовой вид вирус инфекционной желтизны салата. Заболевания, связанные с этим родом, включают: пожелтение и некроз, особенно поражающие флоэму.
Примеры видов, все геномы которых были секвенированы, которые в настоящее время классифицируются в этот род включают вирус хлоротической остановки роста сладкого картофеля (SPCSV) и вирус инфекционной желтизны салата (LIYV).
Вирусы этого рода имеют сегментированные, двудольные геномы, которые в сумме составляют 7 500–19 500 нуклеотидов в длину. Их геномы также кодируют белки, которые не входят в состав частиц вириона, а также структурные белки. Универсальная база данных вирусов описывает, что их геномные последовательности около их 3'-концов способны образовывать шпильки-петли, а также полагают, что их 5'-концы могут иметь метилированные шапки. Каждая из молекул вирусной РНК содержит четыре шпильки и псевдоузел в 3'UTR. Псевдоузел необычен тем, что он содержит небольшую структуру стержень-цикл внутри цикла L1. Было обнаружено, что у родственного рода Closterovirus эти вторичные структуры важны для репликации вирусной РНК.
Вирусы в Crinivirus не имеют оболочки, с двудольными нитевидными геометрии. Диаметр примерно 10-13 нм, длина 700-900 нм. Геномы бывают линейными и двудольными, длиной около 17,6 килобайт.
Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
---|---|---|---|---|---|
Кринивирус | Нитевидный | Необолочечный | Линейный | Одно-, двух- или трехчастный |
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается за счет проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина за счет движения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Вирус передается через переносчика (bemisia tabaci). Маршрут передачи - механический.
Род | Сведения о хосте | Тропизм ткани | Сведения о входе | Сведения о выпуске | Сайт репликации | Место сборки | Передача |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Кринивирус | Растения | Нет | Вирусное движение; механическая инокуляция | Вирусное движение | Цитоплазма | Цитоплазма | Механическая инокуляция: насекомые (белокрылка) |
Группа: оцРНК (+)
Заказ: MartelliviralesWikispecies содержат информацию, относящуюся к Crinivirus |