АТФ-зависимая протеолитическая субъединица протеазы Clp (ClpP)представляет собой фермент, который у человека кодируется CLPP ген. Этот белок является важным компонентом для образования белкового комплекса протеазы Clp (эндопептидаза Clp ).
Фермент ClpP представляет собой высококонсервативную сериновую протеазу, присутствующую во всех бактериальных, а также обнаруженную в митохондриях и хлоропластах эукариотических клеток. Мономер ClpP складывается в три субдомена: «ручка», глобулярная «голова» и N-концевой участок. Сам по себе ClpP может собираться в тетрадекамерный комплекс (14 членов) и образовывать закрытую протеолитическую камеру. Полностью собранный комплекс протеазы Clp имеет бочкообразную структуру, в которой два уложенных друг на друга кольца протеолитических субъединиц (ClpP или ClpQ) либо зажаты между двумя кольцами, либо одинарно покрыты одним кольцом субъединиц ATPase-активных шаперонов (ClpA, ClpC, ClpE). , ClpX или ClpY). ClpXP присутствует почти во всех бактериях, в то время как ClpA обнаруживается у грамотрицательных бактерий, ClpC - у грамположительных бактерий и цианобактерий. ClpAP, ClpXP и ClpYQ сосуществуют в E. Coli, в то время как у человека присутствует только комплекс ClpXP.
У бактерий было показано, что ClpP способен расщеплять полноразмерные белки, не будучи ассоциирован с ClpA, но деградация происходит гораздо медленнее. Полнофункциональная протеаза Clp требует участия. Эти шапероны ClpX распознают, разворачивают и переносят белковые субстраты в протеолитическое ядро, образованное тетрадекамером ClpP. Протеолитические сайты субъединиц ClpP содержат гидрофобные бороздки, которые привлекают субстрат и принимают каталитическую триаду Asp-His-Ser. У некоторых бактерий, таких как E. coli, белки, помеченные пептидом SsrA (ANDENYALAA), кодируемым тмРНК, перевариваются протеазами Clp.
Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству пептидаз S14 и гидролизует белки на небольшие пептиды в присутствии АТФ и магния. Белок транспортируется в митохондриальный матрикс и связан с внутренней митохондриальной мембраной.
Протеаза ClpP является основным участником системы контроля качества митохондриального белка и удаления поврежденных или неправильно свернутых белков в митохондриях. матрица. Дефекты митохондриальных протеаз Clp были связаны с прогрессированием нейродегенеративных заболеваний, в то время как активация протеаз ClpP была вовлечена в предотвращение преждевременного старения. Рецессивные мутации CLPP недавно наблюдались у человека с вариантом Перро, что ассоциировалось с яичниковой недостаточностью и нейросенсорной тугоухостью, параллельно с задержкой роста. Клинический фенотип сопровождался накоплением ClpP-ассоциирующего партнерского шаперона ClpX, мтРНК и воспалительных факторов. Патологическая причина заболевания, вероятно, связана с недостаточным клиренсом митохондриальных компонентов и разрушением воспалительной ткани.