АТФ-зависимая протеолитическая субъединица Clp-протеазы

редактировать
CLPP
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы CLPP, PRLTS3, DFNB81, протеолитическая субъединица казеинолитической митохондриальной матричной пептидазы
Внешние идентификаторыOMIM: 601119 MGI: 1858213 HomoloGene: 4385 Генные карты: CLPP
Расположение гена (человек)
Chr. Хромосома 19 (человек)
Полоса 19p13.3Начало6,361,531 bp
Конец6,370,242 bp
Экспрессия РНК паттерн
Дополнительные справочные данные по экспрессии
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

8192

53895

Ensembl

ENSG00000125656

ENSMUSG00000002660

UniProt

Q16740

O88696

RefSeq (мРНК)

NM_006012

NM_017393

RefSeq (белок)

NP_006003

NP_059089

Местоположение (UCSC)Chr 19 : 6,36 - 6,37 Мб нет данных
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование Человека Просмотр / редактирование мыши

АТФ-зависимая протеолитическая субъединица протеазы Clp (ClpP)представляет собой фермент, который у человека кодируется CLPP ген. Этот белок является важным компонентом для образования белкового комплекса протеазы Clp (эндопептидаза Clp ).

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Функция
  • 3 Клиническая значимость
  • 4 См. Также
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
  • 7 Внешние ссылки
Структура

Фермент ClpP представляет собой высококонсервативную сериновую протеазу, присутствующую во всех бактериальных, а также обнаруженную в митохондриях и хлоропластах эукариотических клеток. Мономер ClpP складывается в три субдомена: «ручка», глобулярная «голова» и N-концевой участок. Сам по себе ClpP может собираться в тетрадекамерный комплекс (14 членов) и образовывать закрытую протеолитическую камеру. Полностью собранный комплекс протеазы Clp имеет бочкообразную структуру, в которой два уложенных друг на друга кольца протеолитических субъединиц (ClpP или ClpQ) либо зажаты между двумя кольцами, либо одинарно покрыты одним кольцом субъединиц ATPase-активных шаперонов (ClpA, ClpC, ClpE). , ClpX или ClpY). ClpXP присутствует почти во всех бактериях, в то время как ClpA обнаруживается у грамотрицательных бактерий, ClpC - у грамположительных бактерий и цианобактерий. ClpAP, ClpXP и ClpYQ сосуществуют в E. Coli, в то время как у человека присутствует только комплекс ClpXP.

Функция

У бактерий было показано, что ClpP способен расщеплять полноразмерные белки, не будучи ассоциирован с ClpA, но деградация происходит гораздо медленнее. Полнофункциональная протеаза Clp требует участия. Эти шапероны ClpX распознают, разворачивают и переносят белковые субстраты в протеолитическое ядро, образованное тетрадекамером ClpP. Протеолитические сайты субъединиц ClpP содержат гидрофобные бороздки, которые привлекают субстрат и принимают каталитическую триаду Asp-His-Ser. У некоторых бактерий, таких как E. coli, белки, помеченные пептидом SsrA (ANDENYALAA), кодируемым тмРНК, перевариваются протеазами Clp.

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству пептидаз S14 и гидролизует белки на небольшие пептиды в присутствии АТФ и магния. Белок транспортируется в митохондриальный матрикс и связан с внутренней митохондриальной мембраной.

Клиническая значимость

Протеаза ClpP является основным участником системы контроля качества митохондриального белка и удаления поврежденных или неправильно свернутых белков в митохондриях. матрица. Дефекты митохондриальных протеаз Clp были связаны с прогрессированием нейродегенеративных заболеваний, в то время как активация протеаз ClpP была вовлечена в предотвращение преждевременного старения. Рецессивные мутации CLPP недавно наблюдались у человека с вариантом Перро, что ассоциировалось с яичниковой недостаточностью и нейросенсорной тугоухостью, параллельно с задержкой роста. Клинический фенотип сопровождался накоплением ClpP-ассоциирующего партнерского шаперона ClpX, мтРНК и воспалительных факторов. Патологическая причина заболевания, вероятно, связана с недостаточным клиренсом митохондриальных компонентов и разрушением воспалительной ткани.

См. Также


Последняя правка сделана 2021-06-08 15:15:35
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте