A1CF

редактировать
A1CF
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы A1CF, ACF, ACF64, ACF65, APOBEC1CF, ASP, фактор дополнения APOBEC1
Внешние идентификаторыOMIM: 618199 MGI: 1917115 HomoloGene: 16363 GeneCards: A1CF
Расположение гена (человек)
Chr. хромосома 10 (человек)
полоса 10q11.23начало50,799,409 bp
конец50,885,675 bp
Экспрессия РНК паттерн
Дополнительные эталонные данные по экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

29974

69865

Ensembl

ENSG00000148584

ENSMUSG00000052595

UniProt

Q9NQ94

Q5YD48

RefSeq (mRNA)

NM_001081074
NM_001365078

RefSeq (белок)

NP_001074543
NP_001352007

Местоположение (UCSC)Chr 10: 50,8 - 50,89 Мб Chr 19: 31,87 - 31,95 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор комплементации APOBEC1- это белок, который у человека кодируется геном A1CF .

Содержание
  • 1 Ген
  • 2 Функция
  • 3 Взаимодействия
  • 4 Ссылки
  • 5 Внешние ссылки
  • 6 Дополнительная литература
Ген

Альтернативный сплайсинг происходит в этом локусе и трех Были описаны варианты полноразмерных транскриптов, кодирующие три различные изоформы. Наблюдался дополнительный сплайсинг, но полноразмерная природа этих вариантов не была определена.

Функция

млекопитающих аполипопротеин B мРНК подвергается сайту -специфическое дезаминирование C в U , которое опосредуется многокомпонентным ферментным комплексом, содержащим минимальное ядро, состоящее из APOBEC1 и фактора комплементации, кодируемого этим геном. Продукт гена имеет три неидентичных мотива распознавания РНК и принадлежит к семейству РНК-связывающих белков hnRNP R. Было высказано предположение, что этот фактор комплементации функционирует как РНК-связывающая субъединица и присоединяется к APOBEC1 для дезаминирования вышележащего цитидина. Исследования показывают, что этот белок также может участвовать в других событиях редактирования РНК или процессинга РНК.

Его делеция приводит к летальному исходу у мышей.

Взаимодействия

Было показано, что A1CF взаимодействовать с APOBEC1, CUGBP2 и SYNCRIP.

Ссылки
Внешние ссылки
Дополнительная литература


Последняя правка сделана 2021-06-07 18:32:25
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте